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Estudos cinéticos e funcionais das proteínas humanas da família septina

Processo: 08/58316-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de maio de 2009
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Richard Charles Garratt
Beneficiário:Napoleão Fonseca Valadares
Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/57910-0 - Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química Medicinal em Doenças Infecciosas - INBEQMeDI, AP.TEM
Assunto(s):Septinas   Cinética

Resumo

O projeto de pesquisa aqui apresentado tem como objetivo o emprego da técnica de ressonância plasmônica de superfície (SPR) para a determinação das afinidades das interações entre diferentes septinas, seus domínios isolados e ainda entre septinas e outras proteínas que interagem com septinas, como a Borg e a alfa-synucleina, que já estão disponíveis para análise no CBME. As septinas estão envolvidas em uma série de funções celulares como citocinese, exocitose e o tráfego vesicular, e estudos recentes mostram seu envolvimento em diversos processos patológicos como câncer no ovário, próstata, melanoma, mama, tumores cerebrais, doenças neurodegenerativas e, mais recentemente, em processos inflamatórios. As septinas são associadas à membrana celular sob forma de suporte e barreiras para demarcar compartimentos locais como a estabilização do sítio de divisão citoplasmático celular seguindo a divisão do núcleo da célula, e para isso formam complexos hetero-oligoméricos agrupando-se na forma de filamentos. O CBME do IFSC atualmente trabalha com mais de 30 construções diferentes de septinas, desde domínios isolados até septinas inteiras, e a caracterização cinética das interações entre essas espécies, inédita na literatura, possibilitará uma melhor compreensão de seus padrões de interação e permitirá o direcionamento dos esforços de cristalização para os complexos de maior afinidade. Na literatura, a tecnologia de SPR tem sido utilizada para caracterizar uma enorme variedade de interações do tipo proteína-proteína, e as análises em tempo real, dispensando marcadores e utilizando baixa quantidade de amostras tornam a técnica de SPR ideal para a análise de interações entre septinas. O pesquisador tem comprovada experiência com SPR, tendo realizado parte de seu doutorado na ROCHE, Califórnia, onde trabalhou diretamente com essa técnica, além de já a ter utilizado para a determinação das taxas cinéticas e afinidades de diversas proteínas no CBME/IFSC. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MACEDO, JOCI N. A.; VALADARES, NAPOLEAO F.; MARQUES, IVO A.; FERREIRA, FREDERICO M.; DAMALIO, JULIO C. P.; PEREIRA, HUMBERTO M.; GARRATT, RICHARD C.; ARAUJO, ANA P. U. The structure and properties of septin 3: a possible missing link in septin filament formation. Biochemical Journal, v. 450, n. 1, p. 95-105, FEB 15 2013. Citações Web of Science: 19.
VALADARES, NAPOLEAO F.; DE OLIVEIRA-SILVA, RODRIGO; CAVINI, ITALO A.; MARQUES, IVO DE ALMEIDA; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; SOARES-COSTA, ANDREA; HENRIQUE-SILVA, FLAVIO; KALBITZER, HANS R.; MUNTE, CLAUDIA E.; GARRATT, RICHARD C. X-ray crystallography and NMR studies of domain-swapped canecystatin-1. FEBS Journal, v. 280, n. 4, p. 1028-1038, FEB 2013. Citações Web of Science: 9.
SALUM, LIVIA BARROS; VALADARES, NAPOLEAO FONSECA. Fragment-guided approach to incorporating structural information into a CoMFA study: BACE-1 as an example. Journal of Computer-Aided Molecular Design, v. 24, n. 10, p. 803-817, OCT 2010. Citações Web of Science: 9.
VALADARES, NAPOLEAO F.; DELLAMANO, MARCIA; SOARES-COSTA, ANDREA; HENRIQUE-SILVA, FLAVIO; GARRATT, RICHARD C. Molecular determinants of improved cathepsin B inhibition by new cystatins obtained by DNA shuffling. BMC STRUCTURAL BIOLOGY, v. 10, SEP 30 2010. Citações Web of Science: 4.
VALADARES, NAPOLEAO F.; SALUM, LIVIA B.; POLIKARPOV, IGOR; ANDRICOPULO, ADRIANO D.; GARRATT, RICHARD C. Role of Halogen Bonds in Thyroid Hormone Receptor Selectivity: Pharmacophore-Based 3D-QSSR Studies. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 49, n. 11, p. 2606-2616, NOV 2009. Citações Web of Science: 35.

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