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Vitor Barbanti Pereira Leite

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Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

obteve Bacharelado em Física, pelo Instituto de Física e Química de São Carlos (IFSC), Universidade de São Paulo (1983), mestrado em Física Aplicada pela Universidade de São Paulo (1988) e doutorado (Ph.D.) em Physics/Biophysics - University of California, San Diego (1995). Foi Professor Associado Visitante na Rice University, no Center for Theoretical Biological Physics, em Houston (2019). Atualmente é professor Livre Docente na Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, campus no Campus de São José do Rio Preto. Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Reações de Transferência de Carga e Enovelamento de Proteinas. (Fonte: Currículo Lattes)

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Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 11/01/2020
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (27)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações26
Citações169
Cit./Artigo6,5
Dados do Web of Science

DE OLIVEIRA, VINICIUS MARTINS; CONTESSOTO, VINICIUS DE GODOI; DA SILVA, FERNANDO BRUNO; ZAGO CAETANO, DANIEL LUCAS; DE CARVALHO, SIDNEY JURADO; PEREIRA LEITE, VITOR BARBANTI. Effects of pH and Salt Concentration on Stability of a Protein G Variant Using Coarse-Grained Models. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 114, n. 1, p. 65-75, . Citações Web of Science: 7.

DAMASIO, ANDRE R. L.; RUBIO, MARCELO V.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; SEGATO, FERNANDO; DIAS, BRUNO A.; CITADINI, ANA P.; PAIXAO, DOUGLAS A.; SQUINA, FABIO M.. Understanding the Function of Conserved Variations in the Catalytic Loops of Fungal Glycoside Hydrolase Family 12. Biotechnology and Bioengineering, v. 111, n. 8, p. 1494-1505, . Citações Web of Science: 13.

HOFFMAM, ZAIRA B.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA M.; DIOGO, JOS A.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; CITADINI, ANA PAULA S.; LEITE, VITOR B. P.; SQUINA, FABIO M.; MURAKAMI, MARIO T.; et al. Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 alpha-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, v. 55, n. 3, p. 260-267, . Citações Web of Science: 7.

COTA, JUNIO; OLIVEIRA, LEANDRO C.; DAMASIO, ANDRE R. L.; CITADINI, ANA P.; HOFFMAM, ZAIRA B.; ALVAREZ, THABATA M.; CODIMA, CARLA A.; LEITE, VITOR B. P.; PASTORE, GLAUCIA; DE OLIVEIRA-NETO, MARIO; et al. Assembling a xylanase-lichenase chimera through all-atom molecular dynamics simulations. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1834, n. 8, p. 1492-1500, . Citações Web of Science: 16.

CONTESSOTO, VINICIUS G.; DE OLIVEIRA, VINICIUS M.; FERNANDES, BRUNO R.; SLADE, GABRIEL G.; LEITE, VITOR B. P.. TKSA-MC: A web server for rational mutation through the optimization of protein charge interactions. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 86, n. 11, p. 1184-1188, . Citações Web of Science: 1.

YANG, HUAN; BANDARKAR, PRASAD; HORNE, RANSOM; LEITE, VITOR B. P.; CHAHINE, JORGE; WHITFORD, PAUL C.. Diffusion of tRNA inside the ribosome is position-dependent. Journal of Chemical Physics, v. 151, n. 8, . Citações Web of Science: 0.

HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; PASCUTTI, PEDRO GERALDO; LEITE, VITOR B. P.. Prediction of Noncompetitive Inhibitor Binding Mode Reveals Promising Site for Allosteric Modulation of Falcipain-2. Journal of Physical Chemistry B, v. 123, n. 34, SI, p. 7327-7342, . Citações Web of Science: 0.

ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; BARRETO GOMES, DIEGO ENRY; HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; PASCUTTI, PEDRO GERALDO. Dissecting a novel allosteric mechanism of cruzain: A computer-aided approach. PLoS One, v. 14, n. 1, . Citações Web of Science: 2.

LIMA, ANGELICA NAKAGAWA; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO; KIMUS BRAZ, ANTONIO SERGIO; DE SOUZA COSTA, MAURICIO GARCIA; PERAHIA, DAVID; BARBOUR SCOTT, LUIS PAULO. Effects of pH and aggregation in the human prion conversion into scrapie form: a study using molecular dynamics with excited normal modes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 47, n. 5, p. 583-590, . Citações Web of Science: 1.

