Genômica mitocondrial e filogenia molecular do grupo Schizophora (Diptera: Brachycera) utilizando sequenciamento de nova geração

• Processo: 08/56769-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Ana Maria Lima de Azeredo-Espin
• Beneficiário: Ana Carolina Martins Junqueira
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Diptera DNA mitocondrial Filogenia Genômica Pirosequenciamento Sequenciamento de nova geração Schizophora
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diptera | Filogenia Molecular | Genomica Mitocondrial | Mtdna | Pirosequenciamento 454 | Schizophora

Resumo

O mtDNA animal é uma molécula duplo-fita circular com múltiplas cópias, 15 a 20 kb e herança uniparental materna. Com 37 genes, o mtDNA possui tRNAs, rRNAs, genes codificadores de proteína e a região controle (RC) com função regulatória disponibilizando um conjunto de dados conciso para a reconstrução filogenética, além de permitir a formação de subconjuntos que podem resolver relações em diferentes níveis taxonômicos. A ordem Diptera é muito diversa, com cerca de 12% das espécies animais conhecidas. Dentre as questões controversas sobre a filogenia de dípteros, uma das mais intrigantes reside nas relações de Schizophora, que compreende a maior radiação de insetos do período Terciário. O sequenciamento do genoma mitocondrial de dez espécies deste grupo possibilitará reconstruir as relações entre superfamílias e famílias, além de permitir uma abordagem molecular acerca da monofilia dos grupos Calyptratae e Acalyptratae que são as duas subdivisões clássicas de Schizophora. As sequências geradas, associadas aos mtDNAs de dípteros disponíveis ainda permitirão expandir as análises comparativas, assim como investigar a duplicação do tRNAIIe encontrada nas famílias Cailiphoridae e Muscidae, a fim de determinar se a RC do mtDNA é um "hot spot" para rearranjos. A utilização da tecnologia 454 de pirosequenciamento propiciará a obtenção de sequências em larga escala, fazendo deste o primeiro projeto a avaliar o sequenciamento massivo e paralelo de mtDNAs de insetos no mundo. A genômica mitocondrial produzirá informações valiosas para o entendimento da evolução de organismos e seus genomas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

JUNQUEIRA, ANA CAROLINA M.; AZEREDO-ESPIN, ANA MARIA L.; PAULO, DANIEL F.; MARINHO, MARCO ANTONIO T.; TOMSHO, LYNN P.; DRAUTZ-MOSES, DANIELA I.; PURBOJATI, RIKKY W.; RATAN, AAKROSH; SCHUSTER, STEPHAN C.. Large-scale mitogenomics enables insights into Schizophora (Diptera) radiation and population diversity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, FEB 25 2016. (09/51723-7, 12/23200-2, 08/56769-2, 10/09961-5)

MARINHO, M. A. T.; JUNQUEIRA, A. C. M.; PAULO, D. F.; ESPOSITO, M. C.; VILLET, M. H.; AZEREDO-ESPIN, A. M. L.. Molecular phylogenetics of Oestroidea (Diptera: Calyptratae) with emphasis on Calliphoridae: Insights into the inter-familial relationships and additional evidence for paraphyly among blowflies. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 65, n. 3, p. 840-854, DEC 2012. (08/56769-2, 06/61217-3)

MARINHO, M. A. T.; JUNQUEIRA, A. C. M.; AZEREDO-ESPIN, A. M. L.. Evaluation of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) as a molecular marker for phylogenetic inference using sequence and secondary structure information in blow flies (Diptera: Calliphoridae). Genetica, v. 139, n. 9, p. 1189-1207, 2011. (08/56769-2, 05/50100-5, 06/61217-3)