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Mário Tyago Murakami

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Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Líder de grupo de pesquisa desde 2008 no CNPEM (2008-2016 LNBio e 2016-atual LNBR). Atuou entre 2008 e 2016 como Coordenador de instalações científicas de grande porte dedicadas à Cristalografia de Macromoléculas do LNLS e LNBio (linhas de luz MX1 e MX2, e instalação de cristalização de macromoléculas ROBOLAB). Entre 2016 e 2017, foi Coordenador da Divisão Molecular do LNBR e atualmente é Diretor Científico do Laboratório Nacional de Biorrenováveis (LNBR). Tem atuado nas áreas de Glicobiologia, Biotecnologia Molecular e Biologia Sintética tanto no campo da ciência fundamental como aplicada. Coordena um projeto temático FAPESP sobre novas estratégias para desconstrução da parede celular vegetal e é responsável por projetos de grande porte de P&D com empresas do setor de Biotecnologia, além de liderar programas multidisciplinares institucionais voltados a solucionar problemas estratégicos ao pais na área de bioenergia, como o desenvolvimento de uma rota de produção de etanol 2G a partir de resíduos da cana-de-açúcar. Desde a nucleação do grupo de pesquisa no CNPEM publicou mais de 130 artigos científicos em revistas de reconhecimento internacional (~3000 citações, indice H = 32 e i10 = 87, fonte: Google Scholar), resolveu mais de 150 estruturas cristalográficas depositadas no PDB e possui 8 depósitos de patente na área de Biotecnologia, das quais duas foram licenciadas para o setor produtivo. (Fonte: Currículo Lattes)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a)
Descoberta na Amazônia enzima-chave para obtenção do etanol de segunda geração 
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Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 18/01/2020
1 Auxílios à pesquisa em andamento
6 Auxílios à pesquisa concluídos
5 Bolsas no país em andamento
21 Bolsas no país concluídas
2 Bolsas no exterior em andamento
3 Bolsas no exterior concluídas
38 Todos os Auxílios e Bolsas
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Arabidopsis thaliana Biofísica Molecular Biofísica Biologia Molecular Biologia estrutural Biomarcadores Tumorais Biomassa lignocelulósica Bioprodutos Bioquímica Caracterização Catálise Celulase Celulases Celulose Ciências Biológicas Cristalização Cristalografia de proteínas Cristalografia de raios x Cristalografia Elementos estruturais de proteínas Enzimologia Espectroscopia Estabilidade Estrutura cristalina Estrutura Expressão Fatores de transcrição Fosforilação Glicosilação Inibidores Leishmania braziliensis Mutagênese Purificação Química de Macromoléculas Regulação Xanthomonas
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (35)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações34
Citações407
Cit./Artigo12,0
Dados do Web of Science

SANTOS, CLELTON A.; ZANPHORLIN, LET-CIA M.; CRUCELLO, ALINE; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; HORTA, MARIA A. C.; MURAKAMI, MARIO T.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Crystal structure and biochemical characterization of the recombinant ThBgl, a GH1 beta-glucosidase overexpressed in Trichoderma harzianum under biomass degradation conditions. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 9, . Citações Web of Science: 11.

ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; HONORATO, RODRIGO VARGAS; COSTA TONOLI, CELISA CALDANA; FATTORI, JULIANA; CRESPIM, ELAINE; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Oligomerization as a strategy for cold adaptation: Structure and dynamics of the GH1 beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 24.

VIEIRA, PLINIO SALMAZO; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAVALCANTE DE OLIVEIRA, ARTHUR HENRIQUE; MURAKAMI, MARIO TYAGO. The role of the C-terminus and Kpn loop in the quaternary structure stability of nucleoside diphosphate kinase from Leishmania parasites. Journal of Structural Biology, v. 192, n. 3, p. 336-341, . Citações Web of Science: 3.

DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAMPOS BRASIL SOUZA, TATIANA DE ARRUDA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; MACHADO, CARLA BOTELHO; WARD, RICHARD JOHN; JORGE, JOAO ATILIO; MELO FURRIEL, ROSA DOS PRAZERES; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structural basis for glucose tolerance in GH1 beta-glucosidases. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, v. 70, n. 6, p. 1631-1639, . Citações Web of Science: 57.

SANTOS, CAMILA RAMOS; HOFFMAM, ZAIRA BRUNA; DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE PAULA ASSIS, LEANDRO HENRIQUE; HONORATO, RODRIGO VARGAS; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Molecular Mechanisms Associated with Xylan Degradation by Xanthomonas Plant Pathogens. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 46, p. 32186-32200, . Citações Web of Science: 24.

SANTOS, CAMILA R.; POLO, CARLA C.; COSTA, MARIA C. M. F.; NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; MEZA, ANDREIA N.; COTA, JUNIO; HOFFMAM, ZAIRA B.; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; GOLDMAN, GUSTAVO H.; et al. Mechanistic Strategies for Catalysis Adopted by Evolutionary Distinct Family 43 Arabinanases. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 11, p. 7362-7373, . Citações Web of Science: 13.

HOFFMAM, ZAIRA B.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA M.; DIOGO, JOS A.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; CITADINI, ANA PAULA S.; LEITE, VITOR B. P.; SQUINA, FABIO M.; MURAKAMI, MARIO T.; et al. Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 alpha-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, v. 55, n. 3, p. 260-267, . Citações Web of Science: 7.

FURTADO, GILVAN PESSOA; RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; SANTOS, CAMILA RAMOS; TONOLI, CELISA CALDANA; DE SOUZA, ANGELICA RODRIGUES; OLIVEIRA, RENATA ROCHA; MURAKAMI, MARIO TYAGO; WARD, RICHARD JOHN. Biochemical and structural characterization of a beta-1,3-1,4-glucanase from Bacillus subtilis 168. Process Biochemistry, v. 46, n. 5, p. 1202-1206, . Citações Web of Science: 29.

DE GIUSEPPE, PRISCILA O.; MARTINS, NADIA H.; MEZA, ANDREIA N.; DOS SANTOS, CAMILA R.; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; MURAKAMI, MARIO T.. Insights into Phosphate Cooperativity and Influence of Substrate Modifications on Binding and Catalysis of Hexameric Purine Nucleoside Phosphorylases. PLoS One, v. 7, n. 9, . Citações Web of Science: 7.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; ALEGRIA, THIAGO G. P.; OLIVEIRA, MARCOS A.; NETTO, LUIS E. S.; MURAKAMI, MARIO T.. How pH Modulates the Dimer-Decamer Interconversion of 2-Cys Peroxiredoxins from the Prx1 Subfamily. Journal of Biological Chemistry, v. 290, n. 13, p. 8582-8590, . Citações Web of Science: 23.

SANTOS, CLELTON A.; ZANPHORLIN, LET-CIA M.; CRUCELLO, ALINE; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; HORTA, MARIA A. C.; MURAKAMI, MARIO T.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Crystal structure and biochemical characterization of the recombinant ThBgl, a GH1 beta-glucosidase overexpressed in Trichoderma harzianum under biomass degradation conditions. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 9, . Citações Web of Science: 11.

ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; HONORATO, RODRIGO VARGAS; COSTA TONOLI, CELISA CALDANA; FATTORI, JULIANA; CRESPIM, ELAINE; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Oligomerization as a strategy for cold adaptation: Structure and dynamics of the GH1 beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 24.

VIEIRA, PLINIO SALMAZO; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAVALCANTE DE OLIVEIRA, ARTHUR HENRIQUE; MURAKAMI, MARIO TYAGO. The role of the C-terminus and Kpn loop in the quaternary structure stability of nucleoside diphosphate kinase from Leishmania parasites. Journal of Structural Biology, v. 192, n. 3, p. 336-341, . Citações Web of Science: 3.

DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAMPOS BRASIL SOUZA, TATIANA DE ARRUDA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; MACHADO, CARLA BOTELHO; WARD, RICHARD JOHN; JORGE, JOAO ATILIO; MELO FURRIEL, ROSA DOS PRAZERES; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structural basis for glucose tolerance in GH1 beta-glucosidases. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, v. 70, n. 6, p. 1631-1639, . Citações Web of Science: 57.

SANTOS, CAMILA RAMOS; HOFFMAM, ZAIRA BRUNA; DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE PAULA ASSIS, LEANDRO HENRIQUE; HONORATO, RODRIGO VARGAS; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Molecular Mechanisms Associated with Xylan Degradation by Xanthomonas Plant Pathogens. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 46, p. 32186-32200, . Citações Web of Science: 24.

SANTOS, CAMILA R.; POLO, CARLA C.; COSTA, MARIA C. M. F.; NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; MEZA, ANDREIA N.; COTA, JUNIO; HOFFMAM, ZAIRA B.; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; GOLDMAN, GUSTAVO H.; et al. Mechanistic Strategies for Catalysis Adopted by Evolutionary Distinct Family 43 Arabinanases. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 11, p. 7362-7373, . Citações Web of Science: 13.

HOFFMAM, ZAIRA B.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA M.; DIOGO, JOS A.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; CITADINI, ANA PAULA S.; LEITE, VITOR B. P.; SQUINA, FABIO M.; MURAKAMI, MARIO T.; et al. Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 alpha-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, v. 55, n. 3, p. 260-267, . Citações Web of Science: 7.

FURTADO, GILVAN PESSOA; RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; SANTOS, CAMILA RAMOS; TONOLI, CELISA CALDANA; DE SOUZA, ANGELICA RODRIGUES; OLIVEIRA, RENATA ROCHA; MURAKAMI, MARIO TYAGO; WARD, RICHARD JOHN. Biochemical and structural characterization of a beta-1,3-1,4-glucanase from Bacillus subtilis 168. Process Biochemistry, v. 46, n. 5, p. 1202-1206, . Citações Web of Science: 29.

DE GIUSEPPE, PRISCILA O.; MARTINS, NADIA H.; MEZA, ANDREIA N.; DOS SANTOS, CAMILA R.; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; MURAKAMI, MARIO T.. Insights into Phosphate Cooperativity and Influence of Substrate Modifications on Binding and Catalysis of Hexameric Purine Nucleoside Phosphorylases. PLoS One, v. 7, n. 9, . Citações Web of Science: 7.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; ALEGRIA, THIAGO G. P.; OLIVEIRA, MARCOS A.; NETTO, LUIS E. S.; MURAKAMI, MARIO T.. How pH Modulates the Dimer-Decamer Interconversion of 2-Cys Peroxiredoxins from the Prx1 Subfamily. Journal of Biological Chemistry, v. 290, n. 13, p. 8582-8590, . Citações Web of Science: 23.

RODRIGUES DE MELO, RICARDO; CARLOS ALNOCH, ROBSON; DE SOUSA, AMANDA SILVA; SATO, HELIA HARUMI; RULLER, ROBERTO; MATEO, CESAR. Cross-Linking with Polyethylenimine Confers Better Functional Characteristics to an Immobilized beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. CATALYSTS, v. 9, n. 3, . Citações Web of Science: 0.

RIBEIRO CORREA, THAMY LIVIA; TOMAZINI JUNIOR, ATILIO; WOLF, LUCIA DANIELA; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA; MURAKAMI, MARIO TYAGO. An actinobacteria lytic polysaccharide monooxygenase acts on both cellulose and xylan to boost biomass saccharification. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 12, . Citações Web of Science: 1.

RUIZ, DIEGO M.; TUROWSKI, VALERIA R.; MURAKAMI, MARIO T.. Effects of the linker region on the structure and function of modular GH5 cellulases. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 18.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; CASTRO, HELENA; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; NETTO, LUIS E. S.; TOMAS, ANA M.; MURAKAMI, MARIO T.. Calcium and magnesium ions modulate the oligomeric state and function of mitochondrial 2-Cys peroxiredoxins in Leishmania parasites. Journal of Biological Chemistry, v. 292, n. 17, p. 7023-7039, . Citações Web of Science: 1.

NARESSI SCAPIN, SANDRA MARA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE ALMEIDA, THAMYRES SILVA; SADE, YOUSSEF BACILA; CARDOSO, ALEXANDER MACHADO; PINHEIRO, GUILHERME LUIZ; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structure and function of a novel GH8 endoglucanase from the bacterial cellulose synthase complex of Raoultella ornithinolytica. PLoS One, v. 12, n. 4, . Citações Web of Science: 5.

DOS SANTOS, CAMILA RAMOS; CORDEIRO, ROSA LORIZOLLA; WONG, DOMINIC W. S.; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-D-Xylp(1 -> 6)-D-Glcp Recognition at the-1 Subsite within the GH5 Family. BIOCHEMISTRY, v. 54, n. 10, p. 1930-1942, . Citações Web of Science: 9.

NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; TRINDADE, DANIEL M.; TONOLI, CELISA C. C.; DE GIUSEPPE, PRISCILA O.; ASSIS, LEANDRO H. P.; HONORATO, RODRIGO V.; DE OLIVEIRA, PAULO S. L.; MAHAJAN, PRAVIN; BURGESS-BROWN, NICOLA A.; VON DELFT, FRANK; et al. Structural Insights into Functional Overlapping and Differentiation among Myosin V Motors. Journal of Biological Chemistry, v. 288, n. 47, p. 34131-34145, . Citações Web of Science: 16.

ALVAREZ, THABATA M.; PAIVA, JOICE H.; RUIZ, DIEGO M.; CAIRO, JOAO PAULO L. F.; PEREIRA, ISABELA O.; PAIXAO, DOUGLAS A. A.; DE ALMEIDA, RODRIGO F.; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; SANTOS, CAMILA R.; et al. Structure and Function of a Novel Cellulase 5 from Sugarcane Soil Metagenome. PLoS One, v. 8, n. 12, . Citações Web of Science: 23.

