- Auxílios pontuais (curta duração)
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Roberto Kopke Salinas
CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Estados Unidos
Possui graduação em Química pela Universidade de São Paulo (1996), mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (2000) e doutorado em Química pela Universidade de Utrecht, Holanda (2005). Fez pós-doutoramento no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo (2005-2008) e no Departamento de Química e Bioquímica da Universidade Estadual da Florida (2009-2011). Atualmente é Professor Doutor no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. Possui experiência em Biofísica, com ênfase em Biofísica Molecular, atuando principalmente na aplicação de métodos de Ressonância Magnética Nuclear para o estudo da estrutura e da dinâmica de proteínas em solução, e de complexos envolvendo proteínas e outras biomoléculas. Também possui experiência na aplicação de métodos de simulação computacional (docking) para estudar interações entre proteínas. (Fonte: Currículo Lattes)
Auxílios à pesquisa
- Estrutura e função de sistemas de secreção bacterianas, AP.TEM
Resumo
Bactérias possuem complexos multiproteicos grandes (multi-mega Dalton) que transportam proteínas efetoras através de membranas bacterianas para o meio extracelular ou diretamente dentro de outras células. Esses sistemas também medeiam a transferência horizontal de material genético (conjugação) entre células bacterianas e formas homólogas especializadas desses sistemas evoluíram para p...
- Implementação de técnicas modernas de RMN multidimensional heteronuclear no instrumento de 800 MHz da Central Analítica do IQUSP, AV.EXT
Resumo
O objetivo desta proposta é aproveitar a visita do Dr. Adrien Favier ao "4th French-Brazilian Symposium on Biosciences", que será realizado entre 6 e 7 de novembro de 2018 no Rio de Janeiro, para trazê-lo para visitar a Universidade de São Paulo. Adrien é engenheiro de pesquisa especialista em Ressonância Magnética Nuclear (RMN) do CNRS (Centre Nacional de la Recherche Scientifique), a...
- Estudos estruturais acerca do trocador de Na+/Ca2+ e de proteínas do Vírus Zika por espectroscopia de ressonância magnética nuclear em solução, AP.R
Resumo
O objetivo deste projeto de pesquisa é dar continuidade a estudos estruturais e mecanísticos acerca do trocador de Na+/Ca2+ (NCX) utilizando para isso Ressonância Magnética Nuclear (RMN) em solução. O NCX é um dos principais mecanismos de extrusão de Ca2+ intracelular em células cardíacas. Além de transportar Na+ e Ca2+, o NCX também é regulado por estes íons. O NCX é uma proteína gran...
- Multidimensional NMR in Structural Biology, AO.R
Resumo
We propose to organize a school on Nuclear Magnetic Resonance (NMR) in Structural Biology at the Institute of Chemistry of the University of São Paulo. The school will be divided in three sections. The first two correspond to introductory NMR courses that will follow the scheme usually adopted by the Brazilian NMR Users Association (AUREMN). In these sections, Brazilian scientists will...
Bolsas no país
- Estudos de cryo-EM sobre os sistemas de secreção Tipo IV Xanthomonadaceae, BP.PD
Resumo
Bactérias utilizam diferentes sistemas de secreção para translocar macromoléculas através do envelope celular. O Sistema de secreção do tipo IV (T4SS) do fitopatógeno Xanthomonas citri é responsável pela secreção de toxinas que matam outras bactérias Gram-negativas. Os T4SSs são sistemas supramoleculares, formados por dois subcomplexos, o complexo principal (~ 1 MDa) e o complexo da me...
- Estudo das proteínas PrlC e PA14_00800 de Pseudomonas aeruginosa, BP.IC
Resumo
Pseudomonas aeruginosa é uma proteobacteria do grupo gama de grande relevância no cenário medico mundial, sendo um patógeno oportunista responsável por vários dos casos de infecção hospitalar. O estudo de sua fisiologia e comportamento é indispensável para entendimento do organismo e para o desenvolvimento de tratamentos eficazes, visto que esta bactéria é intrinsecamente resistente à ...
- Trocadores de Na+/Ca2+: relação entre estrutura e função, BP.DD
Resumo
Proteínas de membrana correspondem a cerca de 30% dos genes de organismos eucarióticos e procarióticos, e a aproximadamente 60% dos alvos para o desenvolvimento de novas drogas. Apesar disso, as proteínas de membrana correspondem a cerca de 3% das estruturas depositadas no PDB. Os trocadores de Na+/Ca2+ (NCX) são proteínas de membrana absolutamente essenciais para a manutenção da homeo...
- Estudos de dinâmica de proteínas por ressonância magnética nuclear em solução, BP.PD
Resumo
A compreensão de fenômenos de interesse biológico, tais como alosteria, cooperatividade e reconhecimento molecular, está intimamente ligada ao conhecimento das estruturas tridimensionais das moléculas em questão, e com resolução atômica. No entanto, a estrutura tridimensional de uma proteína em sua forma nativa corresponde a um ensemble de diferentes estados conformacionais. Dessa form...
- Estudos estruturais de fragmentos do trocador de Na+/Ca2+ por RMN em solução, BP.MS
Resumo
Proteínas de membrana estão envolvidas em processos fisiológicos essenciais como, por exemplo, a manutenção do equilíbrio iônico e sinalização intracelular. No entanto, apesar do seu envolvimento em inúmeros processos fisiológicos relevantes e de grande interesse farmacêutico, o estudo estrutural de proteínas de membrana ainda é um processo custoso, e muito mais complexo do que o estud...
- Produção de fragmentos das porções transmembranares do trocador de Na+/Ca2+ de Drosophila melanogaster para estudos estruturais., BP.MS
Resumo
Os trocadores de Na+/Ca2+ (NCX) utilizam a energia do gradiente eletroquímico do Na+ para transportar Ca2+ para o meio extracelular contra o seu gradiente de concentração. Dessa forma, os NCX são essenciais para a manutenção da homeostase de Ca2+ intracelular em diferentes tipos de células. Os NCX são compostos por dois domínios de 5 hélices transmembranares, separados por uma grande a...
Angiotensina ii
Biofísica Molecular
Biofísica
Biologia Molecular
Biologia estrutural
Bioquímica
Cálcio
Ciências Biológicas
Cristalografia de proteínas
Dicroísmo Circular
Dobramento de proteína
Fluorescência
Interação proteína-proteína
Metabolômica
Microscopia eletrônica
Proteínas da membrana
Proteínas de Membrana
Proteínas
Química de Macromoléculas
Ressonância magnética nuclear
Simulação de acoplamento molecular
Simulação de dinâmica molecular
Vírus Zika
Xanthomonas citri
Xanthomonas
Zika vírus
Zika virus
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
| Publicações | 7 |
| Citações | 45 |
| Cit./Artigo | 6,4 |
| Dados do Web of Science | |
SOUZA, DIORGE P.; ANDRADE, MAXUEL O.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; ARANTES, GUILHERME M.; FARAH, CHUCK S.; SALINAS, ROBERTO K.. A Component of the Xanthomonadaceae Type IV Secretion System Combines a VirB7 Motif with a N0 Domain Found in Outer Membrane Transport Proteins. PLOS PATHOGENS, v. 7, n. 5, p. e1002031, 2011. Citações Web of Science: 33. (05/59243-3, 07/52735-3, 06/61091-0)
DAMASCENO, TICIANE F.; DIAS, RENATA O.; DE OLIVEIRA, JULIANA R.; SALINAS, ROBERTO K.; JULIANO, MARIA A.; FERREIRA, CLELIA; TERRA, WALTER R.. Active subsite properties, subsite residues and targeting to lysosomes or midgut lumen of cathepsins L from the beetle Tenebrio molitor. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 89, p. 17-30, OCT 2017. Citações Web of Science: 2. (11/51685-8, 16/07490-1, 15/19541-7)
OLIVEIRA, LUCIANA COUTINHO; SOUZA, DIORGE PAULO; OKA, GABRIEL UMAJI; LIMA, FILIPE DA SILVA; OLIVEIRA, RONALDO JUNIO; FAVARO, DENIZE CRISTINA; WIENK, HANS; BOELENS, ROLF; FARAH, CHUCK SHAKER; SALINAS, ROBERTO KOPKE. VirB7 and VirB9 Interactions Are Required for the Assembly and Antibacterial Activity of a Type IV Secretion System. Structure, v. 24, n. 10, p. 1707-1718, OCT 4 2016. Citações Web of Science: 4. (13/17883-2, 11/07777-5)
ABIKO, LAYARA AKEMI; VITALE, PHELIPE M.; FAVARO, DENIZE C.; HAUK, PRICILA; LI, DA-WEI; YUAN, JIAQI; BRUSCHWEILER-LI, LEI; SALINAS, ROBERTO K.; BRUSCHWEILER, RAFAEL. Model for the allosteric regulation of the Na+/Ca2+ exchanger NCX. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 84, n. 5, p. 580-590, MAY 2016. Citações Web of Science: 3. (13/50355-0, 13/17883-2, 11/07777-5)
SANZ, MIRIAM; SALINAS, ROBERTO KOPKE; PINTO, ERNANI. Namalides B and C and Spumigins K-N from the Cultured Freshwater Cyanobacterium Sphaerospermopsis torques-reginae. Journal of Natural Products, v. 80, n. 9, p. 2492-2501, SEP 2017. Citações Web of Science: 2. (12/25272-0, 14/50420-9, 16/07490-1)
SAYEGH, RAPHAEL S. R.; TAMAKI, FABIO K.; MARANA, SANDRO R.; SALINAS, ROBERTO K.; ARANTES, GUILHERME M.. Conformational flexibility of the complete catalytic domain of Cdc25B phosphatases. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 84, n. 11, p. 1567-1575, NOV 2016. Citações Web of Science: 1. (14/19439-5, 13/17883-2, 08/55914-9, 12/00543-1, 14/21900-2)
SARAIVA, G. K. V.; DE SOUZA, V. V.; COUTINHO DE OLIVEIRA, L.; NORONHA, M. L. C.; MASINI, J. C.; CHAIMOVICH, H.; SALINAS, R. K.; FLORENZANO, F. H.; CUCCOVIA, I. M.. Characterization of PMMA-b-PDMAEMA aggregates in aqueous solutions. COLLOID AND POLYMER SCIENCE, v. 297, n. 4, p. 557-569, APR 2019. Citações Web of Science: 0. (13/08166-5, 16/07490-1)
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