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Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE) (Instituição Sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Raghuvir Krishnaswamy Arni em auxílios à pesquisa e bolsas apoiadas pela FAPESP.
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Nos últimos anos, a expansão de bibliotecas químicas para além de 10E8 compostos abriu novos caminhos para a descoberta de hits contra diversos alvos. No entanto, o tamanho considerável dessas bibliotecas apresenta um desafio para a triagem virtual (VS) tradicional, especialmente para pesquisadores acadêmicos, dada a considerável demanda por recursos computacionais. Em resposta a esse des…
O interior dos organismos constitui ambientes complexos e dinâmicos, com pouca semelhança com os experimentos realizados com proteínas isoladas. Dados sobre as possíveis interações nas quais proteínas específicas podem participar, dentro desses ambientes fisiológicos repletos de biomoléculas, são fundamentais para entender os múltiplos papéis que muitas vezes são desempenhados pelas prote…
O mercado das cervejas artesanais no Brasil vem crescendo exponencialmente e está na contramão da crise econômica que o país vem enfrentando. Na última década, a produção cresceu 64%, saltando de 8,2 bilhões para 13,4 bilhões litros/ano e o número de cervejarias cresceu impressionantes 292%. Nos últimos 3, anos o número de fábricas dobrou chegando a mais de mil com registro no Ministério …
A vitamina B12 atua como cofator de várias reações metabólicas importantes nos organismos vivos. A biossíntese da vitamina B12 é restrita aos procariontes, o que significa que todos os organismos eucarióticos devem adquirir essa molécula através da dieta. Este estudo apresenta a investigação do metabolismo da vitamina B12 e a caracterização da precorrina-4C (11) -metiltransferase (CobM), …
Este projeto de pesquisa colaborativa tem como tema central primário a expressão, caracterização e a determinação das estruturas cristalográficas de enzimas selecionadas.A cristalografia fornece imagens precisas das estruturas tridimensionais das macromoléculas biológicas em nível atômico, que é insuperável por qualquer outra técnica em seu grau de detalhe e precisão. Os modelos estrutura…
Este projeto tem como objetivo identificar e caracterizar interações peptídeo-proteína utilizando técnicas de modelagem. Peptídeos selecionados através de exibição de fagos contra alvos de interesse ser submetido a simulações de previsão estrutural, docking e dinâmica molecular (MD) para avaliar seus modos de ligação e afinidades. Além disso, uma ferramenta de bioinformática será desenvol…
A tuberculose é uma doença infecciosa causada pela bactéria Mycobacterium tuberculosis (MTB), responsável por altos índices de morbidade e mortalidade global. Existem antibióticos e vacinas, mas estes apresentam limitações na prevenção, resistência bacteriana e tratamentos com baixa adesão. A MTB infecta diferentes tipos de células epiteliais e do sistema imunológico, como células dendrít…
o objetivo do projeto é explorar as múltiplas funções de proteínas produzidas por microrganismos patogênicos através de uma abordagem interdisciplinar que inclui técnicas de expressão e purificação de proteínas recombinantes, cultivo de culturas celulares, phage display, cristalografia de proteínas, criomicroscopia eletrônica (Cryo-EM), biologia computacional e metabolômica.
Este projeto tem como objetivo identificar e caracterizar interações peptídeo-proteína utilizando técnicas de modelagem. Peptídeos selecionados através de exibição de fagos contra alvos de interesse ser submetido a simulações de previsão estrutural, docking e dinâmica molecular (MD) para avaliar seus modos de ligação e afinidades. Além disso, uma ferramenta de bioinformática será desenvol…
Uma proteína é uma molécula biológica grande composta por aminoácidos, dobrada em estruturas tridimensionais complexas. As proteínas desempenham papéis cruciais em várias funções biológicas, atuando como enzimas, componentes estruturais e moléculas de sinalização. As proteínas podem desenvolver múltiplos papéis que ainda são pouco conhecidos, relacionado a sua superfície que geralmente ap…
Uma proteína é uma molécula biológica grande composta por aminoácidos, dobrada em estruturas tridimensionais complexas. As proteínas desempenham papéis cruciais em várias funções biológicas, atuando como enzimas, componentes estruturais e moléculas de sinalização. As proteínas podem desenvolver múltiplos papéis que ainda são pouco conhecidos, relacionado a sua superfície que geralmente ap…
Staphylococcus sciuri é uma bactéria comensal e patogênica de significativa relevância clínica e veterinária. Recentemente, uma cepa de S. sciuri foi descrita como o agente etiológico da epidermite exsudativa (EE) em suínos e o principal fator de virulência envolvido nessa manifestação clínica foi a proteína esfoliativa C (ExhC). Essa enzima pertence ao grupo de toxinas esfoliativas (ETs)…
Várias espécies de Staphylococcus expressam toxinas esfoliativas (ETs), que atuam como fatores-chave de virulência facilitando a invasão e infecção do hospedeiro. S. aureus é um patógeno notório que pode produzir diferentes ETs (ETA a ETE) causando doenças graves em humanos e animais de valor econômico, como a síndrome da pele escaldada estafilocócica (SSSS) e mastite. Outras espécies, po…
Infecções por alfa vírus representam um problema muito sério, especialmente nos países em desenvolvimento, onde o precário sistema de saúde pública já está sobrecarregado. Um exemplo importante é a infecção pelo vírus Chikungunya, que resulta em considerável trauma social e econômico e requer atenção urgente. A falta de tratamentos eficazes é composta pela potencialidade da co-infecção do…