Identificação de marcadores moleculares hospedeiro-especificos de Escherichia coli de aguas superficiais do Estado de São Paulo

Autor(es)

Camila Carlos

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
• Data de defesa: 2010-02-24

Membros da banca

Laura Maria Mariscal Ottoboni; Valeria Maia de Oliveira; Luciana Campos Paulino

• Orientador: Laura Maria Mariscal Ottoboni

Resumo

Coliformes e enterococos fecais de origem humana ou animal na água podem indicar a presença de patógenos de veiculação hídrica como, por exemplo, Salmonella e Giardia. A identificação da fonte de contaminação fecal (lançamento de esgoto doméstico, escoamento de fezes animais de criação no solo, de animais silvestres, aves e outros) é importante para a implantação de medidas efetivas de gerenciamento e remediação de águas superficiais. Dessa forma, o desenvolvimento de métodos para identificação da fonte de contaminação fecal é de fundamental importância para as ações de controle, para preservar a integridade dos corpos d'água e para proteger a saúde da população. Até o momento, não existe um método único e universal para este tipo de análise e, no Brasil, as pesquisas nessa área são praticamente nulas. Assim sendo, este trabalho teve como objetivo a obtenção de marcadores moleculares hospedeiro-específicos em Escherichia coli, que permitam a identificação da fonte animal de contaminação fecal em águas superficiais. Neste trabalho foram utilizadas 174 linhagens de origem humana, 50 de origem bovina, 39 de origem suína, 16 de origem aviária, 29 de origem ovina, 16 de origem caprina, 44 de esgoto, 36 de reservatórios com contaminação esperada de origem humana e 30 de rios e reservatórios com contaminação esperada de origem animal. A determinação do grupo filogenético de todas as linhagens foi realizada pela detecção dos genes chuA e yjaA e do fragmento Tspe4.C2 por PCR. Os resultados mostraram que a distribuição dos grupos filogenéticos principais A, B1, B2 e D foi diferente entre os hospedeiros analisados, o que permitiu a predição da fonte de contaminação fecal da maioria dos pontos de amostragem. Cem linhagens de humanos e todas as linhagens de origem animal foram analisadas por BOX- e (GTG)5-PCR. O BOX-PCR apresentou uma taxa global de classificação correta de 63,70%, o (GTG)5-PCR de 49,10% e quando os dois métodos foram utilizados a taxa foi de 57,61%. Outras 32 linhagens de humanos e 28 de esgoto também foram analisadas por BOX-PCR, sendo que, 59,4% das linhagens de humanos foram corretamente classificadas e 85,2% das linhagens de esgoto foram classificadas como de humanos. Vinte linhagens de humanos, 15 de bois e 16 de galinhas foram analisadas por espectroscopia no infravermelho com transformada de Fourier (FTIR). Utilizando-se um modelo PLS-DA com a segunda derivada do espectro na região 2816 e 3026 cm-1 foi possível separar completamente as linhagens segundo sua origem animal. Assim sendo, a espectroscopia FT-IR foi considerada a técnica mais promissora para futuros estudos de rastreamento de fonte de contaminação fecal. (AU)

• Processo FAPESP: 07/57025-4 - Identificação de marcadores moleculares hospedeiro-especificos de Escherichia coli de águas superficiais do estado de São Paulo
• Beneficiário: Camila Carlos
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado