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Antonio Carlos Roque da Silva Filho

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Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Possui graduação (1985) e mestrado (1987) em Física pela UNICAMP e doutorado em Ciência Cognitiva e Inteligência Artificial pela Universidade de Sussex, Inglaterra (1992). Atualmente é professor associado (MS-5) da Universidade de São Paulo em Ribeirão Preto (Departamento de Física, FFCLRP), onde criou e coordena o Laboratório de Sistemas Neurais (SisNe). Desenvolve pesquisas na área de neurociência computacional, em particular envolvendo modelos computacionais biologicamente plausíveis para neurônios e redes de neurônios e modelos computacionais para comportamento de animais. Também possui experiência nas áreas de redes complexas e sistemas de apoio à decisão médica, sendo co-autor do Sistema Lepidus de apoio ao diagnóstico médico. Com relação à formação de pessoal, atua como orientador de iniciação científica e de mestrado e doutorado em três programas de pós-graduação de sua unidade na USP (Física Aplicada à Medicina e Biologia, Psicobiologia e Computação Aplicada). Contribui ativamente para o crescimento e consolidação da neurociência computacional em seu país e na América Latina, sendo o criador e diretor da escola internacional LASCON-Latin American School on Computational Neuroscience, que oferece treinamento prático em neurociência computacional para estudantes de pós-graduação e pesquisadores latino-americanos. Atualmente é pesquisador principal e coordenador de Inovação e Transferência Tecnológica do Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática (CEPID NeuroMat) e pesquisador principal do Projeto Temático "Fenômenos Dinâmicos em Redes Complexas: Fundamentos e Aplicações", ambos financiado pela FAPESP (o último co-financiado pelo DFG da Alemanha). Foi também membro da diretoria da Organization for Computational Neuroscience (OCNS) e da diretoria da Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento (SBNeC). (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Em andamento (mais recentes)

  • Resumo

    A presente proposta visa apoiar e consolidar a pesquisa em Neurociência Computacional e de Sistemas desenvolvidaem colaboracões entre os grupos de pesquisa do Departamento de Física da Universidade Federal de Pernambuco (DF-UFPE, Recife), o Departamento de Física da FFCLRP da Universidade de São Paulo (USP, Ribeirão Preto) e o Centro de Matemática, Computação e Cognição da Universidade...

    Neurociência computacional e de sistemas, AP.R

  • Resumo

    Esta proposta, que busca continuar a iniciativa de cooperação brasileiro-germânica atualmente em curso, tem por objetivo estudar os princípios e fundamentos da auto-organização em redes complexas mais gerais, onde a topologia não é simples e a complexidade é muito elaborada. Visando aplicações em situações atuais de interesse, pretende-se, por conseguinte, compreender o papel que a het...

    Fenômenos dinâmicos em redes complexas: fundamentos e aplicações, AP.TEM

  • Resumo

    Propõe-se a criação de um centro de matemática, integrando modelagem matemática com pesquisa básica e aplicada na fronteira da neurociência. A proposta responde à crescente importância da matemática na neurociência teórica. Importante motivação para a criação do centro é a grande quantidade de dados que os laboratórios de pesquisas são capazes de gerar atualmente e cuja análise depende...

    Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática - NeuroMat, AP.CEPID
Concluídos (mais recentes)

  • Resumo

    O objetivo da LASCON é fornecer a estudantes de pós-graduação, pós-docs e jovens pesquisadores uma introdução a métodos computacionais para modelagem e análise de neurônios e redes neuronais. Esses métodos serão ilustrados com o uso dos programas neuroConstruct, NEURON, NEST, MATLAB, XPPAUTO, Brian e Virtual Brain, de ampla utilização pela comunidade científica internacional. O corpo d...

    VIII Latin American school ón computational neuroscience - LASCON 2020, AO.R

  • Resumo

    O objetivo da LASCON é fornecer a estudantes de pós-graduação, pós-docs e jovens pesquisadores uma introdução a métodos computacionais para modelagem e análise de neurônios e circuitos neurais. Esses métodos serão ilustrados com o uso dos programas neuroConstruct, NEURON, NEST, MATLAB, XPP-AUTO, Brian e Virtual Brain, de ampla utilização pela comunidade científica internacional. O corp...

    VII Latin American School on Computational Neuroscience (LASCON 2018), AO.R

  • Resumo

    O objetivo da LASCON é fornecer a estudantes de pós-graduação, pós-docs e jovens pesquisadores uma introdução a métodos computacionais para modelagem e análise de neurônios e circuitos neurais. Esses métodos serão ilustrados com o uso de programas como neuroConstruct, NEURON, NEST, MATLAB, Brian e Virtual Brain, de ampla utilização pela comunidade científica internacional. O corpo doce...

    VI Latin American School on Computational Neuroscience (LASCON 2016), AO.R
Ver todos os Auxílios à pesquisa concluídos
Bolsas no país
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Bolsas no Exterior
Concluídas (mais recentes)

  • Resumo

    Neurônios respondem a estímulos externos e representam esses estímulos como uma sequência de potenciais de ação. Considerando que a informação é codificada no trem de disparos, pode-se questionar: quanta informação é transportada acerca de um dado estímulo pelo trem de disparos? E quais aspectos do estímulo são codificados pela resposta neuronal? Dados experimentais durante atividades ...

    Dinâmica da informação durante tarefas envolvendo memória de trabalho, BE.EP.MS

  • Resumo

    O sistema triangular envolvendo o hipocampo, o córtex pré-frontal (CPF), e tálamo límbico está relacionado, em seu funcionamento saudável, com memória de trabalho e alternância entre estados de consciência. Disfunções neste circuito pode ocasionar em distúrbios psiquiátricos, déficits cognitivos, e amplificação de crises epilépticas. Simulações computacionais e análises matemáticas pod...

    Estudo computacional das interações hipocampo-córtico-talâmicas: simulando atividade oscilatória, BE.EP.DR

  • Resumo

    O córtex cerebral é um sistema complexo com muitas características que se manifestam em diferentes escalas espaciais e temporais. É um sistema composto de populações de células heterogêneas conectadas com alta complexidade. Simulações computacionais de modelos de redes corticais combinadas com ferramentas matemáticas de análise estão contribuindo para aumentar o conhecimento existente ...

    Análise da dinâmica de modelos corticais com populações de células heterogêneas, BE.EP.DD
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 24/10/2020
3 Auxílios à pesquisa em andamento
18 Auxílios à pesquisa concluídos
2 Bolsas no país em andamento
34 Bolsas no país concluídas
3 Bolsas no exterior concluídas
60 Todos os Auxílios e Bolsas
Processos vinculados
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Acesso à informação Acidente vascular cerebral Análise de imagens Aprendizagem Atividade cerebral Axônios Bases de dados Bioengenharia Biofísica de Processos e Sistemas Biofísica Biologia computacional Bulbo olfatório CAD Campos aleatórios Cerebelo Ciência da Computação Ciências Biológicas Ciências Exatas e da Terra Ciências Sociais Aplicadas Climatologia Cognição Comportamento e mecanismos comportamentais Comunicação Congresso nacional Controle motor Controle postural Córtex cerebral Córtex piriforme Córtex somatosensorial Córtex visual Diagnóstico clínico Dinâmica estocástica Dinâmica não linear Divulgação científica Doenças vestibulares Eletroencefalografia Eletrofisiologia Eletrônica Industrial, Sistemas e Controles Eletrônicos Engenharia Biomédica Engenharia Elétrica Engenharia Médica Engenharias Epilepsia Eventos científicos e de divulgação Física Informática médica Informática Inteligência artificial Interação do oceano com a atmosfera Intercâmbio de pesquisadores Interdisciplinar Jornalismo e Editoração Junções comunicantes Linguagem de programação Lulas MATLAB Matemática Metodologia e Técnicas da Computação Modelagem computacional Modelo de Hodgkin-Huxley Modelos matemáticos Neoplasias mamárias Neoplasias Neuroanatomia Neurobiologia Neurociência computacional Neurociências Neurofisiologia Neurogenética Neurônios Neuropsicofarmacologia Peixes Plasticidade neuronal Plataformas de ensino e aprendizagem Probabilidade e Estatística Aplicadas Probabilidade e Estatística Processamento auditivo Processos climáticos Psiquiatria computacional Rede nervosa Redes complexas Redes neurais (computação) Redes neurais Retina Reuniões científicas Simulação numérica Simulação por computador Sinapses elétricas Sincronização Sistemas de Computação Sistemas de apoio à decisão Sistemas dinâmicos Sistemas especialistas Softwares Técnicas e procedimentos diagnósticos Tecnologia biomédica Telencéfalo Web 2.0
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (25)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações24
Citações68
Cit./Artigo2,8
Dados do Web of Science

ROCHA, RODRIGO P.; KOCILLARI, LOREN; SUWEIS, SAMIR; CORBETTA, MAURIZIO; MARITAN, AMOS. Homeostatic plasticity and emergence of functional networks in a whole-brain model at criticality. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Citações Web of Science: 3. (18/08609-8)

BLUNDELL, INGA; BRETTE, ROMAIN; CLELAND, THOMAS A.; CLOSE, THOMAS G.; COCA, DANIEL; DAVISON, ANDREW P.; DIAZ-PIER, SANDRA; MUSOLES, CARLOS FERNANDEZ; GLEESON, PADRAIG; GOODMAN, DAN F. M.; et al. Code Generation in Computational Neuroscience: A Review of Tools and Techniques. FRONTIERS IN NEUROINFORMATICS, v. 12, . Citações Web of Science: 4. (17/04748-0)

PENA, R. F. O.; LIMA, V.; SHIMOURA, R. O.; CEBALLOS, C. C.; ROTSTEIN, H. G.; ROQUE, A. C.. Asymmetrical voltage response in resonant neurons shaped by nonlinearities. Chaos, v. 29, n. 10, . Citações Web of Science: 0. (15/50122-0, 17/05874-0, 13/07699-0, 13/25667-8)

BORGES, F. S.; PROTACHEVICZ, P. R.; PENA, R. F. O.; LAMEU, E. L.; HIGA, V, G. S.; KIHARA, J. A. H.; MATIAS, F. S.; ANTONOPOULOS, C. G.; DE PASQUALE, R.; ROQUE, A. C.; et al. Self-sustained activity of low firing rate in balanced networks. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS, v. 537, . Citações Web of Science: 0. (16/23398-8, 13/07699-0, 15/50122-0, 17/18977-1, 15/07311-7, 11/19296-1, 17/13502-5, 17/20920-8, 17/26439-0, 13/25667-8)

PENA, RODRIGO F. O.; ZAKS, MICHAEL A.; ROQUE, ANTONIO C.. Dynamics of spontaneous activity in random networks with multiple neuron subtypes and synaptic noise. Journal of Computational Neuroscience, v. 45, n. 1, p. 1-28, . Citações Web of Science: 1. (13/25667-8, 13/07699-0, 15/50122-0)

GLEESON, PADRAIG; CANTARELLI, MATTEO; MARIN, BORIS; QUINTANA, ADRIAN; EARNSHAW, MATT; SADEH, SADRA; PIASINI, EUGENIO; BIRGIOLAS, JUSTAS; CANNON, ROBERT C.; CAYCO-GAJIC, N. ALEX; et al. Open Source Brain: A Collaborative Resource for Visualizing, Analyzing, Simulating, and Developing Standardized Models of Neurons and Circuits. NEURON, v. 103, n. 3, p. 395+, . Citações Web of Science: 1. (17/04748-0)

CEBALLOS, CESAR C.; PENA, RODRIGO F. O.; ROQUE, ANTONIO C.; LEAO, RICARDO M.. Non-Decaying postsynaptics potentials and delayed spikes in hippocampal pyramidal neurons generated by a zero slope conductance created by the persistent Na+ current. CHANNELS, v. 12, n. 1, p. 81-88, . Citações Web of Science: 0. (13/07699-0, 13/25667-8, 16/01607-4)

TOMOV, PETER; PENA, RODRIGO F. O.; ROQUE, ANTONIO C.; ZAKS, MICHAEL A.. Mechanisms of Self-Sustained Oscillatory States in Hierarchical Modular Networks with Mixtures of Electrophysiological Cell Types. FRONTIERS IN COMPUTATIONAL NEUROSCIENCE, v. 10, . Citações Web of Science: 3. (15/09916-3, 13/25667-8, 13/07699-0)

