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Helder Takashi Imoto Nakaya

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Universidade de São Paulo (USP). Centro de Inovação da USP (INOVA)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Helder Nakaya é biólogo da Universidade de São Paulo e doutor em Bioquímica pelo Departamento de Bioquímica do IQ USP. O doutorado foi voltado para a área de Biologia Molecular e Bioinformática. De 2008 a 2011, como pós-doutor na Emory University, Atlanta (USA) pesquisou o mecanismo de atuação de vacinas em células do sistema imune utilizando técnicas em larga escala. Se tornou professor assistente do Departamento de Patologia da Emory University em 2011, onde utiliza a biologia de sistemas para prever e entender a resposta imune a diferentes vacinas. Atualmente é docente do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP e professor adjunto da Emory University. É membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências, consultor da CEPI (Coalition for Epidemic Preparedness Innovations) e membro do Scientific Advisory Board do consórcio europeu da vacina do Ebola. Website do laboratório de Biologia de Sistemas Computacional: www.csbiology.com (Fonte: Currículo Lattes)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a)
SARS-CoV-2 usa estratégia similar à do HIV para infectar células de defesa  
SARS-CoV-2 usa estratégia similar à do HIV para infectar células de defesa  
Un estudio muestra la influencia de la edad y el sexo sobre el perfil clínico del COVID-19 en Brasil 
Study shows influence of biological sex and age on clinical profile of COVID-19 in Brazil 
Refluxo gastroesofágico pode aumentar o risco de morte por COVID-19, aponta estudo 
Científicos develan de qué manera el zika puede afectar al cerebro del bebé durante la gestación 
Researchers discover how infection by Zika virus during pregnancy can affect the fetal brain 
Estudo mostra a influência de idade e sexo no perfil clínico da COVID-19  
Expertos discuten el rastreo como forma de planificación de las acciones de combate contra el COVID-19 
El aprendizaje de máquinas imprime mayor eficacia al reposicionamiento de psicofármacos 
Machine learning makes drug repurposing for psychiatric disorders more effective 
Specialists discuss contact tracing as a tool to plan action against COVID-19 
Especialistas discutem rastreamento como forma de planejar ações de combate à COVID-19 
Especialistas discutem rastreamento como forma de planejar ações de combate à COVID-19 
FAPESP COVID-19 Research Webinars - Contact tracing and lockdown easing plan: Effectiveness x Limitations 
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Aprendizado de máquina torna reposicionamento de fármacos para transtornos psiquiátricos mais efetivo  
Aprendizado de máquina torna reposicionamento de fármacos para transtornos psiquiátricos mais efetivo  
Estudian las células inmunitarias del tejido adiposo para entender la inflamación asociada a la obesidad 
Researchers will study body fat immune cells to understand obesity-associated inflammation 
Pesquisadores desvendam como a infecção por zika na gestação pode afetar o cérebro do bebê 
Pesquisadores desvendam como a infecção por zika na gestação pode afetar o cérebro do bebê 
Científicos develan el mecanismo que vuelve más grave al COVID-19 en diabéticos 
Researchers discover mechanism that makes COVID-19 more severe in diabetics 
Pesquisadores desvendam mecanismo que torna COVID-19 mais grave em diabéticos 
Pesquisadores desvendam mecanismo que torna COVID-19 mais grave em diabéticos 
Pós-doutorado em bioinformática no Centro de Inovação da USP 
Pós-doutorado em bioinformática no Centro de Inovação da USP 
Grupo vai estudar células imunes de tecido adiposo para entender a inflamação associada à obesidade 
Grupo vai estudar células imunes de tecido adiposo para entender a inflamação associada à obesidade 
En pacientes con SARS-CoV-2 y dolencias crónicas se registra un aumento de cierta expresión génica 
Patients with chronic diseases display increased expression of gene that facilitates SARS-CoV-2 infection 
Paciente com doença crônica tem expressão aumentada de gene que facilita infecção pelo coronavírus 
Paciente com doença crônica tem expressão aumentada de gene que facilita infecção pelo coronavírus 
Pós-doutorado em bioinformática no Incor 
Pós-doutorado em bioinformática no Incor 
Estudian la infección aguda por chikunguña a nivel molecular en pacientes de Brasil 
Acute chikungunya infection studied at the molecular level in Brazilian patients 
Infecção aguda pelo chikungunya é estudada em nível molecular em pacientes brasileiros 
Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias da FAPESP oferece vagas de pós-doutorado 
Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias da FAPESP oferece vagas de pós-doutorado 
Instituto Pasteur inaugura Plataforma Científica na USP 
Instituto Pasteur inaugura Plataforma Científica na USP 
Identifican un mecanismo celular clave que desencadena la neumonía en humanos 
Study identifies a key cellular mechanism that triggers pneumonia in humans 
Identificado mecanismo celular chave que desencadeia a pneumonia em humanos 
Identificado mecanismo celular chave que desencadeia a pneumonia em humanos 
Tools and Platforms for Phenotypic Drug Discovery 
Tools and Platforms for Phenotypic Drug Discovery 
Identifican genes relacionados con la progresión del melanoma 
Genes associated with progression of melanoma are identified 
Grupo da USP identifica genes relacionados à progressão do melanoma 
Una aplicación servirá para mapear casos asintomáticos de enfermedades transmisibles 
Aplicativo pretende mapear casos assintomáticos de sete doenças transmissíveis 
Aplicativo pretende mapear casos assintomáticos de sete doenças transmissíveis 
Biologia de sistemas de doenças infecciosas e vacinas 
Biologia de sistemas de doenças infecciosas e vacinas 
Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Bolsas no Exterior
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 17/10/2020
Colaboradores mais frequentes em auxílios e bolsas FAPESP
Contate o Pesquisador

