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Gabriel Rodrigues Alves Margarido

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Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Possui graduação em Engenharia Agronômica pela Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/USP (2006) e Doutorado Direto pelo Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas, no Departamento de Genética da ESALQ/USP (2011). Atuou como pesquisador pós-doutor no eScience Group da Microsoft Research, em Los Angeles. É Professor Doutor junto ao Departamento de Genética da ESALQ/USP desde 2013. Suas principais linhas de estudo são a Genética Quantitativa e a Bioinformática, atuando principalmente no desenvolvimento e aplicação de métodos genético-estatísticos e rotinas de bioinformática para genotipagem, construção de mapas de ligação, montagem de genomas e análise de dados de sequenciamento de última geração, em particular a análise de dados de sequenciamento de RNA. Seu trabalho atual é focado na investigação genômica da cana-de-açúcar, com o objetivo principal de compreender a estrutura e funcionamento deste complexo organismo poliploide. Tem interesse também em outras espécies com potencial importância para a produção de bioenergia. (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Apoio FAPESP em números * Quantidades atualizadas em 04/07/2020
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações8
Citações48
Cit./Artigo6,0
Dados do Web of Science

OLIVEIRA‚ K.M.; PINTO‚ L.R.; MARCONI‚ T.G.; MARGARIDO‚ G.R.A.; PASTINA‚ M.M.; TEIXEIRA‚ L.H.M.; FIGUEIRA‚ A.V.; ULIAN‚ E.C.; GARCIA‚ A.A.F.; SOUZA‚ A.P.. Functional integrated genetic linkage map based on EST-markers for a sugarcane (Saccharum spp.) commercial cross. MOLECULAR BREEDING, v. 20, n. 3, p. 189-208, . (04/10596-9, 02/01167-1, 05/59268-6, 02/00197-4)

MOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; VENCOVSKY, R.; GARCIA, A. A. F.. Evaluation of algorithms used to order markers on genetic maps. HEREDITY, v. 103, n. 6, p. 494-502, . Citações Web of Science: 21. (07/02775-9, 08/54402-4)

DE OLIVEIRA, AMANDA AVELAR; PASTINA, MARIA MARTA; DE SOUZA, VANDER FILIPE; DA COSTA PARRELLA, RAFAEL AUGUSTO; NODA, ROBERTO WILLIANS; FERREIRA SIMEONE, MARIA LUCIA; SCHAFFERT, ROBERT EUGENE; DE MAGALHES, JURANDIR VIEIRA; BORGES DAMASCENO, CYNTHIA MARIA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES. Genomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production. MOLECULAR BREEDING, v. 38, n. 4, . Citações Web of Science: 5. (13/25132-7, 15/22993-7)

SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; et al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12, . Citações Web of Science: 3. (15/22993-7, 11/50761-2, 13/18322-4, 17/02842-0, 12/51062-3, 16/17545-8, 08/52074-0, 16/06917-1, 14/50921-8, 08/52146-0, 13/07467-1, 15/15346-5, 13/23048-9, 17/02270-6)

CORRER, FERNANDO HENRIQUE; HOSAKA, GUILHERME KENICHI; GOMEZ, SERGIO GREGORIO PEREZ; CIA, MARIANA CICARELLI; VITORELLO, CLAUDIA BARROS MONTEIRO; CAMARGO, LUIS EDUARDO ARANHA; MASSOLA JR, NELSON SIDNEI; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES. Time-series expression profiling of sugarcane leaves infected with Puccinia kuehnii reveals an ineffective defense system leading to susceptibility. Plant Cell Reports, . Citações Web of Science: 0. (15/22993-7, 15/17935-8)

GAZAFFI, RODRIGO; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; PASTINA, MARIA MARTA; MOLLINARI, MARCELO; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.. A model for quantitative trait loci mapping, linkage phase, and segregation pattern estimation for a full-sib progeny. Tree Genetics & Genomes, v. 10, n. 4, p. 791-801, . Citações Web of Science: 12. (12/13272-6, 07/02775-9, 10/00083-5, 08/54402-4)

MARGARIDO, G. R. A.; PASTINA, M. M.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F.. Multi-trait multi-environment quantitative trait loci mapping for a sugarcane commercial cross provides insights on the inheritance of important traits. MOLECULAR BREEDING, v. 35, n. 8, . Citações Web of Science: 3. (08/52197-4, 07/02775-9)

DINIZ, AUGUSTO L.; FERREIRA, SAVIO S.; TEN-CATEN, FELIPE; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; DOS SANTOS, JOAO M.; BARBOSA, GERALDO V. DE S.; CARNEIRO, MONALISA S.; SOUZA, GLAUCIA M.. Genomic resources for energy cane breeding in the post genomics era. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, v. 17, p. 1404-1414, . Citações Web of Science: 0. (15/22993-7, 16/06917-1, 14/50921-8, 17/02842-0, 17/02270-6)

PEREIRA, GUILHERME S.; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.; MARGARIDO, GABRIEL R. A.. A fully automated pipeline for quantitative genotype calling from next generation sequencing data in autopolyploids. BMC Bioinformatics, v. 19, . Citações Web of Science: 4. (08/52197-4, 15/22993-7, 12/25236-4)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA, Amanda Avelar de. Métodos de seleção genômica aplicados a sorgo biomassa para produção de etanol de segunda geração. Dissertação (Mestrado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (13/25132-7

CORRER, Fernando Henrique. Perfis de expressão gênica temporal de cana-de-açúcar infectada por ferrugem alaranjada. Dissertação (Mestrado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (15/17935-8

MARGARIDO, Gabriel Rodrigues Alves. Mapeamento de QTLs em múltiplos caracteres e ambientes em cruzamento comercial de cana-de-açucar usando modelos mistos. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (07/02775-9

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