Análises de integração genética e de redes regulatórias para detectar genes associ...
Redes de coexpressão gênica e variantes de regiões regulatórias do tecido hepático...
Processo: | 09/09116-6 |
Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
Data de Início da vigência: | 01 de outubro de 2009 |
Data de Término da vigência: | 30 de setembro de 2011 |
Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular |
Acordo de Cooperação: | FAPEMIG |
Pesquisador responsável: | Glaucia Mendes Souza |
Beneficiário: | Roberta Alvares Campos |
Instituição Sede: | Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
Vinculado ao auxílio: | 08/52146-0 - Sugarcane signaling and regulatory networks, AP.BIOEN.TEM |
Assunto(s): | Melhoramento genético Transcriptoma |
Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Melhoramento genético | proteina kinase | Transcriptoma | Biologia Molecular |
Resumo REDES REGULATÓRIAS DA CANA-DE-AÇÚCAREste projeto foca estudos de regulação gênica e visa a geração deferramentas que permitam abordagens da Biologia Sistêmica em cana-de-açúcare a identificação de redes regulatórias. Como ponto de partida escolhemoscaracterizar dois tratos agronômicos de interesse desta cultura: o teor desacarose e a resposta à seca. Pretendemos estudar categorias gênicas comconhecido papel regulatório (Fatores de Transcrição, Proteínas Quinases eFosfatases), aprofundar estudos do Transcriptoma, produzir plantastransgênicas para genes de interesse e desenvolver ferramentas debioinformática e bancos de dados integrando os vários níveis de informação.Identificaremos os alvos de TFs utilizando a técnica de ChIP-HTS e clonandopromotores. Os resultados terão consequëncias diretas múltiplas nosprogramas de melhoramento que frequentemente selecionam mudanças nos CREs eTFs na busca de genótipos mais adaptados ao ambiente e com maior performanceagronômica. As Proteínas Quinases atuam em cascatas de sinalização derespostas a estímulos ambientais e nossos dados apontam para um papelpredominante das PKs na regulação do teor de sacarose e resposta à seca.Para identificar novos genes associados a brix e seca caracterizaremos otranscriptoma de genótipos e cultivares contrastantes para estes tratosutilizando chips de oligonucleotídeos. Genes de interesse serão entãoavaliados quanto à sua função pela geração e análise de plantastransgênicas. Para integrar o grande conjunto de dados públicos e geradospelo projeto uma infra-estrutura computacional robusta será desenvolvida. Obanco de dados SUCEST-FUN integrará dados do SUCEST, promotores, CREs, dadosde expressão e a caracterização agronômica, fisiológica e bioquímica decultivares da cana. Em paralelo também desenvolveremos o banco de dadoGRASSIUS para o estabelecimento das redes regulatórias de cana, arroz, milhoe sorgo. (AU) | |
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