ANTUNES, GABRIELA; ROQUE, ANTONIO C.; SIMOES DE SOUZA, FABIO M.. Modelling intracellular competition for calcium: kinetic and thermodynamic control of different molecular modes of signal decoding. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 10. (13/07699-0, 14/08481-0)

DEPETRI, GABRIELA I.; PEREIRA, FELIPE A. C.; MARIN, BORIS; BAPTISTA, MURILO S.; SARTORELLI, J. C.. Dynamics of a parametrically excited simple pendulum. Chaos, v. 28, n. 3, . Citações Web of Science: 0. (11/19296-1, 14/07043-0, 17/04748-0)

DEPETRI, GABRIELA I.; PEREIRA, FELIPE A. C.; MARIN, BORIS; BAPTISTA, MURILO S.; SARTORELLI, J. C.. Dynamics of a parametrically excited simple pendulum. Chaos, v. 28, n. 3, . Citações Web of Science: 0. (11/19296-1, 14/07043-0, 17/04748-0)

ROCHA, RODRIGO P.; KOCILLARI, LOREN; SUWEIS, SAMIR; CORBETTA, MAURIZIO; MARITAN, AMOS. Homeostatic plasticity and emergence of functional networks in a whole-brain model at criticality. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Citações Web of Science: 3. (18/08609-8)

BLUNDELL, INGA; BRETTE, ROMAIN; CLELAND, THOMAS A.; CLOSE, THOMAS G.; COCA, DANIEL; DAVISON, ANDREW P.; DIAZ-PIER, SANDRA; MUSOLES, CARLOS FERNANDEZ; GLEESON, PADRAIG; GOODMAN, DAN F. M.; et al. Code Generation in Computational Neuroscience: A Review of Tools and Techniques. FRONTIERS IN NEUROINFORMATICS, v. 12, . Citações Web of Science: 4. (17/04748-0)

CANTARELLI, MATTEO; MARIN, BORIS; QUINTANA, ADRIAN; EARNSHAW, MATT; COURT, ROBERT; GLEESON, PADRAIG; DURA-BERNAL, SALVADOR; SILVER, R. ANGUS; IDILI, GIOVANNI. Geppetto: a reusable modular open platform for exploring neuroscience data and models. PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES, v. 373, n. 1758, SI, . Citações Web of Science: 6. (17/04748-0)

ANTUNES, G.; ROQUE, A. C.; SIMOES-DE-SOUZA, F. M.. Molecular mechanisms of detection and discrimination of dynamic signals. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Citações Web of Science: 1. (16/18825-4, 14/08481-0, 15/50122-0)

ANTUNES, GABRIELA; FARIA DA SILVA, SAMUEL F.; SIMOES DE SOUZA, FABIO M.. Mirror Neurons Modeled Through Spike-Timing-Dependent Plasticity are Affected by Channelopathies Associated with Autism Spectrum Disorder. International Journal of Neural Systems, v. 28, n. 5, SI, . Citações Web of Science: 8. (16/18825-4, 14/08481-0, 15/50122-0)

PENA, RODRIGO F. O.; CEBALLOS, CESAR C.; LIMA, VINICIUS; ROQUE, ANTONIO C.. Interplay of activation kinetics and the derivative conductance determines resonance properties of neurons. Physical Review E, v. 97, n. 4, . Citações Web of Science: 2. (13/25667-8, 17/05874-0, 13/07699-0, 15/50122-0)

ANTUNES, G.; ROQUE, A. C.; SIMOES-DE-SOUZA, F. M.. Stochastic Induction of Long-Term Potentiation and Long-Term Depression. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 4. (14/08481-0, 15/50122-0, 13/07699-0)

PENA, RODRIGO F. O.; VELLMER, SEBASTIAN; BERNARDI, DAVIDE; ROQUE, ANTONIO C.; LINDNER, BENJAMIN. Self-Consistent Scheme for Spike-Train Power Spectra in Heterogeneous Sparse Networks. FRONTIERS IN COMPUTATIONAL NEUROSCIENCE, v. 12, . Citações Web of Science: 4. (15/50122-0, 13/25667-8, 13/07699-0)

