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Análise estrutural e comparativa do genoma de (Leifsonia xyli) "subsp. xyli"

Processo: 01/02461-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de junho de 2001
Vigência (Término): 31 de maio de 2003
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Luis Eduardo Aranha Camargo
Beneficiário:Paulo Roberto Gagliardi
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Análise de sequência de DNA   Raquitismo das soqueiras   Genômica comparativa   Eletroforese em gel de campo pulsado

Resumo

O presente estudo visa a obtenção de um mapa físico do genoma de Lxx, através da técnica de eletroforese de campo pulsado (PFGE), com vistas a corroborar o resultado do projeto de seqüenciamento genômico desta bactéria atualmente sendo realizado pelo Grupo de Seqüenciamento de Genomas Agronômicos e do Meio-Ambiente (AEG) da rede ONSA-FAPESP. Em adição ao mapa físico e com o mesmo objetivo, o número de seqüências repetidas e de genes ribossomais identificados pelo projeto genoma será confirmado por meio de digestão enzimática do DNA genômico de Lxx e hibridização com sondas apropriadas. Um outro objetivo deste estudo é o de estabelecer comparações entre o genoma da estirpe tipo de Lxx que está sendo seqüenciada e de outros isolados, tanto de Lxx como de Leifsonia xyli subsp. cynodontis (Lxc), uma subespécie muito próxima a Lxx que coloniza os vasos xilemáticos da cana-de-açúcar mas não demonstra patogenicidade. As comparações serão efetuadas por meio de hibridizações de DNA genômico com seqüências repetidas de Lxx e Lxc bem como análise por meio de rep-PCR. (AU)

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
GAGLIARDI, Paulo Roberto. Análise estrutural e comparativa do genoma de Leifsonia xyli subsp. xyli.. 2003. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Piracicaba.

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