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Leandro Martinez

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Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Química (IQ)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Bacharel em Quimica, Mestre em Ciencias e Doutor em Fisico-Quimica pela Universidade Estadual de Campinas. Fez pós-doutorado na Unidade de Bioinformática Estrutural do Instituto Pasteur em Paris, e na Unicamp. Tem experiência em Química Teórica e Computacional. Estuda a biofisica de proteinas, em particular modelagem de proteínas usando restrições de distância e estabilidade conformacional em meios não-convencionais. Foi docente no Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo de 2010 a 2012. Atualmente é livre docente no Instituto de Química da Unicamp. (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 12/10/2019
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações29
Citações325
Cit./Artigo11,2
Dados do Web of Science

. MEASURING THE CONDUCTIVITY OF VERY DILUTE ELECTROLYTE SOLUTIONS, DROP BY DROP. Química Nova, v. 41, n. 7, p. -, . (13/05475-7, 13/08293-7, 10/16947-9)

BLEICHER, LUCAS; PRATES, ERICA T.; GOMES, THIAGO C. F.; SILVEIRA, RODRIGO L.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; ROJAS, ADRIANA L.; GOLUBEV, ALEXANDER; MARTINEZ, LEANDRO; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Molecular Basis of the Thermostability and Thermophilicity of Laminarinases: X-ray Structure of the Hyperthermostable Laminarinase from Rhodothermus marinus and Molecular Dynamics Simulations. Journal of Physical Chemistry B, v. 115, n. 24, p. 7940-7949, . Citações Web of Science: 18. (10/08680-2, 10/18849-4, 09/14107-6, 10/16947-9)

DE ARAUJO, ALEXANDRE SUMAN; MARTINEZ, LEANDRO; NICOLUCI, RICARDO DE PAULA; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Structural modeling of high-affinity thyroid receptor-ligand complexes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 39, n. 11, p. 1523-1536, . Citações Web of Science: 12. (06/06831-8, 06/00182-8, 06/01977-4)

SILVEIRA, RODRIGO L.; MARTINEZ, JULIAN; SKAF, MUNIR S.; MARTINEZ, LEANDRO. Enzyme Microheterogeneous Hydration and Stabilization in Supercritical Carbon Dioxide. Journal of Physical Chemistry B, v. 116, n. 19, p. 5671-5678, . Citações Web of Science: 26. (10/08680-2, 10/16947-9)

MARTINEZ, LEANDRO; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. Only subtle protein conformational adaptations are required for ligand binding to thyroid hormone receptors: Simulations using a novel multipoint steered molecular dynamics approach. Journal of Physical Chemistry B, v. 112, n. 34, p. 10741-10751, . Citações Web of Science: 49. (06/06831-8, 06/00182-8)

MINO-GALAZ, GERMAN A.. Allosteric Communication Pathways and Thermal Rectification in PDZ-2 Protein: A Computational Study. Journal of Physical Chemistry B, v. 119, n. 20, p. 6179-6189, . Citações Web of Science: 20. (13/05475-7, 10/16947-9)

LIMA, LEONARDO H. F.; SERPA, VIVIANE I.; ROSSETO, FLAVIO R.; SARTORI, GERALDO RODRIGUES; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; MARTINEZ, LEANDRO; POLIKARPOV, IGOR. Small-angle X-ray scattering and structural modeling of full-length: cellobiohydrolase I from Trichoderma harzianum. Cellulose, v. 20, n. 4, p. 1573-1585, . Citações Web of Science: 7. (08/56255-9, 07/08706-9, 10/16947-9, 09/52840-7, 08/05637-9)

COSTA MONDEGO, JORGE MAURICIO; DUARTE, MELINA PASINI; KIYOTA, EDUARDO; MARTINEZ, LEANDRO; DE CAMARGO, SANDRA RODRIGUES; DE CAROLI, FERNANDA P.; CAPELA ALVES, BEATRIZ SANTOS; CARMELLO GUERREIRO, SANDRA MARIA; VILELA OLIVA, MARIA LUIZA; GUERREIRO-FILHO, OLIVEIRO; et al. Molecular characterization of a miraculin-like gene differentially expressed during coffee development and coffee leaf miner infestation. PLANTA, v. 233, n. 1, p. 123-137, . Citações Web of Science: 15. (03/09361-4)

MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; GARCIA, WANIUS; BATISTA, FERNANDA A. H.; PORTUGAL, RODRIGO V.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; NAKAHIRA, MARCEL; LIMA, LUIS M. T. R.; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. On the Denaturation Mechanisms of the Ligand Binding Domain of Thyroid Hormone Receptors. Journal of Physical Chemistry B, v. 114, n. 3, p. 1529-1540, . Citações Web of Science: 5. (06/06831-8, 06/00182-8)

BATISTA, MARIANA R. B.; MARTINEZ, LEANDRO. Dynamics of Nuclear Receptor Helix-12 Switch of Transcription Activation by Modeling Time-Resolved Fluorescence Anisotropy Decays. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 105, n. 7, p. 1670-1680, . Citações Web of Science: 23. (10/16947-9, 13/07131-3)

MARTINEZ, LEANDRO. Automatic Identification of Mobile and Rigid Substructures in Molecular Dynamics Simulations and Fractional Structural Fluctuation Analysis. PLoS One, v. 10, n. 3, . Citações Web of Science: 12. (13/05475-7, 10/16947-9)

BIRGIN, ERNESTO G.; MARTINEZ, J. M.; MARTINEZ, LEANDRO; ROCHA, GERD B.. Sparse Projected-Gradient Method As a Linear-Scaling Low-Memory Alternative to Diagonalization in Self-Consistent Field Electronic Structure Calculations. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 9, n. 2, p. 1043-1051, . Citações Web of Science: 10. (10/16947-9, 06/53768-0, 03/09169-6, 08/00468-4)

SOUZA, P. C. T.; PUHL, A. C.; MARTINEZ, L.; APARICIO, R.; NASCIMENTO, A. S.; FIGUEIRA, A. C. M.; NGUYEN, P.; WEBB, P.; SKAF, M. S.; POLIKARPOV, I.. Identification of a New Hormone-Binding Site on the Surface of Thyroid Hormone Receptor. MOLECULAR ENDOCRINOLOGY, v. 28, n. 4, p. 534-545, . Citações Web of Science: 18. (13/08293-7, 10/17048-8)

JARA, GABRIEL E.; MARTINEZ, LEANDRO. Anthrax Edema Factor: An Ion-Adaptive Mechanism of Catalysis with Increased Transition-State Conformational Flexibility. Journal of Physical Chemistry B, v. 120, n. 27, p. 6504-6514, . Citações Web of Science: 1. (13/05475-7, 13/22360-9, 10/16947-9, 13/08293-7)

CENSONI, LUCIANO; MUNIZ, HELOISA DOS SANTOS; MARTINEZ, LEANDRO. A network model predicts the intensity of residue-protein thermal coupling. Bioinformatics, v. 33, n. 14, p. 2106-2113, . Citações Web of Science: 0. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

SIQUEIRA, TAYANE HONORATO; MARTINEZ, LEANDRO. Molecular simulations of fluconazole-mediated inhibition of sterol biosynthesis. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, . Citações Web of Science: 0. (10/16947-9, 13/08293-7)

CENSONI, LUCIANO; MARTINEZ, LEANDRO. Prediction of kinetics of protein folding with non-redundant contact information. Bioinformatics, v. 34, n. 23, p. 4034-4038, . Citações Web of Science: 0. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

MARTINEZ, LEANDRO. Introducing the Levinthal's Protein Folding Paradox and Its Solution. Journal of Chemical Education, v. 91, n. 11, p. 1918-1923, . Citações Web of Science: 4. (13/05475-7, 10/16947-9)

LIBERATO, MARCELO VIZONA; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; AYERS, STEVEN D.; LIN, JEAN Z.; CVORO, ALEKSANDRA; SILVEIRA, RODRIGO L.; MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; SAIDEMBERG, DANIEL; DENG, TUO; et al. Medium Chain Fatty Acids Are Selective Peroxisome Proliferator Activated Receptor (PPAR) gamma Activators and Pan-PPAR Partial Agonists. PLoS One, v. 7, n. 5, . Citações Web of Science: 73. (04/08070-9, 06/06831-8, 06/00182-8)

LESCANO, CAROLINE HONAISER; DE OLIVEIRA, IVAN PIRES; ZAMINELLI, TIAGO; BALDIVIA, DEBORA DA SILVA; DA SILVA, LUAN RAMOS; NAPOLITANO, MAURO; MENDES SILVERIO, CAMILA BITENCOURT; LINCOPAN, NILTON; SANJINEZ-ARGANDONA, ELIANA JANET. Campomanesia adamantium Peel Extract in Antidiarrheal Activity: The Ability of Inhibition of Heat-Stable Enterotoxin by Polyphenols. PLoS One, v. 11, n. 10, . Citações Web of Science: 7. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

