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Analise de interacoes proteina-proteina envolvendo fatores sigma de rna polimerase do fitopatogeno xanthomonas axonopodis pv. citris.

Processo: 03/01579-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de junho de 2003
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2003
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Shaker Chuck Farah
Beneficiário:Maria Claudia Pereda Rosa
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:00/11573-1 - Identification and structure-function analysis of protein-protein interactions in the plant pathogen Xanthomonas axonopodis pv citri, AP.TEM
Assunto(s):Interação proteína-proteína

Resumo

Neste projeto de iniciação científica, o objetivo principal é a investigação de interações proteína-proteína que ocorrem no fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri (Xac). Estamos particularmente interessados em identificar as interações proteína-proteína que mediam as vias sinalizadoras que atingem os vários fatores sigma da RNA polimerase de Xac. Uma biblioteca de DNA genômico de Xac, clonadas no vetor com domínio de ativação, foi gerada a partir do DNA genômico nebulizado aleatoriamente. Cerca de 2 milhões de clones independentes já foram gerados e amplificados (trabalho constante nos relatórios dos alunos de doutorado Marcos Castanheira Alegria e Cássia Docena). As ORFs ("open reading frames") dos genes que codificam as proteínas de interesse serão selecionadas in silico, amplificadas por PCR e clonadas no vetor POBD (UETZ et al; 2000) para uso em ensaios de interação proteína-proteína em levedura. Vale ressaltar ainda, que este projeto e parte integrante do Projeto Temático de Genoma Funcional: "Identificação e análise Funcional e Estrutural das Interações Proteína-Proteína no Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri", da FAPESP dos Profs. Drs. Shaker Chuck Farah (coordenador, IQ-USP), Ana Cláudia Rasera da Silva (IQ. USP) e Carlos H. I. Ramos (LNLS. Campinas). (AU)

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