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Alessandro Silva Nascimento

CV Lattes GoogleMyCitations ResearcherID ORCID


Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

possui graduação em Ciências Farmacêuticas pela Universidade de Brasília (2005) e doutorado em Física Aplicada (Biomolecular) pela Universidade de São Paulo (USP). Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Cristalografia de Proteínas e métodos de modelagem biomolecular, atuando principalmente nos seguintes temas: receptores nucleares, farmacologia molecular e estrutural. Atualmente é professor doutor junto ao Instituto de Física de São Carlos. (Fonte: Currículo Lattes)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a)
Bolsas FAPESP de pós-doutorado em bioquímica e biologia estrutural 
Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Bolsas no Exterior
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 07/12/2019
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (20)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações18
Citações152
Cit./Artigo8,4
Dados do Web of Science

MALTAROLLO, VINICIUS G.; TOGASHI, MARIE; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; HONORIO, KATHIA M.. Structure-Based Virtual Screening and Discovery of New PPAR delta/gamma Dual Agonist and PPAR delta and gamma Agonists. PLoS One, v. 10, n. 3, . Citações Web of Science: 14. (11/18981-2, 14/06565-2)

DA SILVA, FLAVIA M. C.; DOS SANTOS, JADEMILSON C.; CAMPOS, JESSICA L. O.; MAFUD, ANA CAROLINA; POLIKARPOV, IGOR; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Structure-based identification of novel PPAR gamma ligands. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, v. 23, n. 21, p. 5795-5802, . Citações Web of Science: 16. (10/15376-8)

VAZ DE LIMA, LUIS ANTONIO C.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. MolShaCS: A free and open source tool for ligand similarity identification based on Gaussian descriptors. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY, v. 59, p. 296-303, . Citações Web of Science: 12. (10/15376-8)

LIBERATO, MARCELO VIZONA; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; AYERS, STEVEN D.; LIN, JEAN Z.; CVORO, ALEKSANDRA; SILVEIRA, RODRIGO L.; MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; SAIDEMBERG, DANIEL; DENG, TUO; et al. Medium Chain Fatty Acids Are Selective Peroxisome Proliferator Activated Receptor (PPAR) gamma Activators and Pan-PPAR Partial Agonists. PLoS One, v. 7, n. 5, . Citações Web of Science: 74. (04/08070-9, 06/06831-8, 06/00182-8)

FLORINDO, RENATA N.; SOUZA, VALQUIRIA P.; MANZINE, LIVIA R.; CAMILO, CESAR M.; MARANA, SANDRO R.; POLIKARPOV, IGOR; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Structural and biochemical characterization of a GH3 beta-glucosidase from the probiotic bacteria Bifidobacterium adolescentis. Biochimie, v. 148, p. 107-115, . Citações Web of Science: 3. (14/19439-5, 14/06565-2, 08/56255-9)

FARRO, ERICK GIANCARLO S.; LEITE, ANA ELISA T.; SILVA, ISABELA A.; FILGUEIRAS, JEFFERSON G.; DE AZEVEDO, EDUARDO R.; POLIKARPOV, IGOR; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. GH43 endo-arabinanase from Bacillus licheniformis: Structure, activity and unexpected synergistic effect on cellulose enzymatic hydrolysis. International Journal of Biological Macromolecules, v. 117, p. 7-16, . Citações Web of Science: 1. (15/13684-0, 14/06565-2, 14/03768-0)

FLORINDO, RENATA N.; SOUZA, VALQUIRIA P.; MUTTI, HEMILY S.; CAMILO, CESAR; MANZINE, LIVIA REGINA; MARANA, SANDRO R.; POLIKARPOV, IGOR; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Structural insights into beta-glucosidase transglycosylation based on biochemical, structural and computational analysis of two GH1 enzymes from Trichoderma harzianum. NEW BIOTECHNOLOGY, v. 40, n. B, p. 218-227, . Citações Web of Science: 8. (14/19439-5, 14/06565-2, 08/56255-9)

NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Structural requirement for PPAR gamma binding revealed by a meta analysis of holo-crystal structures. Biochimie, v. 92, n. 5, p. 499-506, . Citações Web of Science: 4. (04/08070-9, 08/58735-8)

GODOY, ANDRE SCHUTZER; CAMILO, CESAR MOISES; KADOWAKI, MARCO ANTONIO; MUNIZ, HELOISA DOS S.; SANTO, MELISSA ESPIRITO; MURAKAMI, MARIO TYAGO; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of beta 1 -> 6-galactosidase from Bifidobacterium bifidum S17: trimeric architecture, molecular determinants of the enzymatic activity and its inhibition by alpha-galactose. FEBS Journal, v. 283, n. 22, p. 4097-4112, . Citações Web of Science: 6. (11/20505-4, 09/05328-9, 08/56255-9, 14/06565-2, 09/52840-7, 11/05712-3)

MUNIZ, HELOISA S.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Towards a critical evaluation of an empirical and volume-based solvation function for ligand docking. PLoS One, v. 12, n. 3, . Citações Web of Science: 1. (14/06565-2, 10/15376-8)

MUNIZ, HELOISA DOS SANTOS; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Ligand- and receptor-based docking with LiBELa. Journal of Computer-Aided Molecular Design, v. 29, n. 8, p. 713-723, . Citações Web of Science: 4. (14/06565-2)

KIM, KYOUNG-YUN; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; GOLUBEV, ALEXANDER M.; POLIKARPOV, IGOR; KIM, CHUNG-SEI; KANG, SU-IL; KIM, SU-IL. Catalytic mechanism of inulinase from Arthrobacter sp. S37. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 371, n. 4, p. 600-605, . (04/08070-9, 06/00182-8)

NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; KRAUCHENCO, SANDRA; GOLUBEV, ALEXANDER M.; GUSTCHINA, ALLA; WLODAWER, ALEXANDER; POLIKARPOV, IGOR. Statistical coupling analysis of aspartic proteinases based on crystal structures of the Trichoderma reesei enzyme and its complex with pepstatin A. Journal of Molecular Biology, v. 382, n. 3, p. 763-778, . Citações Web of Science: 7. (04/08070-9, 99/03387-4)

WATANABE, LEANDRA; DE MOURA, PATRICIA RIBEIRO; NASCIMENTO, ALESSANDRO SILVA; COLAU, DIDIER; DUMOUTIER, LAURE; RENAULD, JEAN-CHRISTOPHE; POLIKARPOV, IGOR. Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of human IL-22 bound to its soluble decoy receptor IL-22BP. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 65, n. 2, p. 102-104, . Citações Web of Science: 1. (04/08070-9, 06/00182-8, 06/60860-0, 06/01534-5)

NASCIMENTO‚ A.; CATALANO-DUPUY‚ D.; BERNARDES‚ A.; NETO‚ M.; SANTOS‚ M.; CECCARELLI‚ E.; POLIKARPOV‚ I.. Crystal structures of Leptospira interrogans FAD-containing ferredoxin-NADP+ reductase and its complex with NADP+. BMC STRUCTURAL BIOLOGY, v. 7, n. 1, p. 69, . (06/00182-8, 04/08070-9)

GOLUBEV, ALEXANDER M.; ROJAS, ADRIANA L.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; BLEICHER, LUCAS; KULMINSKAYA, ANNA A.; ENEYSKAYA, ELENA V.; POLIKARPOV, IGOR. Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Laminarinase from Rhodothermus marinus: A Case of Pseudomerohedral Twinning. PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, v. 15, n. 10, p. 1142-1144, . Citações Web of Science: 1. (04/08070-9, 06/00182-8)

SARTORI, GERALDO RODRIGUES; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Comparative Analysis of Electrostatic Models for Ligand Docking. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, v. 6, . Citações Web of Science: 0. (15/13684-0, 17/18173-0, 15/26722-8)

DE AZEVEDO, ERIKA CHANG; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.. Energy landscape of the domain movement in Staphylococcus aureus UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase. Journal of Structural Biology, v. 207, n. 2, p. 158-168, . Citações Web of Science: 0. (15/13684-0, 17/18173-0, 15/26722-8)

SONODA, MILTON T.; GODOY, ANDRE S.; PELLEGRINI, VANESSA O. A.; KADOWAKI, MARCO A. S.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; POLIKARPOV, IGOR. Structure and dynamics of Trichoderma harzianum Cel7B suggest molecular architecture adaptations required for a wide spectrum of activities on plant cell wall polysaccharides. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1863, n. 6, p. 1015-1026, . Citações Web of Science: 0. (15/13684-0, 14/06565-2, 17/18173-0)

MINARI, KARINE; DE AZEVEDO, ERIKA CHANG; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ; HELENO BATISTA, FERNANDA APARECIDA; DE MORAES, FABIO ROGERIO; DE MELO, FERNANDO ALVES; NASCIMENTO, ALESSANDRO SILVA; GAVA, LISANDRA MARQUES; INACIO RAMOS, CARLOS HENRIQUE; BORGES, JULIO CESAR. Thermodynamic analysis of interactions of the Hsp90 with adenosine nucleotides: A comparative perspective. International Journal of Biological Macromolecules, v. 130, p. 125-138, . Citações Web of Science: 0. (09/53989-4, 13/25646-0, 14/07206-6, 11/23110-0, 15/26722-8, 12/50161-8, 17/18173-0, 17/07335-9)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

NASCIMENTO, Alessandro Silva. Interações dos receptores nucleares com seus ligantes: Estudos estruturais do receptor de hormônio tireoidiano, do receptor de mineralocorticóide e do receptor ativado por proliferadores peroxissomais. 2009. Tese (Doutorado) – Instituto de Física de São Carlos. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos. (04/08070-9)

FARRO, Erick Giancarlo Suclupe. Caracterização estrutural e bioquímica das arabinanases de Bacillus licheniformis. 2016. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Física de São Carlos. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos. (14/03768-0)

CUNHA, João Victor de Souza. Aplicação de Monte Carlo para a geração de ensembles e análise termodinâmica da interação biomolecular. 2016. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Física de São Carlos. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos. (14/01751-2)

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