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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Análise de sequência de RNA Aprendizado computacional Artrite juvenil Artrite Bases de dados científicos Bases de dados Big data Biologia Geral Biologia Molecular Biologia computacional Biologia de sistemas Biomarcadores tumorais Biomarcadores Bioquímica Cardiologia Ciência da Computação Ciências Biológicas Ciências Exatas e da Terra Ciências da Saúde Cooperação internacional Degeneração neural Doenças inflamatórias Doenças transmissíveis Epidemiologia Estatística computacional Expressão gênica Farmacologia Bioquímica e Molecular Farmacologia Febre amarela Fisiopatologia Genomas Grafos Imunidade nas mucosas Imunogenética Imunologia Aplicada Imunologia Infecção Inflamação Interação proteína-proteína Interdisciplinar Interferon gama Mamíferos Metodologia e Técnicas da Computação MicroRNAs Microbiota Neoplasias da próstata Neurociências Obesidade Ontologias (organização da informação) Orthomyxoviridae Peste suína clássica Plataforma (computação) Processamento de imagens Processamento de linguagem natural Prognóstico RNA longo não codificante RNA não traduzido Redes reguladoras de genes Regulação da expressão gênica Reumatologia São Paulo (SP) Saúde Coletiva Sepse Sequência conservada Síndrome metabólica Sistema de posicionamento global (GPS) Suínos Transcrição genética Transcriptoma Transcriptômica Transmissão de doença infecciosa Vacinas Vírus Chikungunya Vírus Zika Vírus da dengue Vírus da febre amarela Vírus da febre suína clássica Vírus de RNA
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (18)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações18
Citações76
Cit./Artigo4,2
Dados do Web of Science

FUKUTANI, KIYOSHI F.; NASCIMENTO-CARVALHO, CRISTIANA M.; BOUZAS, MAIARA L.; OLIVEIRA, JULIANA R.; BARRAL, ALDINA; DIERCKX, TIM; KHOURI, RICARDO; NAKAYA, HELDER I.; ANDRADE, BRUNO B.; VAN WEYENBERGH, JOHAN; et al. In situ Immune Signatures and Microbial Load at the Nasopharyngeal Interface in Children With Acute Respiratory Infection. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, . Citações Web of Science: 0. (12/19278-6, 17/50137-3)

