Amplificação do genoma mitocondrial completo de espécies da sub-ordem Brachycera (Diptera: Hexapoda) por PCR de longa extensão: perspectivas para a filogenia molecular

• Processo: 10/09961-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Ana Carolina Martins Junqueira
• Beneficiário: Daniel Fernando Paulo
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Diptera Brachycera Filogenia Amplificação de genes DNA mitocondrial PCR de longa extensão
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Brachycera | Diptera | long-PCR | Mitogenômica | mtDNA | Mitogenômica e Filogenia Molecular

Resumo

A ordem Diptera representa cerca de 12% da diversidade animal descrita. Dentre as questões controversas sobre a filogenia de dípteros, uma das mais intrigantes reside nas relações de Schizophora, um clado da sub-ordem Brachycera que inclui dípteros muscóideos, consistindo na maior radiação de insetos do período Terciário. Até o momento, estudos moleculares não endereçaram apropriadamente as relações evolutivas dos subgrupos de Brachycera. Inserido em um estudo mais amplo, este projeto tem como objetivo padronizar e otimizar reações de PCR de longa extensão (long-PCR) do DNA mitocondrial (mtDNA) para uma ampla diversidade de dípteros muscóideos. Através do long-PCR pretende-se amplificar o genoma mitocondrial completo em poucos amplicons, associando, futuramente, esta técnica ao pirosequenciamento em plataforma 454. Esta abordagem pode colaborar para o futuro da mitogenômica de insetos em grande escala. Em primeira instância, pretende-se criar um banco de mtDNA para espécies de dípteros, permitindo a associação da informação genética a dados morfológicos, ecológicos e geográficos de amostras coletadas e espécimes preservados em coleções entomológicas. Futuramente, como continuidade deste projeto, as sequências completas obtidas serão empregadas na filogenia e evolução molecular, permitindo a análise dos genes mitocondriais num contexto comparativo amplo. Propõe-se, ainda, a amplificação por PCR convencional e sequenciamento da subunidade mitocondrial 16S do rRNA (rrnl) de amostras de Brachycera selecionadas, visando a caracterização deste marcador para análises de divergências antigas em Diptera. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

JUNQUEIRA, ANA CAROLINA M.; AZEREDO-ESPIN, ANA MARIA L.; PAULO, DANIEL F.; MARINHO, MARCO ANTONIO T.; TOMSHO, LYNN P.; DRAUTZ-MOSES, DANIELA I.; PURBOJATI, RIKKY W.; RATAN, AAKROSH; SCHUSTER, STEPHAN C.. Large-scale mitogenomics enables insights into Schizophora (Diptera) radiation and population diversity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, FEB 25 2016. (09/51723-7, 12/23200-2, 08/56769-2, 10/09961-5)