MARTINEZ, LEANDRO; SHIMIZU, SEISHI. Molecular Interpretation of Preferential Interactions in Protein Solvation: A Solvent-Shell Perspective by Means of Minimum-Distance Distribution Functions. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 13, n. 12, p. 6358-6372, . Citações Web of Science: 6. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

DOS SANTOS, RICARDO NASCIMENTO; KHAN, SHAHID; MORCOS, FARUCK. Characterization of C-ring component assembly in flagellar motors from amino acid coevolution. ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE, v. 5, n. 5, . Citações Web of Science: 2. (15/13667-9)

DE OLIVEIRA, IVAN PIRES; JARA, GABRIEL ERNESTO; MARTINEZ, LEANDRO. Molecular mechanism of activation of Burkholderia cepacia lipase at aqueous-organic interfaces. Physical Chemistry Chemical Physics, v. 19, n. 46, p. 31499-31507, . Citações Web of Science: 2. (13/05475-7, 13/22360-9, 10/16947-9, 13/08293-7)

DOS SANTOS, RICARDO N.; FERRARI, ALLAN J. R.; DE JESUS, HUGO C. R.; GOZZO, FABIO C.; MORCOS, FARUCK; MARTINEZ, LEANDRO. Enhancing protein fold determination by exploring the complementary information of chemical cross-linking and coevolutionary signals. Bioinformatics, v. 34, n. 13, p. 2201-2208, . Citações Web of Science: 2. (10/16947-9, 15/13667-9, 13/08293-7, 13/05475-7, 14/17264-3, 16/13195-2)

LOPEZ, ALVARO J.; MARTINEZ, LEANDRO. Parametric models to compute tryptophan fluorescence wavelengths from classical protein simulations. Journal of Computational Chemistry, v. 39, n. 19, p. 1249-1258, . Citações Web of Science: 1. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

OLIVEIRA, IVAN P.; MARTINEZ, LEANDRO. Molecular basis for competitive solvation of the Burkholderia cepacia lipase by sorbitol and urea. Physical Chemistry Chemical Physics, v. 18, n. 31, p. 21797-21808, . Citações Web of Science: 5. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

SEGATO, FERNANDO; BERTO, GABRIELA L.; DE ARAUJO, EVANDRO ARES; MUNIZ, JOAO RENATO; POLIKARPOV, IGOR. Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of Aspergillus terreus endo-beta-1,4-glucanase from glycoside hydrolase family 12. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 70, n. 2, p. 267-270, . Citações Web of Science: 4. (10/16947-9, 09/52840-7, 08/05637-9)

CAMPOS, LIVIA WEIJENBORG; ZENATTI, PRISCILA PINI; PISSINATO, LEONARDO GRANATO; RODRIGUES, GISELE O. LIBANIO; ARTICO, LEONARDO LUIS; GUIMARAES, THAIS RAFAEL; ARCHANGELO, LETICIA FROHLICH; MARTINEZ, LEANDRO; BROOKS, ANDREW J.; YUNES, JOSE ANDRES. Oncogenic basic amino acid insertions at the extracellular juxtamembrane region of IL7RA cause receptor hypersensitivity. Blood, v. 133, n. 11, p. 1259-1263, . Citações Web of Science: 0. (10/16947-9, 12/12802-1, 14/20015-5, 13/08293-7)

MARTINEZ, LEANDRO. MEASURING THE CONDUCTIVITY OF VERY DILUTE ELECTROLYTE SOLUTIONS, DROP BY DROP. Química Nova, v. 41, n. 7, p. 814-817, . Citações Web of Science: 2. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

DE OLIVEIRA, IVAN PIRES; LESCANO, CAROLINE HONAISER; DE NUCCI, GILBERTO. Q817G mutation in phosphodiesterase type 5: Conformational analysis and dissociation profile of the inhibitor Tadalafil. CHEMICAL BIOLOGY & DRUG DESIGN, v. 93, n. 4, p. 419-429, . Citações Web of Science: 1. (13/05475-7, 10/16947-9, 13/08293-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BATISTA, Mariana Raquel Bunoro. Mobilidade da hélice 12 de receptores nucleares: comparação entre simulações de dinâmica molecular e experimentos de anisotropia de fluorescência. 2013. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Física de São Carlos. Universidade de São Paulo (USP). São Carlos. (11/03993-5)

MARTINEZ, Leandro. Métodos estatísticos de seleção de restrições "cross-linking" para determinação assistida de estruturas de proteínas. 2019. Dissertação (Mestrado) - (10/16947-9)

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