OLIVEIRA, JR., ANTONIO B.; YANG, HUAN; WHITFORD, PAUL C.; LEITE, VITOR B. P.. Distinguishing Biomolecular Pathways and Metastable States. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 15, n. 11, p. 6482-6490, . Citações Web of Science: 0.

VINÍCIUS DE GODOI CONTESSOTO; ANTONIO BENTO DE OLIVEIRA JUNIOR; JORGE CHAHINE; RONALDO JUNIO DE OLIVEIRA; VITOR BARBANTI PEREIRA LEITE. Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados. Revista Brasileira de Ensino de Física, v. 40, n. 4, p. -, .

ARAUJO, GABRIELA C.; SILVA, RICARDO H. T.; SCOTT, LUIS P. B.; ARAUJO, ALEXANDRE S.; SOUZA, FATIMA P.; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO. Structure and functional dynamics characterization of the ion channel of the human respiratory syncytial virus (hRSV) small hydrophobic protein (SH) transmembrane domain by combining molecular dynamics with excited normal modes. Journal of Molecular Modeling, v. 22, n. 12, . Citações Web of Science: 8.

DE SOUZA, ANGELICA R.; DE ARAUJO, GABRIELA C.; ZANPHORLIN, LETICIA M.; RULLER, ROBERTO; FRANCO, FERNANDA C.; TORRES, FERNANDO A. G.; MERTENS, JEFFREY A.; BOWMAN, MICHAEL J.; GOMES, ELENI; DA SILVA, ROBERTO. Engineering increased thermostability in the GH-10 endo-1,4-beta-xylanase from Thermoascus aurantiacus CBMAI 756. International Journal of Biological Macromolecules, v. 93, n. A, p. 20-26, . Citações Web of Science: 9.

MOURO, PAULO RICARDO; CONTESSOTO, VINICIUS DE GODOI; CHAHINE, JORGE; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO; PEREIRA LEITE, VITOR BARBANTI. Quantifying Nonnative Interactions in the Protein-Folding Free-Energy Landscape. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 111, n. 2, p. 287-293, . Citações Web of Science: 6.

COLUSSI, FRANCIELI; DA SILVA, VIVIAM M.; MILLER, IAN; COTA, JUNIO; DE OLIVEIRA, LEANDRO C.; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; SQUINA, FABIO M.; GARCIA, WANIUS. Oligomeric state and structural stability of two hyperthermophilic beta-glucosidases from Thermotoga petrophila. Amino Acids, v. 47, n. 5, p. 937-948, . Citações Web of Science: 9.

COTA, JUNIO; CORREA, THAMY L. R.; DAMASIO, ANDRE R. L.; DIOGO, JOSE A.; HOFFMAM, ZAIRA B.; GARCIA, WANIUS; OLIVEIRA, LEANDRO C.; PRADE, ROLF A.; SQUINA, FABIO M.. Comparative analysis of three hyperthermophilic GH1 and GH3 family members with industrial potential. NEW BIOTECHNOLOGY, v. 32, n. 1, p. 13-20, . Citações Web of Science: 24.

MANDELLI, F.; FRANCO CAIRO, J. P. L.; CITADINI, A. P. S.; BUECHLI, F.; ALVAREZ, T. M.; OLIVEIRA, R. J.; LEITE, V. B. P.; PAES LEME, A. F.; MERCADANTE, A. Z.; SQUINA, F. M.. The characterization of a thermostable and cambialistic superoxide dismutase from Thermus filiformis. Letters in Applied Microbiology, v. 57, n. 1, p. 40-46, . Citações Web of Science: 11.

FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; UCHIMA, CRISTIANE A.; ALVAREZ, THABATA M.; CITADINI, ANA PAULA DA S.; COTA, JUNIO; LEONARDO, FLAVIA COSTA; COSTA-LEONARDO, ANA M.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; COSTA, FERNANDO F.; et al. Deciphering the synergism of endogenous glycoside hydrolase families 1 and 9 from Coptotermes gestroi. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 43, n. 10, p. 970-981, . Citações Web of Science: 16.