DOS SANTOS, CAMILA RAMOS; PAIVA, JOICE HELENA; MEZA, ANDREIA NAVARRO; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA MARIA; RULLER, ROBERTO; PRADE, ROLF ALEXANDER; SQUINA, FABIO MARCIO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Molecular insights into substrate specificity and thermal stability of a bacterial GH5-CBM27 endo-1,4-beta-D-mannanase. Journal of Structural Biology, v. 177, n. 2, p. 469-476, . Citações Web of Science: 18.

CORDEIRO, ROSA LORIZOLLA; SIQUEIRA PIROLLA, RENAN AUGUSTO; PERSINOTI, GABRIELA FELIX; GOZZO, FABIO CESAR; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; MURAKAMI, MARIO TYAGO. N-glycan Utilization by Bifidobacterium Gut Symbionts Involves a Specialist beta-Mannosidase. Journal of Molecular Biology, v. 431, n. 4, p. 732-747, . Citações Web of Science: 0.

RODRIGUES DE MELO, RICARDO; CARLOS ALNOCH, ROBSON; DE SOUSA, AMANDA SILVA; SATO, HELIA HARUMI; RULLER, ROBERTO; MATEO, CESAR. Cross-Linking with Polyethylenimine Confers Better Functional Characteristics to an Immobilized beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. CATALYSTS, v. 9, n. 3, . Citações Web of Science: 0.

RIBEIRO CORREA, THAMY LIVIA; TOMAZINI JUNIOR, ATILIO; WOLF, LUCIA DANIELA; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA; MURAKAMI, MARIO TYAGO. An actinobacteria lytic polysaccharide monooxygenase acts on both cellulose and xylan to boost biomass saccharification. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 12, . Citações Web of Science: 1.

RUIZ, DIEGO M.; TUROWSKI, VALERIA R.; MURAKAMI, MARIO T.. Effects of the linker region on the structure and function of modular GH5 cellulases. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 18.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; CASTRO, HELENA; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; NETTO, LUIS E. S.; TOMAS, ANA M.; MURAKAMI, MARIO T.. Calcium and magnesium ions modulate the oligomeric state and function of mitochondrial 2-Cys peroxiredoxins in Leishmania parasites. Journal of Biological Chemistry, v. 292, n. 17, p. 7023-7039, . Citações Web of Science: 1.

NARESSI SCAPIN, SANDRA MARA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE ALMEIDA, THAMYRES SILVA; SADE, YOUSSEF BACILA; CARDOSO, ALEXANDER MACHADO; PINHEIRO, GUILHERME LUIZ; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structure and function of a novel GH8 endoglucanase from the bacterial cellulose synthase complex of Raoultella ornithinolytica. PLoS One, v. 12, n. 4, . Citações Web of Science: 5.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ASSIS, Leandro Henrique de Paula. A descoberta da interação entre miosina Va e RPGRIP1L = caracterização do complexo e localização no centrossomo = The discovery of the interaction between myosin Va and RPGRIP1L: characterization of the complex and localization at the centrosome. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

POLO, Carla Cristina. Investigação dos determinantes estruturais do modo de ação de endo e exo-arabinanases provenientes da microflora do rúmen bovino. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

PAIVA, Joice Helena. Estrutura, função e estabilidade de hidrolases gicosídicas pertencentes à família GH5 com potencial aplicação na conversão de biomassa lignocelulósica em açúcares fermentáveis = : Structure, function and stability of the glycosyl hidrolases that belong to GH5 family with potencial application in the conversion of lignocellulosic biomass in fermentable sugars. 2013. Tese (Doutorado) – Instituto de Biologia. Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).

NASCIMENTO, Andrey Fabricio Ziem. Aspectos estruturais dos eventos moleculares associados à regulação e seletividade do transporte de cargas celulares pelas miosinas de classe V humanas. 2014. Tese (Doutorado) – Instituto de Biologia. Universidade Estadual de Campinas.

VIEIRA, Plínio Salmazo. Estrutura, conformação e inibição de quinases de Leishmania = Structure, conformation and inhibition of kinases from Leishmania. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

MORAIS, Mariana Abrahão Bueno de. Ca2+, Mg2+ e pH integram novos mecanismos regulatórios da estrutura e função de peroxirredoxinas mitocondriais de Leishmania contribuindo para a sobrevivência do parasita   = Ca2+, Mg2+ and pH integrate novel regulatory mechanisms of structure and function of mitochondrial peroxiredoxins from Leishmania contributing to parasite survival  . 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

MURAKAMI, Mário Tyago. Estratégias de inibição, mecanismos moleculares e interações intermoleculares em complexos macromoleculares. 2006. 152f. Tese (Doutorado) – Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto.

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