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André Fujita

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

possui graduação em Ciência da Computação (2003), doutorado em Bioinformática (2007) e livre-docência (2016), todos pela Universidade de São Paulo. Realizou pós-doutorado no Instituto de Ciências Médicas da Universidade de Tóquio (2007-2009) e no Computational Science Research Program do RIKEN (2009-2011) (Japão). Foi Pesquisador Visitante do Cancer Research Institute da Universidade de Kanazawa (Japão) em 2014 e 2015. Atualmente é pesquisador convidado na Universidade de Leipzig (Alemanha). Recebeu prêmios de melhor tese em ciência da computação pela Sociedade Brasileira de Computação (SBC), Menção Honrosa no prêmio CAPES de teses na área de Ciências Biológicas I, Jovem Pesquisador Destaque pela Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C) e Fellowships do Alexander von Humboldt Foundation (Alemanha), Academy of Medical Sciences - Newton Advanced Fund (the Royal Society, Reino Unido), Special Postdoctoral Researcher Program (RIKEN - Japão). Trabalha com temas relacionados à conectividade e métodos estatísticos em grafos, ambos com aplicações na análise de dados biológicos em larga escala ("omics", EEG, fMRI). Atualmente é Professor Associado do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo (USP) e vice-coordenador do programa de pós-graduação interunidades em bioinformática. A página pessoal encontra-se em: http://www.ime.usp.br/~fujita (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Em andamento (mais recentes)

  • Resumo

    A importância da Estatística nas ciências naturais é inquestionável. A Estatística é essencial para analisar dados de forma apropriada e também obter conclusões confiáveis. No entanto, pouco se é conhecido sobre métodos estatísticos formais em grafos e suas propriedades teóricas mesmo com o aumento no número de artigos relacionados com redes do mundo real (por ex., redes funcionais de ...

    Estatística de redes: teoria, métodos e aplicações, AP.TEM
Concluídos (mais recentes)
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Bolsas no país
Em andamento (mais recentes)

  • Resumo

    O alto número de mortes decorrentes de câncer de mama evidencia a importância dos estudos realizados na área. Dentre os subtipos moleculares de câncer de mama, o triplo-negativo está associado à forma mais agressiva e, por não ter tratamentos específicos, apresenta os piores prognósticos. Dada a importância dos estudos em câncer, bancos de dados multi-ômicas disponibilizam uma grade qu...

    Difusão em redes dirigidas para o estudo do câncer de mama triplo-negativo, BP.DR

  • Resumo

    A esquizofrenia é um transtorno psiquiátrico cuja evolução geralmente leva o portador a uma extensa deterioração das capacidades cognitivas e sociais. Muitos passam a ser dependentes do apoio familiar, além de necessitarem de constantes internações em clínicas psiquiátricas e hospitais. Apesar da baixa prevalência na população, em torno de 0,4 por cento, os custos econômicos são altos,...

    Análise de dados de imagens ressonância magnética funcional de pacientes diagnosticados com Esquizofrenia, BP.IC
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Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 07/12/2019
1 Auxílios à pesquisa em andamento
5 Auxílios à pesquisa concluídos
2 Bolsas no país em andamento
4 Bolsas no país concluídas
2 Bolsas no exterior concluídas
14 Todos os Auxílios e Bolsas
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Análise de Sobrevida Aprendizado computacional Aprendizado de Máquina Big data Bioinformática Biologia Molecular Biologia computacional Biologia de Sistemas Biologia molecular Bioquímica Causalidade de Granger Ciência da Computação Ciências Biológicas Ciências Exatas e da Terra Ciências da Saúde Densidade espectral Doenças Esquizofrenia Estatística computacional Estatística Estimação de parâmetros Grafos aleatórios Interdisciplinar Matemática da Computação Medicina Metodologia e Técnicas da Computação MicroRNAs Neoplasias mamárias Neoplasias Neurociência computacional Neurociências Neuroimagem Prognóstico Psiquiatria Redes complexas Ressonância magnética funcional
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (19)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações19
Citações119
Cit./Artigo6,3
Dados do Web of Science

KINKER, GABRIELA SARTI; THOMAS, ANDREW MALTEZ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM; LIMA, FELIPE PRATA; FUJITA, ANDRE. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 4.

TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; SATO, JOAO RICARDO; FERREIRA, CARLOS EDUARDO; FUJITA, ANDRE. Discriminating Different Classes of Biological Networks by Analyzing the Graphs Spectra Distribution. PLoS One, v. 7, n. 12, . Citações Web of Science: 16.

VIDAL, MACIEL C.; SATO, JOAO R.; BALARDIN, JOANA B.; TAKAHASHI, DANIEL Y.; FUJITA, ANDRE. ANOCVA in R: A Software to Compare Clusters between Groups and Its Application to the Study of Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, . Citações Web of Science: 1.

SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; DE ALMEIDA GALATRO, THAIS FERNANDA; WATANABE, RODRIGO AKIRA; OBA-SHINJO, SUELI MIEKO; NAGAHASHI MARIE, SUELY KAZUE; FUJITA, ANDRE. CoGA: An R Package to Identify Differentially Co-Expressed Gene Sets by Analyzing the Graph Spectra. PLoS One, v. 10, n. 8, . Citações Web of Science: 8.