DE OLIVEIRA, LEANDRO C.; DA SILVA, VIVIAM M.; COLUSSI, FRANCIELI; CABRAL, ALINE D.; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; SQUINA, FABIO M.; GARCIA, WANIUS. Conformational Changes in a Hyperthermostable Glycoside Hydrolase: Enzymatic Activity Is a Consequence of the Loop Dynamics and Protonation Balance. PLoS One, v. 10, n. 2, . Citações Web of Science: 21.

FREITAS, FREDERICO CAMPOS; LIMA, ANGELICA NAKAGAWA; CONTESSOTO, VINICIUS DE GODOI; WHITFORD, PAUL C.; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO. Drift-diffusion (DrDiff) framework determines kinetics and thermodynamics of two-state folding trajectory and tunes diffusion models. Journal of Chemical Physics, v. 151, n. 11, . Citações Web of Science: 0.

DA SILVA, FERNANDO BRUNO; CONTESSOTO, VINICIUS G.; DE OLIVEIRA, VINICIUS M.; CLARKE, JANE; LEITE, VITOR B. P.. Non-Native Cooperative Interactions Modulate Protein Folding Rates. Journal of Physical Chemistry B, v. 122, n. 48, p. 10817-10824, . Citações Web of Science: 2.

TAMBONIS, TIAGO; BOARETO, MARCELO; LEITE, VITOR B. P.. Differential Expression Analysis in RNA-seq Data Using a Geometric Approach. JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 25, n. 11, p. 1257-1265, . Citações Web of Science: 0.

HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE; ALVAREZ, LILIAN HERNANDEZ; PASCUTTI, PEDRO GERALDO; VALIENTE, PEDRO A.. Predicting binding modes of reversible peptide-based inhibitors of falcipain-2 consistent with structure-activity relationships. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 85, n. 9, p. 1666-1683, . Citações Web of Science: 4.

BRUNI, ALINE THAIS; MARIZ DE CARVALHO, PEDRO OLIVEIRA; PINKE RODRIGUES, CAIO HENRIQUE; PEREIRA LEITE, VITOR BARBANTI. In silico methods in forensic science: Quantum chemistry and multivariate analysis applied to infrared spectra of new amphetamine- and cathinone-derived psychoactive substances. FORENSIC CHEMISTRY, v. 9, p. 21-34, . Citações Web of Science: 2.

HERNANDEZ-GONZALEZ, JORGE E.; SALAS-SARDUY, EMIR; HERNANDEZ RAMIREZ, LUISA F.; PASCUAL, MARIA J.; ALVAREZ, DIEGO E.; PABON, ADRIANA; LEITE, VITOR B. P.; PASCUTTI, PEDRO G.; VALIENTE, PEDRO A.. Identification of (4-(9H-fluoren-9-yl) piperazin-1-yl) methanone derivatives as falcipain 2 inhibitors active against Plasmodium falciparum cultures. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1862, n. 12, p. 2911-2923, . Citações Web of Science: 0.

POLOTTO, FRANCIELE; DRIGO FILHO, ELSO; CHAHINE, JORGE; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO. Supersymmetric quantum mechanics method for the Fokker-Planck equation with applications to protein folding dynamics. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS, v. 493, p. 286-300, . Citações Web of Science: 4.

CORONADO, MONIKA A.; CARUSO, ICARO P.; DE OLIVEIRA, VINICIUS M.; CONTESSOTO, VINICIUS G.; LEITE, VITOR B. P.; KAWAI, LIEGE A.; ARNI, RAGHUVIR K.; EBERLE, RAPHAEL J.. Cold Shock Protein A from Corynebacterium pseudotuberculosis: Role of Electrostatic Forces in the Stability of the Secondary Structure. PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, v. 24, n. 4, p. 358-367, . Citações Web of Science: 6.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA, Ronaldo Júnio de. Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteína. 2011. 115f. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Campus de São José do Rio Preto). São José do Rio Preto.

LIMA, Débora Tavares de. Regimes de frustração ótima em enovelamento de proteínas com modelos baseado em estrutura. 2012. 36f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto.

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