Arthur Gruber

Possui graduação em Medicina Veterinária pela Universidade de São Paulo (1987), doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela USP (1994) e Livre Docência (2003) pela USP. Atualmente é Professor Associado da Universidade de São Paulo. Tem experiência nas áreas de Biologia Molecular de Protozoários Parasitos, Genômica de Micro-organismos e Bioinformática. Na área de Bioinformática, tem trabalhado no desenvolvimento de algoritmos, sua implementação na forma de aplicativos, e a utilização em dados genômicos e metagenômicos. Entre os aplicativos já desenvolvidos, podem ser citados programas para anotação funcional automática de genomas (EGene), caracterização e quantificação de sequências repetitivas seriadas (TRAP) e a reconstrução de sequências e descoberta de vírus (GenSeed e GenSeed-HMM). Atualmente, a principal linha de pesquisa do grupo objetiva desenvolver abordagens metodológicas para a descoberta de novos vírus. Entre essas abordagens está o programa GenSeed-HMM, aplicativo para a montagem progressiva de sequências a partir de dados metagenômicos que utiliza sementes de HMMs de perfil. Os HMMs de perfil, modelos probabilísticos construídos a partir de alinhamentos de múltiplas sequências, conseguem representar a diversidade das sequências e podem ser utilizados para a detecção de sequências ortólogas evolutivamente remotas. Com isso, é possível se identificar e reconstruir, a partir de dados metagenômicos, sequências genômicas de vírus ainda não identificados previamente, um processo que denominamos diagnóstico de novo. (Fonte: Currículo Lattes)