SATO, JOAO RICARDO; BIAZOLI JR, CLAUDINEI EDUARDO; MOURA, LUCIANA MONTEIRO; CROSSLEY, NICOLAS; ZUGMAN, ANDRE; PICON, FELIPE ALMEIDA; HOEXTER, MARCELO QUEIROZ; AMARO JR, EDSON; MIGUEL, EURIPEDES CONSTANTINO; ROHDE, LUIS AUGUSTO; et al. Association Between Fractional Amplitude of Low-Frequency Spontaneous Fluctuation and Degree Centrality in Children and Adolescents. BRAIN CONNECTIVITY, v. 9, n. 5, p. 379-387, . Citações Web of Science: 0.

JARDIM, VINICIUS CARVALHO; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; FUJITA, ANDRE; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. BioNetStat: A Tool for Biological Networks Differential Analysis. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . Citações Web of Science: 0.

HEINZE, RAFAEL ALVES; VANZELLA, PATRICIA; ZIMEO MORAIS, GUILHERME AUGUSTO; SATO, JOAO RICARDO. Hand motor learning in a musical context and prefrontal cortex hemodynamic response: a functional near-infrared spectroscopy (fNIRS) study. COGNITIVE PROCESSING, v. 20, n. 4, p. 507-513, . Citações Web of Science: 0.

GUZMAN, GROVER E. C.; SATO, JOAO R.; VIDAL, MACIEL C.; FUJITA, ANDRE. Identification of alterations associated with age in the clustering structure of functional bra in networks. PLoS One, v. 13, n. 5, . Citações Web of Science: 1.

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL Y.; PATRIOTA, ALEXANDRE G.; SATO, JOAO R.. A non-parametric statistical test to compare clusters with applications in functional magnetic resonance imaging data. STATISTICS IN MEDICINE, v. 33, n. 28, p. 4949-4962, . Citações Web of Science: 2.

AZEVEDO, HATYLAS; FUJITA, ANDRE; BANDO, SILVIA YUMI; IAMASHITA, PRISCILA; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO. Transcriptional Network Analysis Reveals that AT1 and AT2 Angiotensin II Receptors Are Both Involved in the Regulation of Genes Essential for Glioma Progression. PLoS One, v. 9, n. 11, . Citações Web of Science: 9.

SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; NAKATA, ASUKA; FUJITA, ANDRE. A comparative study of statistical methods used to identify dependencies between gene expression signals. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, v. 15, n. 6, p. 906-918, . Citações Web of Science: 31.

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL Y.; PATRIOTA, ALEXANDRE G.. A non-parametric method to estimate the number of clusters. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 73, p. 27-39, . Citações Web of Science: 25.

SATO, JOAO RICARDO; VIDAL, MACIEL CALEBE; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; MASSIRER, KATLIN BRAUER; FUJITA, ANDRE. Complex Network Measures in Autism Spectrum Disorders. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 15, n. 2, p. 581-587, . Citações Web of Science: 3.

FONSECA, MONIQUE T.; RODRIGUES, ABNER C.; CEZAR, LUANA C.; FUJITA, ANDRE; SORIANO, FRANCISCO G.; STEINER, ALEXANDRE A.. Spontaneous hypothermia in human sepsis is a transient, self-limiting, and nonterminal response. Journal of Applied Physiology, v. 120, n. 12, p. 1394-1401, . Citações Web of Science: 12.

RODRIGUES, JULIA DE SOUZA; RIBEIRO, FERNANDA LENITA; SATO, JOAO RICARDO; MESQUITA, RICKSON COELHO; BIAZOLI JUNIOR, CLAUDINEI EDUARDO. Identifying individuals using fNIRS-based cortical connectomes. BIOMEDICAL OPTICS EXPRESS, v. 10, n. 6, p. 2889-2897, . Citações Web of Science: 0.

BUENO, A. P. A.; SATO, J. R.; HORNBERGER, M.. Eye tracking - The overlooked method to measure cognition in neurodegeneration?. Neuropsychologia, v. 133, . Citações Web of Science: 0.

SATO, JOAO RICARDO; BALARDIN, JOANA; VIDAL, MACIEL CALEBE; FUJITA, ANDRE. Identification of segregated regions in the functional brain connectome of autistic patients by a combination of fuzzy spectral clustering and entropy analysis. JOURNAL OF PSYCHIATRY & NEUROSCIENCE, v. 41, n. 2, p. 124-132, . Citações Web of Science: 4.

RAMOS, TAIANE COELHO; BALARDIN, JOANA BISOL; SATO, JOAO RICARDO; FUJITA, ANDRE. Abnormal Cortico-Cerebellar Functional Connectivity in Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN SYSTEMS NEUROSCIENCE, v. 12, . Citações Web of Science: 3.

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; BALARDIN, JOANA BISOL; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO. Correlation between graphs with an application to brain network analysis. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 109, p. 76-92, . Citações Web of Science: 0.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GARCÍA, Juan Manuel Vidal. Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes. 2016. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Matemática e Estatística. Universidade de São Paulo (USP). São Paulo.

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