Filogenia de "xanthomonas" baseada em marcadores moleculares especificos do genero.

• Processo: 01/04054-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Yoko Bomura Rosato
• Beneficiário: Tiago Henrique Nogueira Simoes
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Filogenia Xanthomonas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Filogenia | Rflp-Pcr | Xanthomonas

Resumo

Bactérias pertencentes a esse gênero apresentam grandes variedades genéticas o que contrasta com a pouca variabilidade fenotípica. Nos últimos anos o gênero tem sofrido profundas modificações taxonômicas as quais tem sido criticadas. Atualmente aceita-se 20 espécies genômicas determinadas por hibridização DNA:DNA. A relação filogenética entre as espécies foram estudadas com base em diferentes marcadores por Hauben et al. 1997, que usou um gene ribossomal 16S e por Gonçalves & Rosato(2000) que usaram espaçadores intergênicos 16S e 23S. Estes últimos puderam diferenciar 16 grupos filogenéticos distintos, 3 a mais que Hauben e colaboradores. No entanto um grande número de espécies genômicas não puderam ser distinguidas utilizando esses marcadores. O objetivo deste projeto é utilizar como marcadores/ para avaliar a relação filogenética, alguns genes comuns para espécies do gênero xanthomonas. Alguns desses genes são específicos do gênero como o da produção do pigmento xanthomonadina. Também são analisados genes de patogenicidade, avr e hrp, e de produção de goma xanthana. Para atingir tal objetivo pretende-se amplificar (RFLP-PCR) genes de todas as espécies de xanthomonas e obter um perfil de digestão com endonucleases de restrição. Esses dados serão usados para inferir a relação filogenética dentro do gênero xanthomonas e avaliar a atual posição taxonômica do gênero. (AU)