Phage Orthologous clusters: um banco de dados de informações de fagos
- Auxílios pontuais (curta duração)
| Processo: | 02/14124-9 |
| Linha de fomento: | Bolsas no Brasil - Iniciação Científica |
| Vigência (Início): | 01 de março de 2003 |
| Vigência (Término): | 30 de novembro de 2003 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular |
| Pesquisador responsável: | Paulo Sergio Lopes de Oliveira |
| Beneficiário: | Jeryes Farah |
| Instituição-sede: | Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Transcriptoma Biologia computacional Java Processamento alternativo Interface gráfica |
Resumo A pós-genômica surgiu como um próspero campo para que as milhares de seqüências provenientes dos projetos genoma tenham o seu significado biológico elucidado. Neste contexto, o entendimento da diversidade dos transcriptomas originados a partir dos genomas desvendados mostra um potencial extremamente animador. Um dos mecanismos descritos na literatura como capaz de gerar surpreendente diversidade protéica é o splicing alternativo. Diferentes maneiras são encontradas nos organismos para que uma isoforma seja constituída: exons podem ser retirados, introns podem ser mantidos e sítios crípticos doadores e aceitadores de splicing podem ser usados na concepção do transcrito. A quantidade de dados atual torna a análise manual destes eventos cada vez mais inviável, surgindo a necessidade do desenvolvimento de ferramentas para visualização gráfica para ajudar no processo de análise dos resultados obtidos dos processos de mineração de dados. Esse projeto visa a criação de uma base de dados local para o armazenamento de RN As transcritos (RNAs mensageiros completos e ESTs - Expressed Sequenced Tags), gerados pelo processo de splicing alternativo e a construção de uma interface gráfica para a visualização dos resultados, baseada em tecnologias amplamente utilizadas na Internet, como JAVA, HTML (Hypertext Markup Language), JavaScript e CGI (Common Gateway Interface). (AU) | |