CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Centro de Inovação da USP (INOVA) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Professor associado do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas da FCF USP e professor adjunto da Emory University. É membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências, consultor da CEPI (Coalition for Epidemic Preparedness Innovations) e membro do Scientific Advisory Board do consórcio europeu da vacina do Ebola. Helder Nakaya é biólogo da Universidade de São Paulo e doutor em Bioquímica pelo Departamento de Bioquímica do IQ USP. O doutorado foi voltado para a área de Biologia Molecular e Bioinformática. De 2008 a 2011, como pós-doutor na Emory University, Atlanta (USA) pesquisou o mecanismo de atuação de vacinas em células do sistema imune utilizando técnicas em larga escala. Se tornou professor assistente do Departamento de Patologia da Emory University em 2011, onde utiliza a biologia de sistemas para prever e entender a resposta imune a diferentes vacinas. Website do laboratório de Biologia de Sistemas Computacional: www.csbiology.com (Fonte: Currículo Lattes)
A Peste Suína Clássica (PSC) é uma doença contagiosa, hemorrágica e muitas vezes fatal de Suidae, como porcos e javalis, causada pelo vírus da peste suína clássica (CSFV). O CSFV é um vírus de RNA de fita simples, envelopado, que pertence à família Flaviviridae (Moennig, 2000), relacionado, por exemplo, ao vírus da Zika e da Febre Amarela. O CSFV pode ser controlado por vacinação, particu…
A importância da Estatística nas ciências naturais é inquestionável. A Estatística é essencial para analisar dados de forma apropriada e também obter conclusões confiáveis. No entanto, pouco se é conhecido sobre métodos estatísticos formais em grafos e suas propriedades teóricas mesmo com o aumento no número de artigos relacionados com redes do mundo real (por ex., redes funcionais de cér…
Dados relacionados com a saúde humana, desde informações clínicas e epidemiológicas até imagens médicas e experimentos ômicos, estão sendo gerados e acumulados em uma quantidade sem precedentes na história. A análise e integração destas informações são fundamentais para melhorar nosso entendimento sobre a fisiopatologia das doenças, sua transmissão, assim como seu diagnóstico e tratamento…
Este projeto irá promover uma colaboração com financiamento próprio, entre os laboratórios do Dr. Thushan de Silva e Dr. Beate Kampmann da Imperial College London e o grupo do Dr. Helder Nakaya (FCF-USP) na USP. Aplicando uma abordagem de biologia de sistemas de ponta para integrar dados de microbioma nasofaríngeo, transcritoma de sangue e mucosa e dados clínicos e imunológicos. Nós iremo…
Doenças infecciosas causadas por patógenos entéricos são endêmicos em países em desenvolvimento e são responsáveis por milhares de mortes todos os anos. Esta proposta irá focar na febre causada pela Salmonella Typhi e Paratyphi como modelo de infecção intestinal. A febre tifoide afeta significativamente a América do Sul, África subsaariana e o sudeste asiático com aproximadamente 22 milhõ…
Estima-se que milhares de longos RNAs não-codificadores (IncRNAs) sejam gerados a partir da transcrição do genoma de diversos organismos. O grupo do Dr. Kouzarides na Universidade de Cambridge reanalisou uma grande quantidade de dados de RNA-seq e identificou -600 IncRNAs com "posições conservadas" (peRNAs) nos genomas humano e de camundongo. Dentre os genes associados com estes pcRNAs, f…
Nos últimos anos, a importância de estudar as comunidades microbianas presentes no intestino humano tem sido amplamente elucidada. Essas comunidades microbianas não apenas contribuem para a defesa local dos hospedeiros contra infecções, mas também modulam as respostas do sistema imunológico em diferentes locais e tecidos. O microbioma humano é dinâmico e, sob condições que comprometem a b…
O presente plano de trabalho tem por objetivo extrair características fenotípicas das espécies de parasitas Trypanosoma, Plasmodium e Leishmania em imagens derivadas de microscopia. Tais características consistem em atributos de curvatura (mínimo, máximo, média, desvio padrão, variância, entropia e energia potencial); geométricos (área, circularidade, proporção, perímetro, distâncias máxi…
O Human Cell Atlas é um projeto internacional que visa caracterizar todos os tipos celulares do corpo humano. Os pesquisadores envolvidos caracterizarão diversos tecidos humanos, empregando técnicas como sequenciamento de RNA para células únicas, citometria de massa e hibridação in situ multiplexada. A riqueza dos dados gerados tem um potencial para revolucionar a pesquisa biomédica, mas …
Doenças neurodegenerativas e doenças causadas por agentes infecciosos são responsáveis por um grande ônus à saúde humana, tanto no Brasil quanto no mundo. Esses problemas tendem a aumentar nas próximas décadas, devido ao envelhecimento da população e ao aumento da resistência microbiana a antibióticos.O sistema imune periférico é capaz de modificar processos fisiológicos e patológicos do …
