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Anotação e comparação dos genes encontratos em Xanthomonas citri com outros genomas e análise da expressão de genes do Genoma Xylella fastidiosa por técnica de DNA microarray

Processo: 00/09792-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2000
Vigência (Término): 30 de setembro de 2002
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Ana Claudia Rasera da Silva
Beneficiário:Leandro Marcio Moreira
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   Genômica comparativa   Xanthomonas   Xylella fastidiosa   Genoma Xylella fastidiosa   Genoma Xanthomonas   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos

Resumo

Utilizando ferramentas de bioinformática estaremos realizando a anotação das vias de metabolismo intermediário e de pequenas moléculas em Xanthomonas citri com o objetivo de compreendermos seu metabolismo como um todo e ao mesmo tempo inter-relacioná-la com Xylella fastidiosa, uma vez que são duas bactérias filogeneticamente próximas e por infectarem os citros. Já no que diz respeito á Xylella estaremos realizando análise de expressão gênica por técnica de DNA microarray com o propósito de sabermos em que condições Xylella expressa determinados proteínas e até mesmo determinar uma função a ORF's classificadas como hipotéticas por não apresentarem qualquer tipo de função putative. (AU)

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Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
MOREIRA, Leandro Marcio. Análise comparativa entre os genomas dos fitopatógenos Xylella fastidiosa e Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2002. 76 f. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química São Paulo.

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