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Projeto Genoma: Xanthomonas axonopodis pv.citri

Processo: 99/10868-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2000
Vigência (Término): 31 de agosto de 2003
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Nilce Maria Martinez-Rossi
Beneficiário:Jeny Rachid Cursino dos Santos
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Xanthomonas axonopodis   Fitopatógenos   Cancro (doença de planta)

Resumo

O Estado de São Paulo é um importante polo mundial produtor de laranja. Atualmente a produção de citrus vê-se ameaçada pela infecção da bactéria X.axonopodis pv. citri que infecta a planta resultando na queda de folhas, frutos e ramos com conseqüente prejuízo para o produtor e também para a economia nacional. Com o objetivo global do "PROJETO GENOMA-Xanthomonas citri" de compreender os aspectos biológicos envolvidos na interação entre este fitopatógeno e seu hospedeiro, assim como os fatores que conferem resistência ou susceptibilidade à infecção, será realizado inicialmente o seqüenciamento de todo o genoma da X.axonopodis pv. citri. Fazendo parte de um dos Laboratórios de Seqüência associados ao Projeto FAPESP (Laboratório RN), temos como objetivo atingir a meta pré-estabelecida de 3000 "shotgun read", com pelo menos 400 bases de comprimento e com qualidade mínima de 20 e na segunda etapa, seqüenciar as bibliotecas de cosmídeos que completarão os "gaps" de leitura da primeira fase. Até o final, serão seqüenciadas por nosso laboratório 250.000 bases. Em paralelo, serão investigadas homologias existentes entre seqüências geradas pelo programa e estabelecer relações entre os genes já conhecidos envolvidos com a resistência a inibidores químicos em Xanthomonas e outros patógenos bacterianos. (AU)