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Shaker Chuck Farah

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Israel

Possui graduação em Bioquímica e Química pela University of Toronto (1985), mestrado em Bioquímica também pela University of Toronto (1988) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (1994). Atualmente é professor Titular no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. O foco principal da sua pesquisa é entender a base estrutural de processos importantes para a comportamentos bacterianos complexos, utilizando como modelo o fitopatógeno Xanthomonas citri, causador do cancro cítrico. Os sistemas sob estudo incluem: i) Vias de sinalização que envolvem o importante segundo mensageiro bis(3´-5´)diGMP cíclico (c-diGMP) que controla comportamentos complexos em bactéria como produção de fatores patogênicos, pili de tipo IV, motilidade e formação de biofilmes, ii) O funcionamento e regulação do pilus do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para se translocar sobre superfícies sólidas (motilidade "twitching") e para se organizar em biofilmes, iii) O funcionamento do sistema de secreção do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para transferir toxinas para outras bactérias, iv) O fenômeno de 'quorum sensing' pelo qual bactérias dentro de uma população coordenam suas atividades em uma maneira dependente de densidade celular. Suas pesquisas técnicas de biologia estrutural (cristalografia, microscopia eletrônica e RMN de proteínas), espectroscopia, microscopia de fluorescência, produção de nocautes gênicos e a análise de redes de interação proteína-proteína. (Fonte: Currículo Lattes)

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Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 14/09/2019
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (19)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações18
Citações195
Cit./Artigo10,8
Dados do Web of Science

BAYER-SANTOS, ETHEL; CESETI, LUCAS DE MORAES; FARAH, CHUCK SHAKER; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA ELISA. Distribution, Function and Regulation of Type 6 Secretion Systems of Xanthomonadales. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, . Citações Web of Science: 0. (18/04553-8, 17/17303-7, 17/02178-2, 18/01852-4, 17/02318-9)

BAYER-SANTOS, ETHEL; LIMA, LIDIA DOS PASSOS; CESETI, LUCAS DE MORAES; RATAGAMI, CAMILA YURI; DE SANTANA, ELIANE SILVA; DA SILVA, ALINE MARIA; FARAH, CHUCK SHAKER; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA ELISA. Xanthomonas citri T6SS mediates resistance to Dictyostelium predation and is regulated by an ECF sigma factor and cognate Ser/Thr kinase. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 20, n. 4, SI, p. 1562-1575, . Citações Web of Science: 3. (15/25381-2, 16/08400-6, 14/25261-4, 14/19720-6, 11/07777-5)

BAYER-SANTOS, ETHEL; MARINI, MARJORIE M.; DA SILVEIRA, JOSE F.. Non-coding RNAs in Host-Pathogen Interactions: Subversion of Mammalian Cell Functions by Protozoan Parasites. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 8, . Citações Web of Science: 6. (15/25381-2, 11/51475-3)

SGRO, GERMAN G.; OKA, GABRIEL U.; SOUZA, DIORGE P.; CENENS, WILLIAM; BAYER-SANTOS, ETHEL; MATSUYAMA, BRUNO Y.; BUENO, NATALIA F.; DOS SANTOS, THIAGO RODRIGO; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; SALINAS, ROBERTO K.; et al. Bacteria-Killing Type IV Secretion Systems. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, . Citações Web of Science: 1. (17/17303-7, 17/02178-2, 18/01852-4)

SGRO, GERMAN G.; COSTA, TIAGO R. D.; CENENS, WILLIAM; SOUZA, DIORGE P.; CASSAGO, ALEXANDRE; DE OLIVEIRA, LUCIANA COUTINHO; SALINAS, ROBERTO K.; PORTUGAL, V, RODRIGO; FARAH, CHUCK S.; WAKSMAN, GABRIEL. Cryo-EM structure of the bacteria-killing type IV secretion system core complex from Xanthomonas citri. NATURE MICROBIOLOGY, v. 3, n. 12, p. 1429-1440, . Citações Web of Science: 7. (17/17303-7, 11/07777-5)

TEIXEIRA, RAPHAEL D.; GUZZO, CRISTIANE R.; AREVALO, SANTIAGO JUSTO; ANDRADE, MAXUEL O.; ABRAHAO, JOSIELLE; DE SOUZA, ROBSON F.; FARAH, CHUCK S.. A bipartite periplasmic receptor-diguanylate cyclase pair (XAC2383-XAC2382) in the bacterium Xanthomonas citri. Journal of Biological Chemistry, v. 293, n. 27, p. 10767-10781, . Citações Web of Science: 0. (11/07777-5)

CESETI, LUCAS M.; DE SANTANA, ELIANE S.; RATAGAMI, CAMILA Y.; BARREIROS, YASMIN; LIMA, LIDIA DOS PASSOS; DUNGER, GERMAN; FARAH, CHUCK S.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.. The Xanthomonas citri pv. citri Type VI Secretion System is Induced During Epiphytic Colonization of Citrus. Current Microbiology, v. 76, n. 10, p. 1105-1111, . Citações Web of Science: 0. (11/22571-4, 16/08400-6, 14/19720-6, 17/02318-9, 18/01852-4, 14/25261-4, 11/07777-5)

ABIKO, LAYARA AKEMI; VITALE, PHELIPE M.; FAVARO, DENIZE C.; HAUK, PRICILA; LI, DA-WEI; YUAN, JIAQI; BRUSCHWEILER-LI, LEI; SALINAS, ROBERTO K.; BRUSCHWEILER, RAFAEL. Model for the allosteric regulation of the Na+/Ca2+ exchanger NCX. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 84, n. 5, p. 580-590, . Citações Web of Science: 3. (13/50355-0, 13/17883-2, 11/07777-5)

