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Análise de estruturas conformacionais de complexos de DNA e RNA homopoliméricos

Processo: 06/55317-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2007
Vigência (Término): 30 de junho de 2007
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Eduardo Gorab
Beneficiário:Laura Silveira Drummond Moreira
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Heterocromatina   Cromossomos   Rhynchosciara   Conformação proteica   Polinucleotídeos

Resumo

Polinucleotídeos sintéticos têm sido empregados na formação de complexos de ácidos nucléicos de interesse para o estudo das propriedades das diferentes conformações destes complexos. Duplas ou triplas hélices podem ser formadas por DNA, RNAou também moléculas hibridas contendo os dois tipos de ácidos nucléicos. Um procedimento alternativo de detecção da dupla hélice híbrida DNA-RNA envolve o uso de sondas de RNA não marcado e de um anticorpo que reconhece especificamente a conformação hibrida DNA-RNA. Seu emprego na detecção de hibridação com sondas de polinucleotídeos sintéticos em cromossomos politênicos de dípteros revelou que RNA poli-A híbrida em regiões cromossômicas discretas de espécies de Rhynchosciara (Diptera: Sciaridae), indicando a existência de regiões genômicas anormalmente enriquecidas em DNA homopolimérico dA/dT. Entretanto, RNA poli-U foi incapaz de reproduzir os resultados obtidos com a sonda de poli-rA nestas espécies. O objetivo do projeto será o de desenvolver metodologias de análise da formação e detecção de complexos entre DNA e RNA homopoliméricos em preparações cromossômicas, em géis de agarose e em membranas. Estas técnicas visarão compreender o fenômeno da impossibilidade de detecção da conformação de dupla hélice híbrida DNA-RNA quando RNAs homopoliméricos de composição específica são empregados na formação de complexos com DNA. (AU)