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MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS

Tipo de documento:Patente
Inventor(es): Roberto Hirochi Herai; Michel Eduardo Beleza Yamagishi
Depositante: Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) ; Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Data do depósito: 05 de dezembro de 2012
Registro INPI:
BR102012031096-1 - Consulta INPI
IPC: G06F 19/10
Resumo

MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS A presente invenção trata-se de um método para verificação de erros de montagem em genomas de organismos sequenciados ou produzidos de maneira sintética que utiliza relações de frequência entre fragmentos de sequências de nucleotídeos de um genoma. O método possui aplicações na verificação de erros em um genoma montado a partir de fragmentos oriundos dos diferentes tipos de tecnologias de sequenciamento e auxiliar na construção de genomas sintéticos, como por exemplo. Pode ser empregado para compressão de material genético, pois as relações de frequência determinadas pelo método permitem reduzir a complexidade de sequências de nucleotídeos, de forma a representar seu conteúdo de maneira comprimida, reduzindo assim o espaço necessário para seu armazenamento.


Processo FAPESP: 08/02647-3 - Estudo de inverted repeats em genomas de mamíferos e plantas
Beneficiário:Roberto Hirochi Herai
Pesquisador responsável:Michel Eduardo Beleza Yamagishi
Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia (IB)
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado