CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ) (Instituição Sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Possui bacharelado em química (1999), doutorado em bioquímica (2004) e livre-docência (2016), obtidos no Instituto de Química da Universidade de São Paulo (IQ-USP). Fez pós-doutorado no Department of Chemistry na University of Warwick, Reino Unido (2005) e no Departamento de Química Fundamental do IQ-USP (2006-2007). Atualmente é professor associado (A2) no Departamento de Bioquímica da USP, e esta alocado como Professor Sabático no Instituto de Estudos Avançados (IEA) da USP. É orientador de pós-graduação pelos programas de Bioquímica e de Química da USP. Tem experiência de pesquisa científica nas áreas de bioquímica, biofísica e físico-química com ênfase em cálculo e desenvolvimento de métodos em estrutura eletrônica e em simulação molecular, enzimologia computacional e simulação com potenciais híbridos (QM/MM), dinâmica molecular de proteínas e estimativa de energia livre, e aplicações de inteligência artificial para biomoléculas. (Fonte: Currículo Lattes)
| Matéria(s) publicada(s) no Pesquisa para Inovação FAPESP sobre o(a) pesquisador(a): |
| Química é Vida: Membranas na Fronteira da Vida |
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| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a) |
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Simulação molecular é uma área de pesquisa madura. Seu desenvolvimento já foi reconhecido na forma de prêmios Nobel e suas aplicações em biofísica e bioquímica são largamente difundidas. No entanto, processos importantes como reações de transferência de próton-elétron acopladas (PCET) ainda são menos estudados por causa da inexistência de metodologias ou inadequação das atuais. Neste proj…
Enzimas da cadeia de transporte de elétrons em mitocôndrias e bactérias estão equipadas com grupos prostéticos baseados em metais de transição responsáveis pelos processos de oxidoredução essenciais. Neste projeto propomos elucidar mecanismos catalíticos e a estabilidade estrutural de cofatores metálicos ligados nestas proteínas. Investigaremos os mecanismos de reações de transferência pr…
Nós buscamos financiamento para ajudar na proposição e no estabelecimento de uma longa colaboração tanto em bioquímica inorgânica computacional e computação de alto-desempenho, e suas aplicações para ciência computacional. Os autores já colaboraram no passado no primeiro tópico, incuindo uma publicação em revista indexada de alta qualidade. As atividades atuais e os planos futuros da Plat…
O complexo respiratório I é a maior proteína de membrana assimétrica conhecida e é responsável por transduzir aproximadamente metade da energia química utilizada em uma célula. Ele catalisa a transferência de elétrons do metabólito NADH para a coenzima Q, acoplada ao bombeamento de prótons e à geração de um gradiente eletroquímico transmembranar. Apesar de décadas de pesquisa, questões fu…
Esta bolsa de treinamento técnico nível TT-1 permitirá a capacitação de estudante de graduação na administração de sistemas computacionais de alto desempenho e sua introdução aos métodos numéricos relevantes para computação científica, em particular nas áreas de cálculo e simulação molecular. Também apoiará as atividades de pesquisa e ensino planejadas no âmbito desta proposta de Auxílio …
O complexo respiratório I é responsável pela transdução de cerca de metade da energia química usada numa célula ao catalisar a transferência de elétrons do metabólito NADH para coenzima-Q acoplada ao bombeamento de prótons e à geração de um gradiente eletroquímico transmembranar. Embora décadas de pesquisa, incluindo impressionantes avanços estruturais recentes, tenham contribuído para co…
Esta bolsa de treinamento técnico nível TT-1 permitirá a capacitação de estudante de graduação na administração de sistemas computacionais de alto desempenho e sua introdução aos métodos numéricos relevantes para computação científica, em particular nas áreas de cálculo e simulação molecular. Também apoiará as atividades de pesquisa planejadas no âmbito desta proposta de Auxílio Regular,…
Métodos de inteligência artificial (IA) revolucionaram áreas como processamento de linguagem, síntese de imagens e predição de estruturas biomoleculares. Modelos de IA generativa mostraram grande potencial no design de biomoléculas com propriedades e estruturas específicas, aplicáveis na descoberta de medicamentos, engenharia de enzimas, biologia sintética e áreas afins. Um grande desafio…
O mutante L99A da lisozima do fago T4 é uma proteína frequentemente usada para estudar a ligação de pequenas moléculas a macromoléculas. Estruturas cristalográficas do mutante L99A complexado com ligantes mostram que a abertura na superfície da proteína para entrada e saída do ligante do sítio de ligação criado pela mutação é pequena. Portanto, a proteína deve apresentar um movimento de "…