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Identificação de genes de Xylella fastidiosa (Xf) com expressão regulada por concentrações subinibitorias de peptídeos antimicrobianos

Processo: 04/02763-2
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2004
Vigência (Término): 30 de novembro de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Aline Maria da Silva
Beneficiário:Patricia Isabela Pessoa da Silva
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Xylella fastidiosa   Expressão gênica   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Clorose variegada dos citros   Biologia computacional   Genética molecular

Resumo

Xylella fastidiosa (Xf) é o fitopatógeno causador da clorose variegada dos citros (CVC), sendo responsável por prejuízos ao cultivo de laranjas doces no Brasil. Como não existe uma forma direta de combate à Xf, investigações sobre a sua biologia são importantes para o desenvolvimento de estratégias para o controle da CVC. Assim sendo, esse projeto de pesquisa tem como objetivo a identificação de genes de Xf com expressão alterada em resposta ao efeito de concentrações subinibitórias de gomesina, um peptídeo antimicrobiano isolado dos hemócitos da aranha Acanthoscurria gomesiana. É conhecido que doses subletais de substâncias antibióticas podem modular a expressão gênica de bactérias, constituindo uma ferramenta para a identificação, tanto de mecanismos de resistência desenvolvidos contra antibióticos, quanto de circuitos genéticos eventualmente afetados por estas substâncias. A cepa de Xf a ser utilizada será a 9a5c, que inequivocamente é capaz de causar a CVC e teve seu genoma completamente seqüenciado. A metodologia está baseada na utilização de microarrays de DNA em lâminas de vidro planejados e construídos por nosso grupo que está associado ao CAGE (Cooperação para Análise de Genes e sua Expressão) no Departamento de Bioquímica do IQUSP, representando 2692 CDS dessa cepa (94.5% de todas as CDS anotadas no genoma). Alguns genes diferencialmente expressos nas condições investigadas serão selecionados para caracterização adicional tanto bioquimicamente como através de genética molecular. (AU)

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