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Identificação de componentes envolvidos na fosforilação reversível de proteínas no genoma da cana-de-açúcar

Processo: 01/06922-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de outubro de 2001
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2002
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Aline Maria da Silva
Beneficiário:Ana Carolina Quirino Simoes
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   Transdução de sinais   Fosforilação   Cana-de-açúcar   Genomas

Resumo

Neste projeto pretendemos identificar e analisar os componentes envolvidos na fosforilação reversível de proteínas presentes no banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) de cana de açúcar. Este banco contém mais de 250.000 seqüências das extremidades 5' e 3's de de cDNAs da cana de açúcar e é resultado do projeto SUCEST (Sugar Cane ESTs) patrocinado pela FAPESP. cDNAs codificadores de proteínas quinases, proteínas fosfatases além de outras proteínas que modulam a fosforilação reversível serão identificados e comparados com genes de outros organismos, principalmente plantas, com o objetivo, de estabelecermos um catálogo destes genes para a cana de açúcar. Quando possível os cDNAs identificados serão associados a vias de transdução de sinal conhecidas que regulam diferentes processos celulares. Pretendemos realizar uma estimativa da abundância destes cDNAs (ESTs) nos diferentes tecidos da planta e também do número de genes alelos e/ou parálogos. Estes objetivos são parte do projeto de data mining intitulado "Identificação dos componentes de transdução de sinal do genoma da cana de açúcar" coordenado pelas Profas. Gláucia Mendes Souza e Aline Maria da Silva (auxílio FAPESP 00/07425-7). (AU)