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Mapeamento de sequências repetitivas em Medicago truncatula: construção de um modelo cromossômico e fechamentos de gaps centroméricos

Processo: 10/07207-1
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Novas Fronteiras
Vigência (Início): 15 de setembro de 2010
Vigência (Término): 14 de setembro de 2011
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia
Pesquisador responsável:Mateus Mondin
Beneficiário:Mateus Mondin
Anfitrião: John Seymour Heslop-Harrison
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Leicester, Inglaterra  
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal   Genômica comparativa   Citogenética vegetal   Sequências repetitivas de ácido nucleico   Heterocromatina   Medicago truncatula

Resumo

Os programas de sequenciamento, atualmente, evitam ou não contemplam regiões de DNAs repetitivos, principalmente aqueles organizados in tandem, por não permitirem um caminhamento cromossômico preciso. Entretanto, a técnica de hibridação molecular in situ fluorescente (FISH) tem se mostrado uma poderosa ferramenta para o fechamento de gaps de regiões de DNA repetitivo, uma vez que o tamanho e a intensidade dos sinais das sondas refletem diretamente o tamanho do arranjo em uma determinada região cromossômica. Assim, a citogenética tem sido colocada nos últimos anos em posição de destaque dentro dos programas de sequenciamento de genomas completos. A espécie Medicago truncatula, com 2n=2x=16 (1C=466 Mpb), é a planta modelo para estudos genéticos dentro da família Leguminosae, por ter um genoma relativamente pequeno, por ser cultivada como forrageira, ser filogenéticamente próxima a espécie cultivada M. sativa e por sua proximidade com outras espécies de importância agronômica. O sequenciamento completo do genoma desta espécie modelo encontra-se em fase final, entretanto, pouco foi explorado com relação às sequências de DNAs repetitivos e os gaps dos arranjos in tandem pericentroméricos não serão concluídos. O Consórcio de Sequenciamento do Genoma de Medicago truncatula, considera a citogenética como etapa e ferramenta crucial para o fechamento dos gaps e para o entendimento da organização do genoma.Este projeto tem como principal objetivo explorar as sequências repetitivas encontradas no genoma de Medicago truncatula, principalmente através do mapeamento via FISH nos cromossomos, contribuindo para o desenvolvimento de um modelo cromossômico e para o fechamento dos gaps das regiões heterocromáticas pericentroméricas. (AU)