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Detecção e diversidade de genes envolvidos na ciclagem de nitrogênio em bactérias isoladas de manguezais

Processo: 08/55005-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de agosto de 2008
Vigência (Término): 31 de julho de 2009
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Itamar Soares de Melo
Beneficiário:Rute Rodrigues Mendes
Instituição-sede: Embrapa Meio-Ambiente. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). Jaguariúna , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:04/13910-6 - Biodiversidade e atividades funcionais de microrganismos de manguezais do estado de São Paulo, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Filogenia   Manguezais

Resumo

A particular combinação de condições ambientais, únicas neste sistema, faz dos manguezais um nicho de evolução de, espécies capazes de colonizar estes ambientes. Os manguezais compõem um bioma composto por espécies de plantas, animais, protozoários e microrganismos, que interagem neste ambiente, que tem como principal característica a interface entre o continente e o oceano em regiões intertropicais, conferindo condições únicas ambientais, principalmente em relação à salinidade, a composição por espécies vegetais e alterações sazonais na disponibilidade de nutrientes. Em manguezais, a comunidade microbiana é diversa e produtiva, tendo como principal função a ciclagem de nutrientes. No entanto, muito pouco se sabe da diversidade de grupos microbianos funcionais encontrados nos manguezais, principalmente no Brasil, onde este tema é ainda pouco explorado. Neste intuito, este projeto tem como objetivo identificar espécies bacterianas que possuem genes amoA, nirK, nirS, nifD e nifH, essenciais na ciclagem de nitrogênio neste ambiente. A detecção de Isolados portadores destes genes será realizada por meio de PCR, enquanto que a diversidade destas populações será acessada por meio do sequenciamento dos genes detectados bem como pela classificação destes isolados com base na seqüência dos genes ribossomais 16S RNAr. Os isolados utilizados são provenientes de amostras de sedimento e plantas de três diferentes manguezais do Estado de São Paulo. Desta maneira, as informações obtidas com o desenvolvimento deste projeto permitirá a identificação dos grupos bacterianos que atuam na ciclagem de nitrogênio neste ambiente. (AU)