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Mário Tyago Murakami

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Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Líder de grupo de pesquisa desde 2008 no CNPEM (2008-2016 LNBio e 2016-atual LNBR). Atuou entre 2008 e 2016 como Coordenador de instalações científicas de grande porte dedicadas à Cristalografia de Macromoléculas do LNLS e LNBio (linhas de luz MX1 e MX2, e instalação de cristalização de macromoléculas ROBOLAB). Entre 2016 e 2017, foi Coordenador da Divisão Molecular do LNBR e atualmente é Diretor Científico do Laboratório Nacional de Biorrenováveis (LNBR). Tem atuado nas áreas de Glicobiologia, Biotecnologia Molecular e Biologia Sintética tanto no campo da ciência fundamental como aplicada. Coordena um projeto temático FAPESP sobre novas estratégias para desconstrução da parede celular vegetal e é responsável por projetos de grande porte de P&D com empresas do setor de Biotecnologia, além de liderar programas multidisciplinares institucionais voltados a solucionar problemas estratégicos ao pais na área de bioenergia, como o desenvolvimento de uma rota de produção de etanol 2G a partir de resíduos da cana-de-açúcar. Desde a nucleação do grupo de pesquisa no CNPEM publicou mais de 130 artigos científicos em revistas de reconhecimento internacional (~3000 citações, indice H = 32 e i10 = 87, fonte: Google Scholar), resolveu mais de 150 estruturas cristalográficas depositadas no PDB e possui 8 depósitos de patente na área de Biotecnologia, das quais duas foram licenciadas para o setor produtivo. (Fonte: Currículo Lattes)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a)
Descoberta na Amazônia enzima-chave para obtenção do etanol de segunda geração 
Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Bolsas no Exterior
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 18/01/2020
Colaboradores mais frequentes em auxílios e bolsas FAPESP
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (35)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações34
Citações407
Cit./Artigo12,0
Dados do Web of Science

SANTOS, CLELTON A.; ZANPHORLIN, LET-CIA M.; CRUCELLO, ALINE; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; HORTA, MARIA A. C.; MURAKAMI, MARIO T.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Crystal structure and biochemical characterization of the recombinant ThBgl, a GH1 beta-glucosidase overexpressed in Trichoderma harzianum under biomass degradation conditions. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 9, . Citações Web of Science: 11.

ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; HONORATO, RODRIGO VARGAS; COSTA TONOLI, CELISA CALDANA; FATTORI, JULIANA; CRESPIM, ELAINE; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Oligomerization as a strategy for cold adaptation: Structure and dynamics of the GH1 beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 24.

VIEIRA, PLINIO SALMAZO; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAVALCANTE DE OLIVEIRA, ARTHUR HENRIQUE; MURAKAMI, MARIO TYAGO. The role of the C-terminus and Kpn loop in the quaternary structure stability of nucleoside diphosphate kinase from Leishmania parasites. Journal of Structural Biology, v. 192, n. 3, p. 336-341, . Citações Web of Science: 3.

DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAMPOS BRASIL SOUZA, TATIANA DE ARRUDA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; MACHADO, CARLA BOTELHO; WARD, RICHARD JOHN; JORGE, JOAO ATILIO; MELO FURRIEL, ROSA DOS PRAZERES; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structural basis for glucose tolerance in GH1 beta-glucosidases. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, v. 70, n. 6, p. 1631-1639, . Citações Web of Science: 57.

SANTOS, CAMILA RAMOS; HOFFMAM, ZAIRA BRUNA; DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE PAULA ASSIS, LEANDRO HENRIQUE; HONORATO, RODRIGO VARGAS; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Molecular Mechanisms Associated with Xylan Degradation by Xanthomonas Plant Pathogens. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 46, p. 32186-32200, . Citações Web of Science: 24.

SANTOS, CAMILA R.; POLO, CARLA C.; COSTA, MARIA C. M. F.; NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; MEZA, ANDREIA N.; COTA, JUNIO; HOFFMAM, ZAIRA B.; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; GOLDMAN, GUSTAVO H.; et al. Mechanistic Strategies for Catalysis Adopted by Evolutionary Distinct Family 43 Arabinanases. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 11, p. 7362-7373, . Citações Web of Science: 13.

HOFFMAM, ZAIRA B.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA M.; DIOGO, JOS A.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; CITADINI, ANA PAULA S.; LEITE, VITOR B. P.; SQUINA, FABIO M.; MURAKAMI, MARIO T.; et al. Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 alpha-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, v. 55, n. 3, p. 260-267, . Citações Web of Science: 7.