DUNGER, GERMAN; LLONTOP, EDGAR; GUZZO, CRISTIANE R.; FARAH, CHUCK S.. The Xanthomonas type IV pilus. Current Opinion in Microbiology, v. 30, p. 88-97, . Citações Web of Science: 12. (11/07777-5)

CAPPELLETTI, PAOLA A.; DOS SANTOS, RAFAEL FREITAS; DO AMARAL, ALEXANDRE M.; HOMEM, RAFAEL AUGUSTO; SOUZA, THAIS DOS SANTOS; MACHADO, MARCOS A.; FARAH, CHUCK S.. Structure-Function Analysis of the HrpB2-HrcU Interaction in the Xanthomonas citri Type III Secretion System. PLoS One, v. 6, n. 3, p. e17614, . Citações Web of Science: 7. (05/59243-3)

GUZZO, CRISTIANE R.; NAGEM, RONALDO A. P.; GALVÃO-BOTTON, LEONOR M. P.; GUIMARÃES, BEATRIZ G.; MEDRANO, FRANCISCO J.; BARBOSA, JOÃO A. R. G.; FARAH, SHAKER CHUCK. Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of YaeQ (XAC2396) from Xanthomonas axonopodis pv. citri. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 61, n. 5, p. 493-495, . (01/07534-3)

CORREA, FERNANDO; SALINAS, ROBERTO KOPKE; BONVIN, ALEXANDRE M. J. J.; FARAH, CHUCK S.. Deciphering the role of the electrostatic interactions in the alpha-tropomyosin head-to-tail complex. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 73, n. 4, p. 902-917, . Citações Web of Science: 5. (05/59243-3)

SOUZA, DIORGE P.; OKA, GABRIEL U.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; BISSON-FILHO, ALEXANDRE W.; DUNGER, GERMAN; HOBEIKA, LISE; CAVALCANTE, NAYARA S.; ALEGRIA, MARCOS C.; BARBOSA, LEANDRO R. S.; SALINAS, ROBERTO K.; et al. Bacterial killing via a type IV secretion system. NATURE COMMUNICATIONS, v. 6, . Citações Web of Science: 44. (05/59243-3, 07/59425-0, 09/54009-3, 11/07777-5)

DUNGER, GERMAN; GUZZO, CRISTIANE R.; ANDRADE, MAXUEL O.; JONES, JEFFREY B.; FARAH, CHUCK S.. Xanthomonas citri subsp citri Type IV Pilus Is Required for Twitching Motility, Biofilm Development, and Adherence. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 27, n. 10, p. 1132-1147, . Citações Web of Science: 24. (11/22571-4, 11/07777-5)

OLIVEIRA, LUCIANA COUTINHO; SOUZA, DIORGE PAULO; OKA, GABRIEL UMAJI; LIMA, FILIPE DA SILVA; OLIVEIRA, RONALDO JUNIO; FAVARO, DENIZE CRISTINA; WIENK, HANS; BOELENS, ROLF; FARAH, CHUCK SHAKER; SALINAS, ROBERTO KOPKE. VirB7 and VirB9 Interactions Are Required for the Assembly and Antibacterial Activity of a Type IV Secretion System. Structure, v. 24, n. 10, p. 1707-1718, . Citações Web of Science: 4. (13/17883-2, 11/07777-5)

GUZZO, CRISTIANE R.; DUNGER, GERMAN; SALINAS, ROBERTO KOPKE; FARAH, CHUCK S.. Structure of the PilZ-FimX(EAL)-c-di-GMP Complex Responsible for the Regulation of Bacterial Type IV Pilus Biogenesis. Journal of Molecular Biology, v. 425, n. 12, p. 2174-2197, . Citações Web of Science: 24. (09/14477-8, 11/22571-4, 11/07777-5)

SOUZA, DIORGE P.; ANDRADE, MAXUEL O.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; ARANTES, GUILHERME M.; FARAH, CHUCK S.; SALINAS, ROBERTO K.. A Component of the Xanthomonadaceae Type IV Secretion System Combines a VirB7 Motif with a N0 Domain Found in Outer Membrane Transport Proteins. PLOS PATHOGENS, v. 7, n. 5, p. e1002031, . Citações Web of Science: 32. (05/59243-3, 07/52735-3, 06/61091-0)

DUNGER, GERMAN; GAROFALO, CECILIA G.; GOTTIG, NATALIA; GARAVAGLIA, BETIANA S.; PEREDA ROSA, MARIA C.; FARAH, CHUCK S.; ORELLANO, ELENA G.; OTTADO, JORGELINA. Analysis of three Xanthomonas axonopodis pv. citri effector proteins in pathogenicity and their interactions with host plant proteins. MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, v. 13, n. 8, p. 865-876, . Citações Web of Science: 13. (05/59243-3)

OLIVEIRA, MAYCON C.; TEIXEIRA, RAPHAEL D.; ANDRADE, MAXUEL O.; PINHEIRO, GLAUCIA M. S.; RAMOS, CARLOS H. I.; FARAH, CHUCK S.. Cooperative Substrate Binding by a Diguanylate Cyclase. Journal of Molecular Biology, v. 427, n. 2, p. 415-432, . Citações Web of Science: 10. (11/07777-5)

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