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Rotulação e extração de contornos de estruturas ramicadas

Processo: 10/00523-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2010
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2010
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Convênio/Acordo: STIC-AmSud
Pesquisador responsável:Roberto Marcondes Cesar Junior
Beneficiário:Marcel Santos Claro
Instituição-sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:05/00587-5 - Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações, AP.TEM
Assunto(s):Retina   Visão computacional

Resumo

A extração do contorno paramétrico de formas bidimensionais figura entre as principais abordagens em Visão Computacional para a caracterização daquelas. Características apropriadas podem ser obtidas a partir de contornos paramétricos mediante seu tratamento posterior usando o arcabouço da Teoria de Sinais, Análise de Fourier e Geometria Diferencial, entre outros. Em geral, para formas em que não há ocorrências de auto intersecção, o algoritmo de extração de contorno baseado no código da cadeia tem sido aplicado com sucesso. No entanto, o mesmo algoritmo não funciona para projeções bidimensionais de estruturas ramificadas tridimensionais, devido às ocorrências de auto intersecção, que restringem o acesso a regiões internas da forma, redundando em perda de informação necessária para precisa caracterização da complexidade da mesma. Durante o treinamento técnico FAPESP implementamos um software de código aberto que rotula os ramos e extrai o contorno paramétrico de neurônios baseado no método que foi desenvolvido por um mestrando do nosso grupo de pesquisa. Neste método é fundamental a correta identificação das sementes e classificação de cruzamentos. A reimplementação do método original não reproduziu todos os seus resultados, possivelmente por variações topológicas introduzidas nas formas pelo uso de bibliotecas diferentes, fazendo-se necessárias adaptações. Mesmo assim o método permitiu a extração de contorno para a maioria dos neurônios testados. Quando adaptamos o método para aplicação em vasos de retinas, outra estrutura de ramificação, esses problemas se mostraram mais relevante, apenas de uma pequena parcela das imagens testadas foi possível obter o contorno. Este projeto tratará da solução destas questões objetivando a robustez do método e a aplicação em outras estruturas ramificadas. (AU)

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