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Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano

Processo: 02/02297-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2003
Vigência (Término): 10 de abril de 2006
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Paulo Sergio Lopes de Oliveira
Beneficiário:Fabio Passetti
Instituição-sede: Instituto do Coração Professor Euryclides de Jesus Zerbini (INCOR). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Processamento alternativo   Proteoma   Transcriptoma   Genoma humano

Resumo

A pós-genômica surgiu como um próspero campo para que os milhares de seqüências provenientes dos projetos genoma tenham o seu significado biológico elucidado. Um dos mecanismos descritos na literatura como capaz de gerar surpreendente diversidade protéica é splicing alternativo. Entretanto, como aproximadamente 5% das proteínas humanas tenham a sua estrutura cristalográfica resolvida, pouco se sabe dos efeitos de eventos de splicing alternativo na função das proteínas. Por meio do alinhamento entre as seqüências dessas proteínas com estrutura terciária conhecida e o genoma humano, isoformas que não possuíam estrutura protéica conhecida, podem ser alvos de modelagem. O presente projeto tem como objetivos: 1) montagem de uma base de dados relacional contendo a informação do mapeamento das proteínas com estrutura cristalográfica resolvida no genoma humano; 2) definição dos genes que contenham tanto estas proteínas como eventos de splicing alternativo em seus transcritos; e 3) modelagem molecular por homologia daquelas isoformas candidatas de genes com splicing alternativo. (AU)

Patente(s) depositada(s) como resultado deste projeto de pesquisa

TERNARY MATRIX ADAPTER AND RETRIEVAL METHOD FOR MOLECULAR BIOLOGICAL INFORMATION PCT/BR2008/000140 - Fundação Ary Frauzino para Pesquisa e Controle do Câncer ; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) ; Fundação Zerbini . Fabio Passetti; Paulo Sergio Lopes de Oliveira; Jeryes Farah; Victor Senos Dobroff; Marcelo Garcia; Carlos Alberto de Bragança Pereira; Francisco Elói Soares de Araújo - 14 de maio de 2008

USO DE UMA MATRIZ TERNÁRIA COMO ADAPTADOR DE INFORMAÇÕES BIOLÓGICAS MOLECULARES, E, MÉTODO DE CONSULTA E VISUALIZAÇÃO DE INFORMAÇÕES BIÓLOGICAS MOLECULARES ARMAZENADAS EM PELO MENOS UMA BASE DE DADOS PI0703888-7 - Fabio Passetti ; Fundação Ary Frauzino para Pesquisa e Controle do Câncer ; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) ; Fundação Zerbini ; Paulo Sergio Lopes de Oliveira . Fabio Passetti; Paulo Sergio Lopes de Oliveira; Jeryes Farah; Victor Senos Dobroff; Marcelo Garcia; Carlos Alberto de Bragança Pereira; Francisco Elói Soares de Araújo - 15 de maio de 2007

TERNARY MATRIX ADAPTER AND RETRIEVAL METHOD FOR MOLECULAR BIOLOGICAL INFORMATION US12/451,479 - Fundação Ary Frauzino para Pesquisa e Controle do Câncer ; Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) ; Fundação Zerbini . Fabio Passetti; Paulo Sergio Lopes de Oliveira; Jeryes Farah; Victor Senos Dobroff; Marcelo Garcia; Carlos Alberto de Bragança Pereira; Francisco Elói Soares de Araújo - 14 de maio de 2008

 
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