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Estudos estruturais e funcionais de proteínas periplasmáticas ligadoras e sua interação com os componentes de membrana de sistemas de transporte do tipo ABC de Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xanthomonas campestris pv. campestris

Processo: 10/04883-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de maio de 2010
Vigência (Término): 30 de junho de 2011
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Andrea Balan Fernandes
Beneficiário:Carolina Santacruz Perez
Instituição-sede: Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS). Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Simulação de dinâmica molecular   Estrutura   Cristalografia de proteínas

Resumo

O estudo dos genomas das bactérias fitopatogênicas Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) e Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) revelou que 4% dos mesmos codifica proteínas da família de transportadores ABC e que ambas as bactérias apesar de filogeneticamente próximas, apresentam diferenças significativas em relação aos tipos de transportadores. A caracterização destes sistemas é de grande importância para a compreensão de muitos aspectos funcionais e fisiológicos de organismos, como também para o desenvolvimento de inibidores de transporte que afetem o crescimento bacteriano, como fármacos de interesse. Com enfoque na área de Biologia Estrutural de Proteínas, o nosso grupo vem trabalhando com a caracterização estrutural e funcional dos componentes periplasmáticos de Xac, responsáveis pela afinidade e especificidade dos sistemas de transporte, como também com alguns componentes de membrana utilizando ferramentas de Modelagem Molecular. Neste projeto, pretende-se dar continuidade a este trabalho incluindo diversas proteínas periplasmáticas de transportadores presentes em Xac e Xcc. Em Xac, muito pouco se conhece sobre o mecanismo de interação entre a proteína periplasmática e o componente de membrana. Este trabalho busca propor/identificar as possíveis regiões de interação entre os mesmos, através da resolução das estruturas cristalográficas de proteínas periplasmáticas e da modelagem molecular das suas respectivas permeases. A modelagem e classificação estrutural/funcional de sistemas de transporte ABC das bactérias Xac e Xcc será de profundo interesse para estudos sobre função, transporte, especificidade, patogênese e infectividade das bactérias no seu hospedeiro.

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