BLOHMKE, CHRISTOPH J.; HILL, JENNIFER; DARTON, THOMAS C.; CARVALHO-BURGER, MATHEUS; EUSTACE, ANDREW; JONES, CLAIRE; SCHREIBER, FERNANDA; GOODIER, MARTIN R.; DOUGAN, GORDON; NAKAYA, HELDER I.; et al. Induction of Cell Cycle and NK Cell Responses by Live-Attenuated Oral Vaccines against Typhoid Fever. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 8, . Citações Web of Science: 5. (14/50828-8, 12/19278-6)

SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; BAPTISTA CRUZ, NATALIA; DE CASTRO-JORGE, LUIZA ANTUNES; HOMEM DE CARVALHO, RENAN VILLANOVA; DOS SANTOS, CLIOMAR ALVES; DA ROS, NANCY; OLIVEIRA, URSULA; COSTA, DANUZA DUARTE; SIMOES DOS SANTOS, CECILIA LUIZA; CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS; et al. Systems analysis of subjects acutely infected with the Chikungunya virus. PLOS PATHOGENS, v. 15, n. 6, . Citações Web of Science: 4. (13/08216-2, 17/50137-3, 15/25055-8, 12/19278-6, 13/07467-1, 16/08204-2)

FERREIRA, GUSTAVO RODRIGUES; NAKAYA, HELDER IMOTO; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. Gene regulatory and signaling networks exhibit distinct topological distributions of motifs. Physical Review E, v. 97, n. 4, . Citações Web of Science: 0. (14/19323-7, 12/19278-6, 15/22308-2)

BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. Neuroinflammation at single cell level: What is new?. Journal of Leukocyte Biology, . Citações Web of Science: 0. (13/08216-2, 18/21934-5, 17/50137-3, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/22504-1, 17/21363-5, 18/14933-2, 19/06372-3)

GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; LEE, EVA K.; SORGI, SARA; DE LIMA, DIOGENES S.; URBANSKI, ALYSSON H.; SILVEIRA, EDUARDO LV; NAKAYA, HELDER I.. Methods for predicting vaccine immunogenicity and reactogenicity. HUMAN VACCINES & IMMUNOTHERAPEUTICS, v. 16, n. 2, . Citações Web of Science: 1. (13/08216-2, 18/21934-5, 18/14933-2)

CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; et al. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, . Citações Web of Science: 1. (19/12000-1, 17/13981-0, 19/21301-5, 18/14389-0, 19/07544-2, 18/17176-8, 16/00194-8, 20/04836-0, 16/18445-7, 20/04558-0, 18/25468-9, 18/09383-3, 19/24251-9, 18/14933-2)

SCHRODER, WAYNE A.; HIRATA, THIAGO D.; LE, THUY T.; GARDNER, JOY; BOYLE, GLEN M.; ELLIS, JONATHAN; NAKAYAMA, ERI; PATHIRANA, DILAN; NAKAYA, HELDER I.; SUHRBIER, ANDREAS. SerpinB2 inhibits migration and promotes a resolution phase signature in large peritoneal macrophages. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . Citações Web of Science: 0. (17/17345-1, 14/24162-2)

MASTELIC-GAVILLET, BEATRIS; VONO, MARIA; GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; FERREIRA, FREDERICO MORAES; CARDOZO, LUCAS; LAMBERT, PAUL-HENRI; NAKAYA, I, HELDER; SIEGRIST, CLAIRE-ANNE. Neonatal T Follicular Helper Cells Are Lodged in a Pre-T Follicular Helper Stage Favoring Innate Over Adaptive Germinal Center Responses. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 10, . Citações Web of Science: 0. (12/19278-6, 17/50137-3)

AMARAL, PAULO P.; LEONARDI, TOMMASO; HAN, NAMSHIK; VIRE, EMMANUELLE; GASCOIGNE, DENNIS K.; ARIAS-CARRASCO, RAUL; BUSCHER, MAGDALENA; PANDOLFINI, LUCA; ZHANG, ANDA; PLUCHINO, STEFANO; et al. Genomic positional conservation identifies topological anchor point RNAs linked to developmental loci. Genome Biology, v. 19, . Citações Web of Science: 31. (14/50308-4)