FURTADO, GILVAN PESSOA; RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; SANTOS, CAMILA RAMOS; TONOLI, CELISA CALDANA; DE SOUZA, ANGELICA RODRIGUES; OLIVEIRA, RENATA ROCHA; MURAKAMI, MARIO TYAGO; WARD, RICHARD JOHN. Biochemical and structural characterization of a beta-1,3-1,4-glucanase from Bacillus subtilis 168. Process Biochemistry, v. 46, n. 5, p. 1202-1206, . Citações Web of Science: 29.

DE GIUSEPPE, PRISCILA O.; MARTINS, NADIA H.; MEZA, ANDREIA N.; DOS SANTOS, CAMILA R.; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; MURAKAMI, MARIO T.. Insights into Phosphate Cooperativity and Influence of Substrate Modifications on Binding and Catalysis of Hexameric Purine Nucleoside Phosphorylases. PLoS One, v. 7, n. 9, . Citações Web of Science: 7.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; ALEGRIA, THIAGO G. P.; OLIVEIRA, MARCOS A.; NETTO, LUIS E. S.; MURAKAMI, MARIO T.. How pH Modulates the Dimer-Decamer Interconversion of 2-Cys Peroxiredoxins from the Prx1 Subfamily. Journal of Biological Chemistry, v. 290, n. 13, p. 8582-8590, . Citações Web of Science: 23.

SANTOS, CLELTON A.; ZANPHORLIN, LET-CIA M.; CRUCELLO, ALINE; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; HORTA, MARIA A. C.; MURAKAMI, MARIO T.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Crystal structure and biochemical characterization of the recombinant ThBgl, a GH1 beta-glucosidase overexpressed in Trichoderma harzianum under biomass degradation conditions. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 9, . Citações Web of Science: 11.

ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; HONORATO, RODRIGO VARGAS; COSTA TONOLI, CELISA CALDANA; FATTORI, JULIANA; CRESPIM, ELAINE; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Oligomerization as a strategy for cold adaptation: Structure and dynamics of the GH1 beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 24.

VIEIRA, PLINIO SALMAZO; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAVALCANTE DE OLIVEIRA, ARTHUR HENRIQUE; MURAKAMI, MARIO TYAGO. The role of the C-terminus and Kpn loop in the quaternary structure stability of nucleoside diphosphate kinase from Leishmania parasites. Journal of Structural Biology, v. 192, n. 3, p. 336-341, . Citações Web of Science: 3.

DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; CAMPOS BRASIL SOUZA, TATIANA DE ARRUDA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; MACHADO, CARLA BOTELHO; WARD, RICHARD JOHN; JORGE, JOAO ATILIO; MELO FURRIEL, ROSA DOS PRAZERES; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structural basis for glucose tolerance in GH1 beta-glucosidases. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, v. 70, n. 6, p. 1631-1639, . Citações Web of Science: 57.

SANTOS, CAMILA RAMOS; HOFFMAM, ZAIRA BRUNA; DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE PAULA ASSIS, LEANDRO HENRIQUE; HONORATO, RODRIGO VARGAS; LOPES DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO; RULLER, ROBERTO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Molecular Mechanisms Associated with Xylan Degradation by Xanthomonas Plant Pathogens. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 46, p. 32186-32200, . Citações Web of Science: 24.

SANTOS, CAMILA R.; POLO, CARLA C.; COSTA, MARIA C. M. F.; NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; MEZA, ANDREIA N.; COTA, JUNIO; HOFFMAM, ZAIRA B.; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; GOLDMAN, GUSTAVO H.; et al. Mechanistic Strategies for Catalysis Adopted by Evolutionary Distinct Family 43 Arabinanases. Journal of Biological Chemistry, v. 289, n. 11, p. 7362-7373, . Citações Web of Science: 13.

HOFFMAM, ZAIRA B.; OLIVEIRA, LEANDRO C.; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA M.; DIOGO, JOS A.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; CITADINI, ANA PAULA S.; LEITE, VITOR B. P.; SQUINA, FABIO M.; MURAKAMI, MARIO T.; et al. Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 alpha-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, v. 55, n. 3, p. 260-267, . Citações Web of Science: 7.

FURTADO, GILVAN PESSOA; RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; SANTOS, CAMILA RAMOS; TONOLI, CELISA CALDANA; DE SOUZA, ANGELICA RODRIGUES; OLIVEIRA, RENATA ROCHA; MURAKAMI, MARIO TYAGO; WARD, RICHARD JOHN. Biochemical and structural characterization of a beta-1,3-1,4-glucanase from Bacillus subtilis 168. Process Biochemistry, v. 46, n. 5, p. 1202-1206, . Citações Web of Science: 29.

