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Gerenciamento e análise de dados de microarrays de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico do câncer de próstata humano

Processo: 03/05185-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de outubro de 2003
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Aline Maria da Silva
Beneficiário:Ana Carolina Quirino Simoes
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:99/07390-0 - Cooperation for Analysis of Gene Expression - CAGE, AP.TEM
Assunto(s):Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Biomarcadores   Neoplasias da próstata   Biologia computacional   Expressão gênica

Resumo

Os microarrays de DNA são considerados hoje a melhor alternativa para análise quantitativa dos níveis de expressão de milhares de genes simultaneamente, permitindo com relativa facilidade a avaliação global da expressão gênica em organismos, tecidos ou células, em diferentes situações fisiológicas ou patológicas. Através desta tecnologia, o perfil de expressão de milhares de genes foi comparado em diversos tipos de câncer, permitindo avanços significativos na identificação e classificação de subtipos tumorais, na descoberta de biomarcadores de valor diagnóstico e prognóstico da doença e também na compreensão da biologia do câncer. Através do projeto temático CAGE em andamento e de um outro projeto temático em fase de julgamento na FAPESP, nosso grupo tem como objetivo a busca e identificação de genes candidatos a biomarcadores para o diagnóstico e prognóstico do câncer de próstata, a partir de dados experimentais dos níveis de expressão de milhares de genes obtidos através de microarrays de DNA. Para dar suporte a este objetivo propomos, neste projeto de doutorado, estruturar, configurar e implementar um banco de dados relacional e associar ferramentas estatísticas apropriadas para análise de dados de microarrays de DNA que estão sendo gerados em nosso grupo. (AU)

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