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Caracterização genômica e funcional de sequências relacionadas ao retrotransposon Tnt1 em cana-de-açúcar

Processo: 03/13608-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de março de 2004
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Marie-Anne van Sluys
Beneficiário:Douglas Silva Domingues
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Retroelementos   Cana-de-açúcar

Resumo

Os elementos transponíveis (TEs) representam uma grande porcentagem dos genomas vegetais. Com o surgimento dos projetos genoma, houve um aumento nas informações disponíveis sobre TEs, que possibilitou o desenvolvimento de novas abordagens no estudo destes elementos. O SUCEST gerou um grande volume de informações a respeito dos TEs expressos em cana-de-açúcar. Estes dados deram o suporte necessário para estudos detalhados sobre as famílias de TEs neste gênero. O retrotransposon Tnt1, que parecia estar restrito apenas à família Solanaceae, teve elementos similares em nível de aminoácidos identificados em algumas monocotiledôneas, entre elas a cana-de-açúcar. Este projeto tem como objetivo a caracterização genômica e funcional das seqüências de cana-de-açúcar relacionadas ao elemento Tnt1. Estudos sobre a distribuição dessas seqüências no genoma, análises de expressão e filogenia irão proporcionar uma avaliação detalhada destes retrotransposons relacionados à Tnt1. Estes dados possibilitarão a identificação de regiões conservadas e padrões de expressão que sejam comuns aos elementos de cana-de-açúcar e fumo. As informações geradas serão importantes para elucidar a evolução, atividade e dispersão destes elementos relacionados à Tnt1 em monocotiledôneas, utilizando a cana-de-açúcar como planta modelo. Esta será uma contribuição importante para o entendimento do impacto e da distribuição dos TEs nos genomas vegetais. (AU)