Professor Doutor no Instituto de Computação da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e membro do Laboratório de Inteligência Artificial e Inferência em Dados Complexos (Recod.ai). É doutor em Ciência da Computação pela Universidade de São Paulo (2012), pós-graduado em Bioinformática pela Universität zu Köln (2005) e bacharel em Ciência da Computação pela UNICAMP (2004). Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Aprendizado de Máquina, Biologia Computacional, Inteligência Artificial e Otimização Combinatória. Atua principalmente no desenvolvimento de técnicas nessas áreas e a sua posterior aplicação em problemas práticos de Bioinformática e também de outros temas. (Fonte: Currículo Lattes)
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O aumento da aptidão de células cancerígenas durante a oncogênese é acompanhada de um aumento de diversos estresses celulares, um fenômeno que é exarcebado se aplicada uma superestimulação mitogênica. Recentemente, nosso grupo reportou uma abordagem não-usual para terapia de câncer, que se baseia em superestimulação mitogênica seguida da inibição de vias mitigadoras de estresse. Apesar da…
Uma via de sinalização celular é composta por um conjunto de reações químicas encadeadas que ocorrem no interior da célula. A informação é transmitida através dessa via por mudanças de concentração nas espécias químicas de suas reações. A dinâmica dessas vias pode ser estudada através de modelos baseados em equações diferenciais ordinárias que descrevem a cinética de suas reações. Tais mo…
Vias de sinalização celular são compostas por encadeamentos de reações químicas que transmitem informações no interior de uma célula. A modelagem matemática dessas vias é uma ferramenta importante para testar sua dinâmica frente a diferentes condições iniciais. Em geral, a modelagem se inicia com a definição de um recorte da via de sinalização para o desenho do modelo matemático. Na sequê…
Classificadores de proliferação celular são funções que classificam o nível de proliferação de uma determinada população de células como uma função da cinética de espécies químicas de uma via de sinalização celular. Essas mesmas cinéticas também podem ser utilizadas para calibrar modelos que explicam a dinâmica da via de sinalização em questão. A combinação de um classificador de prolifer…
A seleção de modelos de vias de sinalização celular pode envolver a avaliação de diferentes hipóteses para o conjunto das reações bioquímicas que compõem a via em questão, escolhendo-se uma que seja mais verossímil de ter gerado um conjunto de observações experimentais. Testar sistematicamente diferentes possibilidades pode ser desafiador, pois o espaço de hipóteses é exponencial no númer…
Modelos dinâmicos baseados em equações diferenciais ordinárias (EDOs) são ferramentas úteis para a investigação de vias de sinalização celular. Esses modelos nos permitem fazer previsões sobre o comportamento da via sob diferentes estímulos. Modelos baseados em EDOs são frequentemente calibrados usando dados experimentais obtidos mensurando, após uma dada estimulação de células, uma ou ma…
CV Lattes
ORCID