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Bioinformática para anotação do genoma do fitopatógeno (Leifsonia xyli - subsp. xyli)

Processo: 01/01122-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de julho de 2001
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2001
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biologia Geral
Pesquisador responsável:Joao Paulo Fumio Whitaker Kitajima
Beneficiário:Anderson Belgamo
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Cana-de-açúcar   Biologia computacional

Resumo

Este projeto consiste em instalar e manter um sistema local de informações para os dados de anotação do genoma da bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli, fitopatógeno da cana-de-açúcar. A partir de um pacote mínimo já disponível no LBI (Laboratório de Bioinformática/IC/UNICAMP), o bolsista acompanhará a finalização da montagem do genoma (estimado em cerca de 3.000.000 pares de bases) e também a anotação do mesmo. Tudo isto será disponibilizado em um website do genoma no Departamento de Fitopatologia da ESALQ. A parte de seqüenciamento será realizado pelos participantes do programa AEG (Agrionomical and Environmental Genomes). (AU)