VINÍCIUS LIMA CORDEIRO; RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA PENA; CESAR AUGUSTO CELIS CEBALLOS; RENAN OLIVEIRA SHIMOURA; ANTONIO CARLOS ROQUE. Aplicações da teoria da informação à neurociência. Revista Brasileira de Ensino de Física, v. 41, n. 2, p. -, . (13/25667-8, 17/07688-9, 17/05874-0, 13/07699-0, 15/50122-0)

PENA, RODRIGO F. O.; CEBALLOS, CESAR CELIS; DE DEUS, JUNIA LARA; ROQUE, ANTONIO CARLOS; GARCIA-CAIRASCO, NORBERTO; LEAO, RICARDO MAURICIO; SIQUEIRA CUNHA, ALEXANDRA OLIMPIO. Modeling Hippocampal CA1 Gabaergic Synapses of Audiogenic Rats. International Journal of Neural Systems, v. 30, n. 5, . Citações Web of Science: 0. (15/22327-7, 13/07699-0, 15/50122-0, 16/01607-4, 07/50261-4, 13/25667-8)

AMORIM, MATEUS R.; PENA, RODRIGO F. O.; SOUZA, GEORGE M. P. R.; BONAGAMBA, LENI G. H.; ROQUE, ANTONIO C.; MACHADO, BENEDITO H.. Firing properties of ventral medullary respiratory neurons in sino-aortic denervated rats. Experimental Physiology, v. 104, n. 1, p. 39-49, . Citações Web of Science: 0. (13/06077-5, 15/50122-0, 13/15195-1, 13/07699-0, 13/25667-8)

ANTUNES, G.; SIMOES-DE-SOUZA, F. M.. AMPA receptor trafficking and its role in heterosynaptic plasticity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Citações Web of Science: 2. (16/18825-4, 14/08481-0, 15/50122-0)

TEJADA, JULIAN; ROQUE, ANTONIO C.. Computational models of dentate gyrus with epilepsy-induced morphological alterations in granule cells. Epilepsy & Behavior, v. 38, n. SI, p. 63-70, . Citações Web of Science: 6. (12/17057-2)

TEJADA, JULIAN; GARCIA-CAIRASCO, NORBERTO; ROQUE, ANTONIO C.. Combined Role of Seizure-Induced Dendritic Morphology Alterations and Spine Loss in Newborn Granule Cells with Mossy Fiber Sprouting on the Hyperexcitability of a Computer Model of the Dentate Gyrus. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 10, n. 5, . Citações Web of Science: 13. (12/17057-2)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

PENA, Rodrigo Felipe de Oliveira. Emergência de flutuações de atividade em modelos de redes corticais com populações neurais heterogêneas. Tese (Doutorado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (13/25667-8) 

HERRERA, Héctor Julián Tejada. Modelos matemáticos e computacionais para o comportamento do rato no labirinto em cruz elevado. Tese (Doutorado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (05/60401-2) 

PUBLIO, Rodrigo. Estudo computacional sobre a influência de sinapses elétricas entre bastonetes na faixa dinâmica escotópica da retina de vertebrados. Tese (Doutorado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (04/00929-0) 

SOUZA, Fábio Marques Simões de. Simulação computacional do sistema olfativo de vertebrados.. Dissertação (Mestrado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (00/02630-1) 

OLIVEIRA, Rodrigo Freire. Modelação do processamento neuronal primário no sistema visual de mamíferos.. Dissertação (Mestrado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (98/11877-9) 

SOUZA, Fábio Marques Simões de. "Estudo da origem e do papel das oscilações elétricas em um modelo computacional do sistema olfativo de vertebrados".. Tese (Doutorado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (01/14060-8) 

OLIVEIRA, Rodrigo Freire. Modelação de fenômenos de plasticidade rápida no sistema visual de mamíferos. Tese (Doutorado) -  Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto.  Universidade de São Paulo (USP).  Ribeirão Preto.  (02/01338-0) 

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