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Análise da diversidade genética em duas famílias de camarões cultivados Litopenaeus vannamei utilizando marcadores microssatélites obtidos de regiões arbitrárias e expressas do genoma desta espécie

Processo: 07/00296-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de julho de 2007
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Patrícia Domingues de Freitas
Beneficiário:Josiane Lilian dos Santos Schiavinato
Instituição-sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Litopenaeus vannamei   Camarão   Diversidade genética   Repetições de microssatélites   Carcinicultura

Resumo

Na aqüicultura de camarões a utilização de marcadores moleculares, principalmente os microssatélites, tem auxiliado o desenvolvimento de programas de monitoramento e melhoramento genético dos estoques cultivados, permitindo acessar informações sobre a distribuição da variabilidade genética em populações de cativeiro e populações selvagens. Em geral, estas pesquisas estão mostrando que o acompanhamento do nível de variabilidade genética, através do uso desses marcadores, é de grande importância para o manejo controlado e conseqüente retorno em investimentos. Dentro deste contexto, o presente projeto tem como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética em dois estoques de camarões cultivados da espécie Litopenaeus vannamei, os quais estão sendo submetidos a um processo de seleção para características economicamente importantes, através da utilização de marcadores microssatélites. Os locos utilizados no presente trabalho foram previamente isolados através de data mining em seqüências expressas (ESTs) do genoma desta importante espécie de camarão. O processo de validação destes locos já se iniciou, sendo que de dez locos testados, até o momento, cerca de 50% deles apresentou padrão de amplificação satisfatório. As amostras de DNA utilizados neste trabalho são provenientes de exemplares pertencentes ao Laboratório de Larvicultura Aquatec (Rio Grande do Norte). Amostras de tecido muscular de 30 indivíduos de duas linhagens F2 divergentes, fixadas e submetidas à extração de DNA segundo Aljanabi & Martinez (1997). As reações de PCR foram inicialmente realizadas em termociclador de gradiente para estabelecimento da temperatura de anelamento ideal. Posteriormente, as reações de PCR foram realizadas em um maior número amostral, utilizando-se fluoróforos específicos para análise em sequenciador A genotipagem destes locos e a determinação do seu grau de polimorfismo será importante para avaliar os níveis de variabilidade genética em duas linhagens deste importante camarão cultivado.