Estrutura cristalográfica da N-acetilglicosamina 6-fosfato desacetilase, uma proteína da via catabólica de açúcares aminados da Escherichia coli.

• Processo: 99/12029-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2000
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2004
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Frederico Moraes Ferreira
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Derivados Isomorfos | Difracao De Raios-X | Mir

Resumo

O objetivo deste projeto é determinar a estrutura tridimensional da N-acetilglicosamina 6-fofato desacetilase e relacionar essa estrutura às funções desempenhadas pela mesma, propondo um mecanismo de catálise enzimático. Esta proteína é uma enzima da via catabólica de açúcares aminados da bactéria Escherichia coli, que foi purificada a partir de cepas (linhagem K12) super produtoras e cristalizada pela técnica de difusão de vapor usando fosfato como precipitante. Experimento de difração de raios-X mostraram que os cristais pertencem ao sistema cristalino ortorrômbico com grupo espacial P21212. Os parâmetros de cela são a = 82,09(2)A, b = 114,50(1) à e c = 80,17(2) A. A resolução máxima é 1,8 A. O conteúdo da unidade assimétrica provavelmente é um dímero produzindo um coeficiente de Matthews de 2,30 Á3 Da-1. Pretende-se neste projeto, dar continuidade ao trabalho até então desenvolvido. Alinhamentos de seqüência da desacetilase com outras proteínas de estrutura tridimensional conhecida não mostraram homologia significativa. Dada a inexistência de um modelo inicial de fases para substituição molecular, o caminho natural é a obtenção de derivados isomorfos de átomos pesados pára derivação das fases por substituição isomórfica múltipla ou dispersão anômala a múltiplos comprimentos de onda. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FERREIRA, Frederico Moraes. Estrutura cristalográfica da N-acetilglicosamina 6-fosfato desacetilase de Escherichia coli. 2004. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.