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Análise e Identificação de Redes Gênicas por meio de Técnicas de Análise de Sistemas Complexos e Teoria da Informação

Processo: 08/03052-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2008
Vigência (Término): 30 de junho de 2011
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
Pesquisador responsável:Roberto Marcondes Cesar Junior
Beneficiário:Evaldo Araújo de Oliveira Filho
Instituição-sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:05/00587-5 - Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Teoria da informação

Resumo

O objetivo do projeto é o estudo numérico das séries temporais referentes às medidas de expressão gênica em bioinformática, utilizando técnicas oriundas da Teoria do Caos, Física Estatística e Teoria da Informação. Em particular, estamos interessados em caracterizar a dinâmica dessas séries e fornecer novas medidas para a identificação de redes gênicas. A idéia é partir da análise padrão de séries temporais (retornos, sazonalidade, ...) e seguir pela análise do regime dinâmico (magnitude do comportamento caótico) para caracterização das medidas de expressão gênica. As informações adquiridas nessa etapa serão utilizadas na identificação de redes gênicas por meio de métodos naturais da Física Estatística (Sistemas Complexos) e Teoria da Informação.Além disso, também objetivamos o desenvolvimento profissional do bolsista envolvido, não apenas devido às publicações e possíveis patentes resultantes ou colaborações científicas. O fortalecimento profissional do bolsista será feito por meio da criação e ministração de cursos sobre Bioinformática, envolvendo os métodos estudados e criados, bem como pela orientação de estudantes em programas de iniciação científica e mestrado.

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