ARIAS-CARRASCO, RAUL; VASQUEZ-MORAN, YESSENIA; NAKAYA, HELDER I.; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS. StructRNAfinder: an automated pipeline and web server for RNA families prediction. BMC Bioinformatics, v. 19, . Citações Web of Science: 3. (12/19278-6)

CARDOZO, LUCAS E.; RUSSO, PEDRO S. T.; GOMES-CORREIA, BRUNO; ARAUJO-PEREIRA, MARIANA; SEPULVEDA-HERMOSILLA, GONZALO; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, I, HELDER. webCEMiTool: Co-expression Modular Analysis Made Easy. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . Citações Web of Science: 1. (13/08216-2, 12/19278-6, 18/10748-6, 17/05762-7)

AMARAL, PAULO P.; LEONARDI, TOMMASO; HAN, NAMSHIK; VIRE, EMMANUELLE; GASCOIGNE, DENNIS K.; ARIAS-CARRASCO, RAUL; BUSCHER, MAGDALENA; PANDOLFINI, LUCA; ZHANG, ANDA; PLUCHINO, STEFANO; et al. Genomic positional conservation identifies topological anchor point RNAs linked to developmental loci. Genome Biology, v. 19, . Citações Web of Science: 31. (14/50308-4)

GONCALVES, ANDRE N. A.; LEVER, MELISSA; RUSSO, PEDRO S. T.; GOMES-CORREIA, BRUNO; URBANSKI, ALYSSON H.; POLLARA, GABRIELE; NOURSADEGHI, MAHDAD; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, I, HELDER. Assessing the Impact of Sample Heterogeneity on Transcriptome Analysis of Human Diseases Using MDP Webtool. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . Citações Web of Science: 0. (13/08216-2, 12/19278-6, 18/14933-2)

JEAN PIERRE SCHATZMANN PERON; HELDER NAKAYA. Susceptibility of the Elderly to SARS-CoV-2 Infection: ACE-2 Overexpression, Shedding, and Antibody-dependent Enhancement (ADE). Clinics, v. 75, p. -, . Citações Web of Science: 1. (12/19278-6, 13/08216-2, 18/14933-2, 18/21934-5, 17/22504-1)

MASTELIC-GAVILLET, BEATRIS; VONO, MARIA; GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; FERREIRA, FREDERICO MORAES; CARDOZO, LUCAS; LAMBERT, PAUL-HENRI; NAKAYA, I, HELDER; SIEGRIST, CLAIRE-ANNE. Neonatal T Follicular Helper Cells Are Lodged in a Pre-T Follicular Helper Stage Favoring Innate Over Adaptive Germinal Center Responses. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 10, . Citações Web of Science: 0. (12/19278-6, 17/50137-3)

JOCHEMS, SIMON P.; MARCON, FERNANDO; CARNIEL, BEATRIZ F.; HOLLOWAY, MARK; MITSI, ELENA; SMITH, EMMA; GRITZFELD, JENNA F.; SOLORZANO, CARLA; REINE, JESUS; POJAR, SHERIN; et al. Inflammation induced by influenza virus impairs human innate immune control of pneumococcus. NATURE IMMUNOLOGY, v. 19, n. 12, p. 1299+, . Citações Web of Science: 13. (13/08216-2, 12/19278-6)

DE LIMA, DIOGENES S.; CARDOZO, LUCAS E.; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; SUHRBIER, ANDREAS; MANE, KARIM; JEFFRIES, DAVID; SILVEIRA, EDUARDO L. V.; AMARAL, PAULO P.; RAPPUOLI, RINO; DE SILVA, THUSHAN I.; et al. Long noncoding RNAs are involved in multiple immunological pathways in response to vaccination. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 116, n. 34, p. 17121-17126, . Citações Web of Science: 1. (13/08216-2, 12/19278-6, 17/50137-3)

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