DE GIUSEPPE, PRISCILA O.; MARTINS, NADIA H.; MEZA, ANDREIA N.; DOS SANTOS, CAMILA R.; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ; MURAKAMI, MARIO T.. Insights into Phosphate Cooperativity and Influence of Substrate Modifications on Binding and Catalysis of Hexameric Purine Nucleoside Phosphorylases. PLoS One, v. 7, n. 9, . Citações Web of Science: 7.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; ALEGRIA, THIAGO G. P.; OLIVEIRA, MARCOS A.; NETTO, LUIS E. S.; MURAKAMI, MARIO T.. How pH Modulates the Dimer-Decamer Interconversion of 2-Cys Peroxiredoxins from the Prx1 Subfamily. Journal of Biological Chemistry, v. 290, n. 13, p. 8582-8590, . Citações Web of Science: 23.

RODRIGUES DE MELO, RICARDO; CARLOS ALNOCH, ROBSON; DE SOUSA, AMANDA SILVA; SATO, HELIA HARUMI; RULLER, ROBERTO; MATEO, CESAR. Cross-Linking with Polyethylenimine Confers Better Functional Characteristics to an Immobilized beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. CATALYSTS, v. 9, n. 3, . Citações Web of Science: 0.

RIBEIRO CORREA, THAMY LIVIA; TOMAZINI JUNIOR, ATILIO; WOLF, LUCIA DANIELA; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA; MURAKAMI, MARIO TYAGO. An actinobacteria lytic polysaccharide monooxygenase acts on both cellulose and xylan to boost biomass saccharification. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 12, . Citações Web of Science: 1.

RUIZ, DIEGO M.; TUROWSKI, VALERIA R.; MURAKAMI, MARIO T.. Effects of the linker region on the structure and function of modular GH5 cellulases. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 18.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; CASTRO, HELENA; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; NETTO, LUIS E. S.; TOMAS, ANA M.; MURAKAMI, MARIO T.. Calcium and magnesium ions modulate the oligomeric state and function of mitochondrial 2-Cys peroxiredoxins in Leishmania parasites. Journal of Biological Chemistry, v. 292, n. 17, p. 7023-7039, . Citações Web of Science: 1.

NARESSI SCAPIN, SANDRA MARA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE ALMEIDA, THAMYRES SILVA; SADE, YOUSSEF BACILA; CARDOSO, ALEXANDER MACHADO; PINHEIRO, GUILHERME LUIZ; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structure and function of a novel GH8 endoglucanase from the bacterial cellulose synthase complex of Raoultella ornithinolytica. PLoS One, v. 12, n. 4, . Citações Web of Science: 5.

DOS SANTOS, CAMILA RAMOS; CORDEIRO, ROSA LORIZOLLA; WONG, DOMINIC W. S.; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-D-Xylp(1 -> 6)-D-Glcp Recognition at the-1 Subsite within the GH5 Family. BIOCHEMISTRY, v. 54, n. 10, p. 1930-1942, . Citações Web of Science: 9.

NASCIMENTO, ANDREY F. Z.; TRINDADE, DANIEL M.; TONOLI, CELISA C. C.; DE GIUSEPPE, PRISCILA O.; ASSIS, LEANDRO H. P.; HONORATO, RODRIGO V.; DE OLIVEIRA, PAULO S. L.; MAHAJAN, PRAVIN; BURGESS-BROWN, NICOLA A.; VON DELFT, FRANK; et al. Structural Insights into Functional Overlapping and Differentiation among Myosin V Motors. Journal of Biological Chemistry, v. 288, n. 47, p. 34131-34145, . Citações Web of Science: 16.

ALVAREZ, THABATA M.; PAIVA, JOICE H.; RUIZ, DIEGO M.; CAIRO, JOAO PAULO L. F.; PEREIRA, ISABELA O.; PAIXAO, DOUGLAS A. A.; DE ALMEIDA, RODRIGO F.; TONOLI, CELISA C. C.; RULLER, ROBERTO; SANTOS, CAMILA R.; et al. Structure and Function of a Novel Cellulase 5 from Sugarcane Soil Metagenome. PLoS One, v. 8, n. 12, . Citações Web of Science: 23.

DOS SANTOS, CAMILA RAMOS; PAIVA, JOICE HELENA; MEZA, ANDREIA NAVARRO; COTA, JUNIO; ALVAREZ, THABATA MARIA; RULLER, ROBERTO; PRADE, ROLF ALEXANDER; SQUINA, FABIO MARCIO; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Molecular insights into substrate specificity and thermal stability of a bacterial GH5-CBM27 endo-1,4-beta-D-mannanase. Journal of Structural Biology, v. 177, n. 2, p. 469-476, . Citações Web of Science: 18.

CORDEIRO, ROSA LORIZOLLA; SIQUEIRA PIROLLA, RENAN AUGUSTO; PERSINOTI, GABRIELA FELIX; GOZZO, FABIO CESAR; DE GIUSEPPE, PRISCILA OLIVEIRA; MURAKAMI, MARIO TYAGO. N-glycan Utilization by Bifidobacterium Gut Symbionts Involves a Specialist beta-Mannosidase. Journal of Molecular Biology, v. 431, n. 4, p. 732-747, . Citações Web of Science: 0.

RODRIGUES DE MELO, RICARDO; CARLOS ALNOCH, ROBSON; DE SOUSA, AMANDA SILVA; SATO, HELIA HARUMI; RULLER, ROBERTO; MATEO, CESAR. Cross-Linking with Polyethylenimine Confers Better Functional Characteristics to an Immobilized beta-glucosidase from Exiguobacterium antarcticum B7. CATALYSTS, v. 9, n. 3, . Citações Web of Science: 0.

RIBEIRO CORREA, THAMY LIVIA; TOMAZINI JUNIOR, ATILIO; WOLF, LUCIA DANIELA; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA; MURAKAMI, MARIO TYAGO. An actinobacteria lytic polysaccharide monooxygenase acts on both cellulose and xylan to boost biomass saccharification. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 12, . Citações Web of Science: 1.

RUIZ, DIEGO M.; TUROWSKI, VALERIA R.; MURAKAMI, MARIO T.. Effects of the linker region on the structure and function of modular GH5 cellulases. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 18.

MORAIS, MARIANA A. B.; GIUSEPPE, PRISCILA O.; SOUZA, TATIANA A. C. B.; CASTRO, HELENA; HONORATO, RODRIGO V.; OLIVEIRA, PAULO S. L.; NETTO, LUIS E. S.; TOMAS, ANA M.; MURAKAMI, MARIO T.. Calcium and magnesium ions modulate the oligomeric state and function of mitochondrial 2-Cys peroxiredoxins in Leishmania parasites. Journal of Biological Chemistry, v. 292, n. 17, p. 7023-7039, . Citações Web of Science: 1.

NARESSI SCAPIN, SANDRA MARA; MOREIRA SOUZA, FLAVIO HENRIQUE; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DE ALMEIDA, THAMYRES SILVA; SADE, YOUSSEF BACILA; CARDOSO, ALEXANDER MACHADO; PINHEIRO, GUILHERME LUIZ; MURAKAMI, MARIO TYAGO. Structure and function of a novel GH8 endoglucanase from the bacterial cellulose synthase complex of Raoultella ornithinolytica. PLoS One, v. 12, n. 4, . Citações Web of Science: 5.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ASSIS, Leandro Henrique de Paula. A descoberta da interação entre miosina Va e RPGRIP1L = caracterização do complexo e localização no centrossomo = The discovery of the interaction between myosin Va and RPGRIP1L: characterization of the complex and localization at the centrosome. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

POLO, Carla Cristina. Investigação dos determinantes estruturais do modo de ação de endo e exo-arabinanases provenientes da microflora do rúmen bovino. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

PAIVA, Joice Helena. Estrutura, função e estabilidade de hidrolases gicosídicas pertencentes à família GH5 com potencial aplicação na conversão de biomassa lignocelulósica em açúcares fermentáveis = : Structure, function and stability of the glycosyl hidrolases that belong to GH5 family with potencial application in the conversion of lignocellulosic biomass in fermentable sugars. 2013. Tese (Doutorado) – Instituto de Biologia. Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).

NASCIMENTO, Andrey Fabricio Ziem. Aspectos estruturais dos eventos moleculares associados à regulação e seletividade do transporte de cargas celulares pelas miosinas de classe V humanas. 2014. Tese (Doutorado) – Instituto de Biologia. Universidade Estadual de Campinas.

VIEIRA, Plínio Salmazo. Estrutura, conformação e inibição de quinases de Leishmania = Structure, conformation and inhibition of kinases from Leishmania. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

MORAIS, Mariana Abrahão Bueno de. Ca2+, Mg2+ e pH integram novos mecanismos regulatórios da estrutura e função de peroxirredoxinas mitocondriais de Leishmania contribuindo para a sobrevivência do parasita   = Ca2+, Mg2+ and pH integrate novel regulatory mechanisms of structure and function of mitochondrial peroxiredoxins from Leishmania contributing to parasite survival  . 2016. Tese (Doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.

MURAKAMI, Mário Tyago. Estratégias de inibição, mecanismos moleculares e interações intermoleculares em complexos macromoleculares. 2006. 152f. Tese (Doutorado) – Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto.

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