Zika vírus (ZIKV) é um arbovírus que ganhou alta relevância nos últimos anos. Surtos da infecção começaram a se tornar frequentes globalmente a partir do ano de 2007, com uma epidemia na Micronésia. Desde então, cinco dos sete continentes foram afetados. Indivíduos infectados comumente apresentam sintomas similares aos de outros arbovírus, como dengue. Entretanto, a infecção por Zika pode…
A Artrite Idiopática Juvenil (JIA) é reconhecida mundialmente como a doença reumatológica mais comum em pacientes pediátricos. Apesar da ausência de dados oficiais sobre a prevalência desta condição no Brasil, 464 novos casos foram diagnosticados em 2010 na cidade de São Paulo, constituindo a condição reumatológica pediátrica mais comum nesta localidade. Os pacientes brasileiros parecem t…
A Síndrome metabólica (SM) é composta de uma série de doenças no qual o imunometabolismo e inflamação tem uma grande influência. O aumento da prevalência de obesidade e SM tem levados os pesquisadores a investigar a influência em enfermidades inflamatórias crônicas. Entretanto, pouco se sabe sobre as vias moleculares e redes gênicas em comum entre a SM e doenças inflamatórias. A fim de in…
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
| Publicações | 22 |
| Citações | 111 |
| Cit./Artigo | 5,0 |
| Dados do Web of Science | |
FUKUTANI, KIYOSHI F.; NASCIMENTO-CARVALHO, CRISTIANA M.; BOUZAS, MAIARA L.; OLIVEIRA, JULIANA R.; BARRAL, ALDINA; DIERCKX, TIM; KHOURI, RICARDO; NAKAYA, HELDER I.; ANDRADE, BRUNO B.; VAN WEYENBERGH, JOHAN; et al. In situ Immune Signatures and Microbial Load at the Nasopharyngeal Interface in Children With Acute Respiratory Infection. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, NOV 9 2018. Citações Web of Science: 0. (12/19278-6, 17/50137-3)
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SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; BAPTISTA CRUZ, NATALIA; DE CASTRO-JORGE, LUIZA ANTUNES; HOMEM DE CARVALHO, RENAN VILLANOVA; DOS SANTOS, CLIOMAR ALVES; DA ROS, NANCY; OLIVEIRA, URSULA; COSTA, DANUZA DUARTE; SIMOES DOS SANTOS, CECILIA LUIZA; CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS; et al. Systems analysis of subjects acutely infected with the Chikungunya virus. PLOS PATHOGENS, v. 15, n. 6, JUN 2019. Citações Web of Science: 4. (17/50137-3, 12/19278-6, 13/07467-1, 13/08216-2, 15/25055-8, 16/08204-2)
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PINTO, BRUNA G. G.; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; SINGH, YOUVIKA; JIMENEZ, LEANDRO; GONCALVES, ANDRE N. A.; OGAVA, RODRIGO L. T.; CREIGHTON, RACHEL; SCHATZMANN PERON, JEAN PIERRE; NAKAYA, I, HELDER. ACE2 Expression Is Increased in the Lungs of Patients With Comorbidities Associated With Severe COVID-19. Journal of Infectious Diseases, v. 222, n. 4, p. 556-563, AUG 15 2020. Citações Web of Science: 35. (17/50137-3, 12/19278-6, 13/08216-2, 18/21934-5, 18/14933-2)
FERREIRA, GUSTAVO RODRIGUES; NAKAYA, HELDER IMOTO; COSTA, LUCIANO DA FONTOURA. Gene regulatory and signaling networks exhibit distinct topological distributions of motifs. Physical Review E, v. 97, n. 4, APR 27 2018. Citações Web of Science: 0. (14/19323-7, 12/19278-6, 15/22308-2)
SCHRODER, WAYNE A.; HIRATA, THIAGO D.; LE, THUY T.; GARDNER, JOY; BOYLE, GLEN M.; ELLIS, JONATHAN; NAKAYAMA, ERI; PATHIRANA, DILAN; NAKAYA, HELDER I.; SUHRBIER, ANDREAS. SerpinB2 inhibits migration and promotes a resolution phase signature in large peritoneal macrophages. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, AUG 27 2019. Citações Web of Science: 0. (17/17345-1, 14/24162-2)
CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; et al. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. Citações Web of Science: 1. (18/25468-9, 16/00194-8, 17/13981-0, 20/04558-0, 19/24251-9, 18/14389-0, 20/04836-0, 16/18445-7, 19/07544-2, 19/12000-1, 19/21301-5, 18/09383-3, 18/17176-8, 18/14933-2)
BLOHMKE, CHRISTOPH J.; HILL, JENNIFER; DARTON, THOMAS C.; CARVALHO-BURGER, MATHEUS; EUSTACE, ANDREW; JONES, CLAIRE; SCHREIBER, FERNANDA; GOODIER, MARTIN R.; DOUGAN, GORDON; NAKAYA, HELDER I.; et al. Induction of Cell Cycle and NK Cell Responses by Live-Attenuated Oral Vaccines against Typhoid Fever. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 8, OCT 12 2017. Citações Web of Science: 5. (12/19278-6, 14/50828-8)
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MASTELIC-GAVILLET, BEATRIS; VONO, MARIA; GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; FERREIRA, FREDERICO MORAES; CARDOZO, LUCAS; LAMBERT, PAUL-HENRI; NAKAYA, I, HELDER; SIEGRIST, CLAIRE-ANNE. Neonatal T Follicular Helper Cells Are Lodged in a Pre-T Follicular Helper Stage Favoring Innate Over Adaptive Germinal Center Responses. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 10, AUG 13 2019. Citações Web of Science: 0. (12/19278-6, 17/50137-3)
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