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Claudia Marcia Aparecida Carareto

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Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Possui graduação em História Natural pela Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de São José do Rio Preto/SP (1974), mestrado (1987) e doutorado (1989) em Genética pela Universidade Estadual Paulista - UNESP. Realizou pós-doutoramento na Universidade do Arizona (Tucson, AZ, USA), no período de 1993-1995, na área de Genética e Evolução de Elementos Transponíveis e na Universidade de Lyon (Lyon, França), em 2006, com o tema Efeitos dos Elementos de Transposição na Evolução da Resistência a Inseticidas. Atualmente é Professora Titular em Evolução da UNESP e pesquisadora 1C do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coordena projetos de cooperação internacional formalizados com Universidades e Institutos de Pesquisa no exterior (CAPES/COFECUB: CNRS/Gif-sur-Ivete; FAPESP/CNRS: Universidade de Lyion 1; CAPES/Fundação Agrópolis: IRD e Universidade de Montpellier 2; UNESP/Universidade de Leuven, Belgica) e participa de comitês de órgãos superiores da UNESP (Comitê Institucional do PIBIC/PIBIT; Conselho de Relações Internacionais da UNESP, como representante da àrea de Ciências Biológicas). Atua em pesquisa nas áreas de Genética e Evolução e Bioinformática, principalmente no estudo da Evolução Molecular. Nesta área, investiga em vários organismos, as relações filogenéticas de elementos genéticos móveis, os elementos de transposição, a transferência genética horizontal dessas sequência e seus efeitos na estrutura e funcionamento dos genomas, como também o impacto da hibridização interespecífica na dinâmica genômica desses elementos e deles na especiação. (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Bolsas no Exterior
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 12/10/2019
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (21)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações16
Citações99
Cit./Artigo6,2
Dados do Web of Science

DA CONCEICAO GALEGO, LUIS GUSTAVO; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. Scenario of the spread of the invasive species Zaprionus indianus Gupta, 1970 (Diptera, Drosophilidae) in Brazil. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 33, n. 4, p. 767-U216, . Citações Web of Science: 3. (04/05235-7)

DIAS, ELAINE SILVA; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. msechBari, a new MITE-like element in Drosophila sechellia related to the Bari transposon. GENETICS RESEARCH, v. 93, n. 6, p. 381-385, . Citações Web of Science: 6. (08/07629-3, 10/10731-4)

DIAS, ELAINE SILVA; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. Ancestral polymorphism and recent invasion of transposable elements in Drosophila species. BMC Evolutionary Biology, v. 12, . Citações Web of Science: 6. (08/07629-3, 10/10731-4)

GALEGO‚ L.G.C.; CERON‚ CR; CARARETO‚ C.M.A.. Characterization of esterases in a Brazilian population of Zaprionus indianus (Diptera: Drosophilidae). Genetica, v. 126, n. 1, p. 89-99, . (04/05235-7)

DE ALMEIDA‚ L.M.; CARARETO‚ C.M.A.. Identification of two subfamilies of micropia transposable element in species of the repleta group of Drosophila. Genetica, v. 121, n. 2, p. 155-164, . (00/11313-0, 97/14646-5)

LUCIANE M. DE ALMEIDA; CLAUDIA M. A. CARARETO. Gonadal hybrid dysgenesis in Drosophila sturtevanti (Diptera, Drosophilidae). IHERINGIA SERIE ZOOLOGIA, v. 92, n. 2, p. 71-79, . (98/08734-1)

LOPEZ-MAESTRE, HELENE; CARNELOSSI, ELIAS A. G.; LACROIX, VINCENT; BURLET, NELLY; MUGAT, BRUNO; CHAMBEYRON, SEVERINE; CARARETO, CLAUDIA M. A.; VIEIRA, CRISTINA. Identification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . Citações Web of Science: 3. (10/10731-4)

GRANZOTTO, ADRIANA; LOPES, FABRICIO R.; VIEIRA, CRISTINA; CARARETO, CLAUDIA M. A.. Vertical inheritance and bursts of transposition have shaped the evolution of the BS non-LTR retrotransposon in Drosophila. Molecular Genetics and Genomics, v. 286, n. 1, p. 57-66, . Citações Web of Science: 9. (07/50641-1, 07/53097-0)

