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Milene Ferro
CV Lattes
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Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Instituto de Biociências (IB) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Licenciada e Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade Presbiteriana Mackenzie (2006). Mestre pelo Instituto de Ciências Biomédicas da USP (2008). Doutora em Ciências Biológicas (Biologia Celular e Molecular) pela UNESP de Rio Claro - SP (2013). Atuou como professora bolsista na disciplina Bioinformática Básica (UNESP - Rio Claro) durante 4 anos. Pós-doutoranda em Ciências na UNESP de Rio Claro-SP com bolsa FAPESP. Realizou estágio de Pós-Doutorado no Centro de Investigação Principe Felipe na Espanha com bolsa BEPE - FAPESP, trabalhando com análise de expressão gênica diferencial em transcriptomas de espécies não-modelos (formigas). Experiência em análises de Bioinformática em dados advindos de plataformas de sequenciamento Illumina, pré-processamento, anotação funcional, identificação de ortólogos, expressão gênica diferencial, bibliotecas 16S e ITS, transcriptomas e metatranscriptomas. (Fonte: Currículo Lattes)
Bolsas no país
- Evolução genômica subsidiando a dependência nutricional entre formigas e fungos, BP.PD
Resumo
As formigas da tribo Attini dependem do cultivo de fungos para sua alimentação e se agrupam em diferentes tipos de agricultura conforme o fungo que cultivam. Todas as espécies do grupo basal e a maioria do grupo derivado utilizam material orgânico morto, como folhas e flores secas, sementes e fezes de artrópodes, para cultivar seu fungo como as formigas cortadeiras pragas que cortam e ...
- Administração do banco de dados SIGLEM para catalogação de espécimes de Formigas Attini e suporte para desenvolvimento de sistema de anotação de genomas, BP.TT
Resumo
Material de cerca de 1000 espécimes de formigas Attini será organizado e catalogado no banco de dados SiGLEM, existente em nosso laboratório. Este material constitui-se em amostras em via seca, amostras em via úmida, material gênico, imagens e dados bibliográficos. As imagens taxonomicamente informativas serão produzidas pelo Bolsista e incluídas na base de dados. Todas as imagens e in...
- Desenvolvimento de pipelines para análise de est, bibliotecas 16S e ITS para estudos genômicos em Formigas Attini, BP.DR
Resumo
As formigas Attini são destacadas pragas agrícolas e invertebrados modelos em estudos em genômica, metagenômica, sistemática e evolução molecular. Tais estudos resultam milhares de seqüências nucleotídicas, cuja anotação demanda processamento automático através de pipelines. O presente Projeto de Doutorado propõe desenvolver pipelines inéditos para a análise automática de seqüências de...
Bolsas no exterior
- Análise dos perfis de expressão gênica diferencial entre espécies de formigas cultivadoras e não cultivadoras de fungos, BE.EP.PD
Resumo
Um trabalho recente estabeleceu que as formigas cultivadoras de fungos (subtribo Attina) são um grupo irmão das formigas não cultivadoras de fungos (subtribo Dacetina) e que ambos os clados pertencem a tribo Attini. O primeiro é formado por espécies que apresentam um mutualismo obrigatório com seus fungos para se alimentarem. Por outro lado, as formigas que não cultivam fungos são pre...
- Geração dos perfis de expressão de genes de nutrição usando dados transcriptômicos de formigas Attini, BE.EP.PD
Resumo
Formigas Attini são dependentes do cultivo de fungos para se alimentar. Esta antiga dependência pode ter sido estimulada pela perda precoce de genes da biossíntese de arginina, então formigas contrabalançaram essa deficiência usando as enzimas de seus fungos. Formigas especializadas em digerir hifas fúngicas, apresentam um crescente expressão de genes quitinase selecionados positivamen...
*Quantidades atualizadas em 15/06/2019
Análise de sequência de DNA
Banco de dados
Bioinformática
Biologia Molecular
Biologia computacional
Bioquímica
Ciências Biológicas
Coleção e conservação de espécies biológicas
Eimeria
Etiquetas de sequências expressas
Evolução molecular
Evolução
Expressão gênica
Formigas cortadeiras
Formigas
Fungos
Genética Molecular e de Microorganismos
Genética
Nutrição animal
Parasitologia
Pseudogenes
Transcriptoma
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RAMOS OTERO, IGOR VINICIUS; FERRO, MILENE; BACCI, JR., MAURICIO; FERREIRA, HENRIQUE; SETTE, LARA DURAES. De novo transcriptome assembly: a new laccase multigene family from the marine-derived basidiomycete Peniophora sp CBMAI 1063. AMB EXPRESS, v. 7, DEC 20 2017. Citações Web of Science: 2. (14/17950-4, 13/19486-0, 16/07957-7)
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