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Xanthomonas axonopodis pv citri: análise do metabolismo intermediário e de ferro por microarrays de DNA

Processo: 02/07461-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2003
Vigência (Término): 30 de junho de 2006
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Aline Maria da Silva
Beneficiário:Leandro Marcio Moreira
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil

Resumo

Pretendemos analisar a expressão global dos genes de Xanthomonas citri por técnica de microarray, dando ênfase à culturas submetida à diferentes concentrações de ferro e açúcares. Desta forma teremos a possibilidade de verificarmos: i) à regulação do gene Fur (mapeando genes que apresentam Fur box), ii) os fatores de regulação de patogenicidade (genes Rpf's) e biossíntese de EPS (goma xantana); iii) o metabolismo energético de açúcares, provenientes da degradação de poli e oligossacarídeos, que poderia ser relacionado ao processo infeccioso desta bactéria; iv) a relação com os genes de virulência, como por exemplo hemolisinas e hemaglutininas, no processo de competitividade pelo Fe disperso no ambiente (antagonismo bacteriano); v) a possível via de biossíntese de sideróforos não detectadas até o momento; vi) e até mesmo comparar mutantes de Xanthomonas para um dos complexos citados acima (este item depende da criação de mutantes por outros membros de nosso laboratório). O interesse ao ferro e às vias de metabolismo intermediário, ligam-se a recentes comparações entre os genomas de Xanthomonas citri e Xylella fastidiosa (feitas por nós mesmos), que revelaram uma rica maquinaria de degradação de parede celular associada a uma extensa gama de receptores de compostos ferro quelatados em Xanthomonas não observada em Xylella fastidiosa, e que também poderiam se associar à expressão dos genes Rpf e de goma durante o processo infeccioso e patogênico. (AU)