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Desenvolvimento de um sistema para separação de proteínas por cromatografia líquida bidimensional e acoplamento em linha a LC-MS

Processo: 02/08409-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2002
Vigência (Término): 31 de outubro de 2005
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Analítica
Pesquisador responsável:Fernando Mauro Lanças
Beneficiário:José Carlos Rodrigues Silva
Instituição-sede: Instituto de Química de São Carlos (IQSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Cromatografia líquida de alta pressão   Cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas   Proteínas   Proteoma

Resumo

Atualmente, a técnica predominantemente utilizada na análise de proteínas é a eletroforese bidimensional em placa de gel acoplada a detector de massas (2 DE/MS). Entretanto, ao examinar de forma minuciosa esta técnica pode ser observado que a mesma não pode ser considerada como definitiva e verdadeiramente global, uma vez que determinadas classes específicas de proteínas são excluídas ou sub-representadas em 2 DE gel (proteínas muito ácidas, muito básicas, excessivamente grandes ou excessivamente pequenas, etc.). Além disso, foi demonstrado que a abordagem 2 DE/MS é incapaz de detectar proteínas de baixa abundância sem enriquecimento prévio à separação na placa de gel. Resumindo, segundo vários autores, 2 DE/MS não serve como tecnologia base para a análise global de proteínas. Tendo em vista o supra mencionado, o presente trabalho visa apresentar uma estratégia alternativa a análise de proteínas pelo desenvolvimento de um sistema, e acessórios, para cromatografia líquida bidimensional apropriados ao acoplamento com detectores de massas, tal sistema será capaz de promover um pré-fracionamento e a concentração dos peptídeos menos abundantes nas amostras analisadas, o que contribuirá seguramente para a melhoria dos resultados analíticos obtidos e para a obtenção de uma ferramenta versátil pára análise do proteoma. (AU)