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André Fujita

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

possui graduação em Ciência da Computação (2003), doutorado em Bioinformática (2007) e livre-docência (2016), todos pela Universidade de São Paulo. Realizou pós-doutorado no Instituto de Ciências Médicas da Universidade de Tóquio (2007-2009) e no Computational Science Research Program do RIKEN (2009-2011) (Japão). Foi Pesquisador Visitante no Cancer Research Institute da Kanazawa University (Japão), no Dept. de Ciência da Computação da Leipzig University (Alemanha), e no Institute of Psychiatry, Psychology & Neuroscience do King's College London (Reino Unido). Recebeu diversos prêmios nacionais (melhor tese em computação - SBC, Menção Honrosa no prêmio de teses - CAPES, Jovem Pesquisador Destaque - AB3C) e internacionais (Alexander von Humboldt Fellowship - Alemanha, Newton Advanced Fellowship - Reino Unido, SPDR Fellowship - Japão, Fulbright Fellowship - EUA e Intercontinental Academia Fellowship - University-Based Institutes for Advanced Study). Trabalha com temas relacionados à conectividade e métodos estatísticos em grafos, ambos com aplicações na análise de dados biológicos em larga escala ("omics", EEG, fMRI). Atualmente é Professor Associado do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo (USP) e coordenador do programa de pós-graduação interunidades em bioinformática. A página pessoal encontra-se em: http://www.ime.usp.br/~fujita (Fonte: Currículo Lattes)

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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações51
Citações160
Cit./Artigo3,1
Dados do Web of Science

PERON, J. P. S.; NAKAYA, I, H.; SCHLINDWEIN, M. A. M.; GONCALVES, M. V. M.. COVID-19 Pandemic and Dysbiosis: Can the Ivermectin Hysteria Lead to an Increase of Autoimmune Neuroinflammatory Diseases?. CRITICAL REVIEWS IN IMMUNOLOGY, v. 40, n. 6, SI, p. 537-542, . Citações Web of Science: 0. (19/06372-3, 17/21363-5, 17/22504-1, 13/08216-2, 18/21934-5, 18/14933-2, 12/19278-6)

FUJITA, ANDRE; LIRA, EDUARDO SILVA; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; BANDO, SILVIA YUMI; SOARES, GABRIELA ELEUTERIO; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA. A semi-parametric statistical test to compare complex networks. JOURNAL OF COMPLEX NETWORKS, v. 8, n. 2, . Citações Web of Science: 0. (18/17996-5, 18/21934-5, 15/21162-4, 15/01587-0)

RODRIGUES, JULIA DE SOUZA; RIBEIRO, FERNANDA LENITA; SATO, JOAO RICARDO; MESQUITA, RICKSON COELHO; BIAZOLI JUNIOR, CLAUDINEI EDUARDO. Identifying individuals using fNIRS-based cortical connectomes. BIOMEDICAL OPTICS EXPRESS, v. 10, n. 6, p. 2889-2897, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5)

BUENO, A. P. A.; SATO, J. R.; HORNBERGER, M.. Eye tracking - The overlooked method to measure cognition in neurodegeneration?. Neuropsychologia, v. 133, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 17/23020-8, 16/19376-9, 18/04654-9)

RAMOS, TAIANE COELHO; BALARDIN, JOANA BISOL; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. Abnormal Cortico-Cerebellar Functional Connectivity in Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN SYSTEMS NEUROSCIENCE, v. 12, . Citações Web of Science: 4. (15/01587-0, 13/07375-0, 16/13422-9, 18/17996-5)

SATO, JOAO RICARDO; VIDAL, MACIEL CALEBE; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; MASSIRER, KATLIN BRAUER; FUJITA, ANDRE. Complex Network Measures in Autism Spectrum Disorders. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 15, n. 2, p. 581-587, . Citações Web of Science: 3. (13/03447-6, 14/09576-5, 13/10498-6, 13/00506-1, 12/00195-3)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; BALARDIN, JOANA BISOL; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO. Correlation between graphs with an application to brain network analysis. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 109, p. 76-92, . Citações Web of Science: 0. (13/10498-6, 16/13422-9, 13/00506-1, 15/01587-0)

SATO, JOAO RICARDO; BALARDIN, JOANA; VIDAL, MACIEL CALEBE; FUJITA, ANDRE. Identification of segregated regions in the functional brain connectome of autistic patients by a combination of fuzzy spectral clustering and entropy analysis. JOURNAL OF PSYCHIATRY & NEUROSCIENCE, v. 41, n. 2, p. 124-132, . Citações Web of Science: 4. (14/09576-5, 11/50761-2)

JEAN PIERRE SCHATZMANN PERON; HELDER NAKAYA. Susceptibility of the Elderly to SARS-CoV-2 Infection: ACE-2 Overexpression, Shedding, and Antibody-dependent Enhancement (ADE). Clinics, v. 75, p. -, . Citações Web of Science: 1. (13/08216-2, 17/22504-1, 18/14933-2, 18/21934-5, 12/19278-6)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL Y.; PATRIOTA, ALEXANDRE G.; SATO, JOAO R.. A non-parametric statistical test to compare clusters with applications in functional magnetic resonance imaging data. STATISTICS IN MEDICINE, v. 33, n. 28, p. 4949-4962, . Citações Web of Science: 2. (14/09576-5, 11/50761-2, 12/21788-2, 13/10498-6)

VATTIMO, EDOARDO F. Q.; BARROS, VIVIAN B.; REQUENA, GUARACI; SATO, JOAO R.; FATORI, DANIEL; MIGUEL, EURIPEDES C.; SHAVITT, ROSELI G.; HOEXTER, MARCELO Q.; BATISTUZZO, MARCELO C.. Caudate volume differences among treatment responders, non-responders and controls in children with obsessive-compulsive disorder. EUROPEAN CHILD & ADOLESCENT PSYCHIATRY, v. 28, n. 12, p. 1607-1617, . Citações Web of Science: 1. (14/50917-0, 18/04654-9, 09/09949-8, 18/21934-5, 13/08531-5)

REBELLO, KEILA; MOURA, LUCIANA M.; XAVIER, GABRIELA; SPINDOLA, LETICIA M.; CARVALHO, CAROLINA MUNIZ; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; GADELHA, ARY; PICON, FELIPE; PAN, PEDRO MARIO; ZUGMAN, ANDRE; et al. Association between spontaneous activity of the default mode network hubs and leukocyte telomere length in late childhood and early adolescence. JOURNAL OF PSYCHOSOMATIC RESEARCH, v. 127, . Citações Web of Science: 0. (13/08531-5, 18/21934-5, 14/50917-0, 14/07280-1, 18/04654-9)

SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; DE ALMEIDA GALATRO, THAIS FERNANDA; WATANABE, RODRIGO AKIRA; OBA-SHINJO, SUELI MIEKO; NAGAHASHI MARIE, SUELY KAZUE; FUJITA, ANDRE. CoGA: An R Package to Identify Differentially Co-Expressed Gene Sets by Analyzing the Graph Spectra. PLoS One, v. 10, n. 8, . Citações Web of Science: 7. (14/09576-5, 13/03447-6, 12/25417-9, 11/50761-2)

VIDAL, MACIEL C.; SATO, JOAO R.; BALARDIN, JOANA B.; TAKAHASHI, DANIEL Y.; FUJITA, ANDRE. ANOCVA in R: A Software to Compare Clusters between Groups and Its Application to the Study of Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, . Citações Web of Science: 1. (15/01587-0, 13/10498-6, 14/09576-5, 13/03447-6, 16/13422-9)

TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; SATO, JOAO RICARDO; FERREIRA, CARLOS EDUARDO; FUJITA, ANDRE. Discriminating Different Classes of Biological Networks by Analyzing the Graphs Spectra Distribution. PLoS One, v. 7, n. 12, . Citações Web of Science: 16. (11/07762-8, 10/01394-4)

SOARES JR, RAIMUNDO DA SILVA; LUKASOVA, KATERINA; CARTHERY-GOULART, MARIA TERESA; SATO, JOAO RICARDO. Student's Perspective and Teachers' Metacognition: Applications of Eye-Tracking in Education and Scientific Research in Schools. FRONTIERS IN PSYCHOLOGY, v. 12, . Citações Web of Science: 0. (19/25795-2, 18/04654-9, 18/21934-5)

SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI, CLAUDINEI EDUARDO; ZUGMAN, ANDRE; PAN, PEDRO MARIO; ARANTES BUENO, ANA PAULA; MOURA, LUCIANA MONTEIRO; GADELHA, ARY; PICON, FELIPE ALMEIDA; AMARO JR, EDSON; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; et al. Long-term stability of the cortical volumetric profile and the functional human connectome throughout childhood and adolescence. European Journal of Neuroscience, v. 54, n. 6, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 16/19376-9, 13/08531-5, 14/50917-0, 18/04654-9)

DE SOUZA, RENATO WILLIAM R.; DE OLIVEIRA, JOAO VITOR CHAVES; PASSOS, JR., LEANDRO A.; DING, WEIPING; PAPA, JOAO P.; DE ALBUQUERQUE, VICTOR HUGO C.. A Novel Approach for Optimum-Path Forest Classification Using Fuzzy Logic. IEEE TRANSACTIONS ON FUZZY SYSTEMS, v. 28, n. 12, p. 3076-3086, . Citações Web of Science: 5. (14/12236-1, 16/19403-6, 17/25908-6, 18/21934-5, 13/07375-0)

TRAMBAIOLLI, LUCAS R.; TOSSATO, JULIANA; CRAVO, ANDRE M.; BIAZOLI, JR., CLAUDINEI E.; SATO, JOAO R.. Subject-independent decoding of affective states using functional near-infrared spectroscopy. PLoS One, v. 16, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 18/04654-9, 15/17406-5, 17/05225-1)

PINTO, BRUNA G. G.; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; SINGH, YOUVIKA; JIMENEZ, LEANDRO; GONCALVES, ANDRE N. A.; OGAVA, RODRIGO L. T.; CREIGHTON, RACHEL; SCHATZMANN PERON, JEAN PIERRE; NAKAYA, I, HELDER. ACE2 Expression Is Increased in the Lungs of Patients With Comorbidities Associated With Severe COVID-19. Journal of Infectious Diseases, v. 222, n. 4, p. 556-563, . Citações Web of Science: 36. (13/08216-2, 12/19278-6, 17/50137-3, 18/14933-2, 18/21934-5)

MENDES, SERGIO LEONARDO; LOPEZ PINAYA, WALTER HUGO; PAN, PEDRO; SATO, JOAO RICARDO. Estimating Gender and Age from Brain Structural MRI of Children and Adolescents: A 3D Convolutional Neural Network Multitask Learning Model. COMPUTATIONAL INTELLIGENCE AND NEUROSCIENCE, v. 2021, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 18/04654-9)

ARIAS-CARRASCO, RAUL; GIDDALURU, JEEVAN; CARDOZO, LUCAS E.; MARTINS, FELIPE; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, HELDER I.. OUTBREAK: a user-friendly georeferencing online tool for disease surveillance. Biological Research, v. 54, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (18/14933-2, 13/08216-2, 19/16419-7, 18/21934-5, 17/50137-3)

RIBEIRO, ADELE HELENA; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. Granger Causality among Graphs and Application to Functional Brain Connectivity in Autism Spectrum Disorder. Entropy, v. 23, n. 9, . Citações Web of Science: 0. (18/04654-9, 18/21934-5)

IWASHITA, ADRIANA SAYURI; RODRIGUES, DOUGLAS; GASTALDELLO, DANILO SINKITI; DE SOUZA, ANDRE NUNES; PAPA, JOAO PAULO. An incremental Optimum-Path Forest classifier and its application to non-technical losses identification. COMPUTERS & ELECTRICAL ENGINEERING, v. 95, . Citações Web of Science: 0. (14/12236-1, 19/07665-4, 18/21934-5, 17/02286-0, 13/07375-0)

BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. Neuroinflammation at single cell level: What is new?. Journal of Leukocyte Biology, . Citações Web of Science: 0. (13/08216-2, 18/21934-5, 17/50137-3, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/22504-1, 17/21363-5, 18/14933-2, 19/06372-3)