SCHIETGAT, LEANDER; VENS, CELINE; CERRI, RICARDO; FISCHER, CARLOS N.; COSTA, EDUARDO; RAMON, JAN; CARARETO, CLAUDIA M. A.; BLOCKEEL, HENDRIK. A machine learning based framework to identify and classify long terminal repeat retrotransposons. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 14, n. 4, . Citações Web of Science: 2. (15/14300-1, 12/24774-2, 13/15070-4)

FISCHER, CARLOS N.; CARARETO, CLAUDIA M. A.; DOS SANTOS, RENATO A. C.; CERRI, RICARDO; COSTA, EDUARDO; SCHIETGAT, LEANDER; VENS, CELINE. Learning HMMs for nucleotide sequences from amino acid alignments. Bioinformatics, v. 31, n. 11, p. 1836-1838, . Citações Web of Science: 1. (12/24774-2, 10/10731-4)

CARNELOSSI, ELIAS A. G.; LERAT, EMMANUELLE; HENRI, HELENE; MARTINEZ, SONIA; CARARETO, CLAUDIA M. A.; VIEIRA, CRISTINA. Specific Activation of an I-Like Element in Drosophila Interspecific Hybrids. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, v. 6, n. 7, p. 1806-1817, . Citações Web of Science: 7. (10/10731-4, 10/10056-5)

LOPES, FABRICIO R.; JJINGO, DAUDI; DA SILVA, CARLOS R. M.; ANDRADE, ALAN C.; MARRACCINI, PIERRE; TEIXEIRA, JOAO B.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; PEREIRA, GONCALO A. G.; PEREIRA, LUIZ FILIPE P.; VANZELA, ANDRE L. L.; et al. Transcriptional Activity, Chromosomal Distribution and Expression Effects of Transposable Elements in Coffea Genomes. PLoS One, v. 8, n. 11, . Citações Web of Science: 12. (08/05894-1, 07/55985-0)

DIAS, ELAINE SILVA; HATT, CLEMENCE; HAMON, SERGE; HAMON, PERLA; RIGOREAU, MICHEL; CROUZILLAT, DOMINIQUE; CARARETO, CLAUDIA MARCIA APARECIDA; DE KOCHKO, ALEXANDRE; GUYOT, ROMAIN. Large distribution and high sequence identity of a Copia-type retrotransposon in angiosperm families. Plant Molecular Biology, v. 89, n. 1-2, p. 83-97, . Citações Web of Science: 5. (11/18226-0, 13/15070-4)

HERNANDEZ-HERNANDEZ, ERIC M.; DANIELA FERNANDEZ-MEDINA, RITA; NAVARRO-ESCALANTE, LUCIO; NUNEZ, JONATHAN; BENAVIDES-MACHADO, PABLO; CARARETO, CLAUDIA M. A.. Genome-wide analysis of transposable elements in the coffee berry borer Hypothenemus hampei (Coleoptera: Curculionidae): description of novel families. Molecular Genetics and Genomics, v. 292, n. 3, p. 565-583, . Citações Web of Science: 3. (12/24813-8, 13/15070-4)

LOPEZ-MAESTRE, HELENE; BRINZA, LILIA; MARCHET, CAMILLE; KIELBASSA, JANICE; BASTIEN, SYLVERE; BOUTIGNY, MATHILDE; MONNIN, DAVID; EL FILALI, ADIL; CARARETO, CLAUDIA MARCIA; VIEIRA, CRISTINA; et al. SNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence. Nucleic Acids Research, v. 44, n. 19, . Citações Web of Science: 22. (10/10731-4)

DA CONCEICAO GALEGO, LUIS GUSTAVO; APARECIDA CARARETO, CLAUDIA MARCIA. Variation at the Est3 locus and adaptability to organophosphorous compounds in Zaprionus indianus populations. Entomologia Experimentalis et Applicata, v. 134, n. 1, p. 97-105, . Citações Web of Science: 3. (04/05235-7)

RUIZ‚ MT; CARARETO‚ CMA. Copy number of P elements‚ KP/full-sized P element ratio and their relationships with environmental factors in Brazilian Drosophila melanogaster populations. HEREDITY, v. 91, n. 6, p. 570-576, . (98/08734-1)

GRANZOTTO, ADRIANA; LOPES, FABRICIO R.; LERAT, EMMANUELLE; VIEIRA, CRISTINA; CARARETO, CLAUDIA M. A.. The evolutionary dynamics of the Helena retrotransposon revealed by sequenced Drosophila genomes. BMC Evolutionary Biology, v. 9, . Citações Web of Science: 16. (07/50641-1, 07/53097-0)

SIMAO, MARYANNA C.; HAUDRY, ANNABELLE; GRANZOTTO, ADRIANA; DE SETTA, NATHALIA; CARARETO, CLAUDIA M. A.. Helena and BS: Two Travellers between the Genera Drosophila and Zaprionus. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, v. 10, n. 10, p. 2671-2685, . Citações Web of Science: 0. (16/19271-2)

JULIANA P. DE CASTRO; NATHALIA DE SETTA; CLAUDIA MARCIA A. CARARETO. Distribution and insertion numbers of transposable elements in species of the Drosophila saltans group. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 29, n. 2, p. 384-390, . (00/11313-0, 98/08734-1)

LEAL, BARBARA S. S.; MEDEIROS, LILIAN R.; PERES, ELEN A.; SOBRAL-SOUZA, THADEU; PALMA-SILVA, CLARISSE; ROMERO, GUSTAVO Q.; CARARETO, CLAUDIA M. A.. Insights into the evolutionary dynamics of Neotropical biomes from the phylogeography and paleodistribution modeling of Bromelia balansae. AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, v. 105, n. 10, p. 1725-1734, . Citações Web of Science: 1. (14/08087-0, 07/55827-6, 08/06534-9)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

CASTRO, Juliana Polachini de. Reavaliação da distribuição, diversidade de seqüências, número de cópias e atividade transcricional de elementos transponíveis no grupo saltans de Drosophila, com ênfase no elemento P. 2003. 147f. Tese (Doutorado) – Campus de São José do Rio Preto. Universidade Estadual Paulista (UNESP). São José do Rio Preto. (99/02716-4)

RICCI, Julcimary. Análise da ocorrência de transposição em regiões reguladoras dos genes da família Cyp em espécies de Drosophila. 2009. 128f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto. (07/52889-0)

DIAS, Elaine Silva. Proposição dos modelos de expansão genômica dos elementos de transposição 412 e Bari no genoma de espécies do grupo melanogaster e em populações naturais de Drosophila melanogaster e de D. simulans. 2011. 128f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto. (08/07629-3)

GRANZOTTO, Adriana. A regulação do elemento transponível Helena em Drosophila. 2011. 159f. Tese (Doutorado) – Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto. (07/50641-1)

BOSSO, Rosa Maria Do Vale. Investigação de biomarcadores de suscetibilidade e de exposição ambiental em indivíduos ocupacionalmente expostas à queima de canaviais. . 106f. Tese (Doutorado) – Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto. (00/08391-9)

DIAS, Elaine Silva. Análise de diversidade e expressão de retrotransposons ativos em espécies de Coffea. 2015. 175f. Tese (Doutorado) – . Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. (11/18226-0)

CARNELOSSI, Elias Alberto Gutierrez. Investigação de elementos de transposição em populações de Drosophila mojavensis e D. arizonae e seus híbridos. 2014. 161f. Tese (Doutorado) – . Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociencias, Letras e Ciencias Exatas. (10/10056-5)

SANTOS, Wellington dos. Divergência interpopulacional e interespecífica e processo seletivo atuante nos genes ortólogos a fruitless e Odysseus em Drosophila mojavensis e D. arizonae. 2014. 59f. Dissertação (Mestrado) - . Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. (12/01452-0)

LOPES, Fabrício Ramon. Elementos de transposição como fonte de novidades genéticas em nível transcricional : uma abordagem computacional e molecular. 2011. 150f. Tese (Doutorado) – Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto. (07/55985-0)

ALMEIDA, Luciane Madureira de. Distribuição genômica do elemento transponível P em populações de Drosophila sturtevanti. . 89f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas. Universidade Estadual Paulista. São José do Rio Preto. (97/14646-5)

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