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Caracterização genômica e funcional de transposons mutator em cana-de-açúcar

Processo: 04/01437-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência (Início): 01 de abril de 2004
Vigência (Término): 30 de junho de 2005
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Maria Magdalena Rossi
Beneficiário:Maria Magdalena Rossi
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:03/08890-3 - Caracterização genômica e funcional de transposons mutator em cana-de-açúcar, AP.JP
Assunto(s):Elementos de DNA transponíveis   Transposases   Clonagem   Cana-de-açúcar

Resumo

Os elementos de transposição (TEs) constituem parte importante do material genético dos euCarlontes, podendo representar desde 45 % em humanos até 50-80 % no genoma de gramíneas. No banco de dados do SUCEST, foi encontrado um abundante espectro de TEs sendo expressos. O elemento mais freqüente foi o transposon MuDR. Resultados obtidos em nosso laboratório revelaram que existem pelo menos três classes destes transposons em plantas e que estas existiam previamente à divergência entre mono e dicotiledôneas. Dentro de cada uma das classes são mantidas as relações filogenéticas entre as espécies. Cada classe apresenta padrões de inserção genômica, assim como freqüência de "stop codons" e "frame shifts" distintos, estas observações sugerem diferenças nos níveis de atividade dos elementos. Neste contexto, este projeto visa a clonagem de elementos MuDR de cana de açúcar para sua posterior caracterização genômica e funcional, sendo os objetivos específicos: a clonagem de pelo menos um elemento MuDR para cada uma das três classes identificadas, caracterização estrutural dos elementos clonados (introns, exons, TIRs, etc), caracterização das regiões franqueadoras, avaliação do número de cópias, identificação da contribuição dos parentais do híbrido, e o estudo da expressão dos elementos. (AU)