DA SILVA FERREIRA BARRETO, CANDIDA; ZIMEO MORAIS, GUILHERME AUGUSTO; VANZELLA, PATRICIA; SATO, JOAO RICARDO. Combining the intersubject correlation analysis and the multivariate distance matrix regression to evaluate associations between fNIRS signals and behavioral data from ecological experiments. Experimental Brain Research, v. 238, n. 10, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 18/04654-9)

GUZMAN, GROVER E. CASTRO; FUJITA, ANDRE. Convolution-based linear discriminant analysis for functional data classification. INFORMATION SCIENCES, v. 581, p. 469-478, . Citações Web of Science: 0. (18/17996-5, 18/21934-5, 20/01479-1)

SATO, JOAO RICARDO; VIDAL, MACIEL CALEBE; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; MASSIRER, KATLIN BRAUER; FUJITA, ANDRE. Complex Network Measures in Autism Spectrum Disorders. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 15, n. 2, p. 581-587, . Citações Web of Science: 3. (13/10498-6, 14/09576-5, 13/03447-6, 13/00506-1, 12/00195-3)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; BALARDIN, JOANA BISOL; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO. Correlation between graphs with an application to brain network analysis. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 109, p. 76-92, . Citações Web of Science: 0. (13/10498-6, 16/13422-9, 13/00506-1, 15/01587-0)

SATO, JOAO RICARDO; BALARDIN, JOANA; VIDAL, MACIEL CALEBE; FUJITA, ANDRE. Identification of segregated regions in the functional brain connectome of autistic patients by a combination of fuzzy spectral clustering and entropy analysis. JOURNAL OF PSYCHIATRY & NEUROSCIENCE, v. 41, n. 2, p. 124-132, . Citações Web of Science: 4. (11/50761-2, 14/09576-5)

SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; DE ALMEIDA GALATRO, THAIS FERNANDA; WATANABE, RODRIGO AKIRA; OBA-SHINJO, SUELI MIEKO; NAGAHASHI MARIE, SUELY KAZUE; FUJITA, ANDRE. CoGA: An R Package to Identify Differentially Co-Expressed Gene Sets by Analyzing the Graph Spectra. PLoS One, v. 10, n. 8, . Citações Web of Science: 7. (14/09576-5, 13/03447-6, 12/25417-9, 11/50761-2)

VIDAL, MACIEL C.; SATO, JOAO R.; BALARDIN, JOANA B.; TAKAHASHI, DANIEL Y.; FUJITA, ANDRE. ANOCVA in R: A Software to Compare Clusters between Groups and Its Application to the Study of Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, . Citações Web of Science: 1. (15/01587-0, 13/10498-6, 14/09576-5, 13/03447-6, 16/13422-9)

TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; SATO, JOAO RICARDO; FERREIRA, CARLOS EDUARDO; FUJITA, ANDRE. Discriminating Different Classes of Biological Networks by Analyzing the Graphs Spectra Distribution. PLoS One, v. 7, n. 12, . Citações Web of Science: 16. (11/07762-8, 10/01394-4)

SOARES JR, RAIMUNDO DA SILVA; LUKASOVA, KATERINA; CARTHERY-GOULART, MARIA TERESA; SATO, JOAO RICARDO. Student's Perspective and Teachers' Metacognition: Applications of Eye-Tracking in Education and Scientific Research in Schools. FRONTIERS IN PSYCHOLOGY, v. 12, . Citações Web of Science: 0. (19/25795-2, 18/04654-9, 18/21934-5)

SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI, CLAUDINEI EDUARDO; ZUGMAN, ANDRE; PAN, PEDRO MARIO; ARANTES BUENO, ANA PAULA; MOURA, LUCIANA MONTEIRO; GADELHA, ARY; PICON, FELIPE ALMEIDA; AMARO JR, EDSON; SALUM, GIOVANNI ABRAHAO; et al. Long-term stability of the cortical volumetric profile and the functional human connectome throughout childhood and adolescence. European Journal of Neuroscience, v. 54, n. 6, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 16/19376-9, 13/08531-5, 14/50917-0, 18/04654-9)

DE SOUZA, RENATO WILLIAM R.; DE OLIVEIRA, JOAO VITOR CHAVES; PASSOS, JR., LEANDRO A.; DING, WEIPING; PAPA, JOAO P.; DE ALBUQUERQUE, VICTOR HUGO C.. A Novel Approach for Optimum-Path Forest Classification Using Fuzzy Logic. IEEE TRANSACTIONS ON FUZZY SYSTEMS, v. 28, n. 12, p. 3076-3086, . Citações Web of Science: 5. (14/12236-1, 16/19403-6, 17/25908-6, 18/21934-5, 13/07375-0)

TRAMBAIOLLI, LUCAS R.; TOSSATO, JULIANA; CRAVO, ANDRE M.; BIAZOLI, JR., CLAUDINEI E.; SATO, JOAO R.. Subject-independent decoding of affective states using functional near-infrared spectroscopy. PLoS One, v. 16, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 18/04654-9, 15/17406-5, 17/05225-1)

PINTO, BRUNA G. G.; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; SINGH, YOUVIKA; JIMENEZ, LEANDRO; GONCALVES, ANDRE N. A.; OGAVA, RODRIGO L. T.; CREIGHTON, RACHEL; SCHATZMANN PERON, JEAN PIERRE; NAKAYA, I, HELDER. ACE2 Expression Is Increased in the Lungs of Patients With Comorbidities Associated With Severe COVID-19. Journal of Infectious Diseases, v. 222, n. 4, p. 556-563, . Citações Web of Science: 36. (13/08216-2, 12/19278-6, 17/50137-3, 18/14933-2, 18/21934-5)

MENDES, SERGIO LEONARDO; LOPEZ PINAYA, WALTER HUGO; PAN, PEDRO; SATO, JOAO RICARDO. Estimating Gender and Age from Brain Structural MRI of Children and Adolescents: A 3D Convolutional Neural Network Multitask Learning Model. COMPUTATIONAL INTELLIGENCE AND NEUROSCIENCE, v. 2021, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 18/04654-9)

ARIAS-CARRASCO, RAUL; GIDDALURU, JEEVAN; CARDOZO, LUCAS E.; MARTINS, FELIPE; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, HELDER I.. OUTBREAK: a user-friendly georeferencing online tool for disease surveillance. Biological Research, v. 54, n. 1, . Citações Web of Science: 0. (18/14933-2, 13/08216-2, 19/16419-7, 18/21934-5, 17/50137-3)

RIBEIRO, ADELE HELENA; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. Granger Causality among Graphs and Application to Functional Brain Connectivity in Autism Spectrum Disorder. Entropy, v. 23, n. 9, . Citações Web of Science: 0. (18/04654-9, 18/21934-5)

IWASHITA, ADRIANA SAYURI; RODRIGUES, DOUGLAS; GASTALDELLO, DANILO SINKITI; DE SOUZA, ANDRE NUNES; PAPA, JOAO PAULO. An incremental Optimum-Path Forest classifier and its application to non-technical losses identification. COMPUTERS & ELECTRICAL ENGINEERING, v. 95, . Citações Web of Science: 0. (14/12236-1, 19/07665-4, 18/21934-5, 17/02286-0, 13/07375-0)

BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. Neuroinflammation at single cell level: What is new?. Journal of Leukocyte Biology, . Citações Web of Science: 0. (13/08216-2, 18/21934-5, 17/50137-3, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/22504-1, 17/21363-5, 18/14933-2, 19/06372-3)

DA SILVA FERREIRA BARRETO, CANDIDA; ZIMEO MORAIS, GUILHERME AUGUSTO; VANZELLA, PATRICIA; SATO, JOAO RICARDO. Combining the intersubject correlation analysis and the multivariate distance matrix regression to evaluate associations between fNIRS signals and behavioral data from ecological experiments. Experimental Brain Research, v. 238, n. 10, . Citações Web of Science: 0. (18/21934-5, 18/04654-9)

GUZMAN, GROVER E. CASTRO; FUJITA, ANDRE. Convolution-based linear discriminant analysis for functional data classification. INFORMATION SCIENCES, v. 581, p. 469-478, . Citações Web of Science: 0. (18/17996-5, 18/21934-5, 20/01479-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GARCÍA, Juan Manuel Vidal. Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Matemática e Estatística.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (12/25460-1

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