Rafael Junqueira Borges

Possui graduação em Ciências Biológicas - Modalidade Médica do IBB - UNESP "Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho" - Campus Botucatu (2009), Mestrado no Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas Área de Concentração: Genética (2012), Doutorado Co-tutela pelo mesmo programa do Mestrado e pelo Programa de Pós-graduação em Biotecnologia da Faculdade de Farmácia da Universidade de Barcelona (2017).De 2007 a 2022, com financiamento da FAPESP trabalhou no laboratório de Biologia Molecular Estrutural do Depto. Física e Biofísica sob orientação do Dr. Marcos Fontes e no laboratório de Desenvolvimento de Métodos do Instituto de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB) sob orientação de Dra. Isabel Usón. No Brasil, trabalhou com purificação de veneno de serpente, cristalografia de raios X, predição estrutural de proteínas, docking e dinâmica molecular, Espalhamento de raios X a baixo ângulo (SAXS), dicroísmo circular (CD), espalhamento de luz dinâmico (DLS). Na Espanha, desenvolveu métodos relacionados a elucidação e interpretação de estruturas cristalográficas. Desenvolveu o software SEQUENCE SLIDER, que extendeu os limites do ARCIMBOLDO, método de faseamento ab initio de macromoléculas idealizado por Dra. Usón, a maiores estruturas e a dados a mais baixa resolução. Integrou a crio-microscopia eletrônica e difração de elétrons ao ARCIMBOLDO e desenvolvendo SLIDER direcionado a proteínas purificadas a partir de fontes naturais, principalmente toxinas de serpentes. Nesta última atividade, integrou dados de cristalografia, crio-microscopia eletrônica, espectrometria de massa e análises filogenéticas para atribuir a sequência a proteínas purificadas a partir de fontes naturais.Recentemente, esteve 4 meses no laboratório de Dr. George Sheldrick em Goettingen (Alemanha), onde aprendeu a utilizar o pacote de programas SHELX e 6 meses no laboratório de Dr. Randy Read em Cambridge (Reino Unido), onde aprimorou seus conhecimentos sobre Substituição Molecular, programa PHASER e estatística. No segundo semeste de 2022, foi professor substituto da Universidade Federal de Viçosa (UFV) lecionando disciplinas de Bioinformática e Bioquímica. Atualmente é pesquisador do Centro de Química Medicinal (CQMED) do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) na Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Neste projeto está desenvolvendo algoritmo que integre dados experimentais biofísicos, bioquímicos e celulares de biblioteca de fragmentos químicos contra proteínas com métodos computacionais para acelerar a descoberta de fármacos e substâncias ativas, em particular hits. Participa de outros projetos do CQMED auxiliando na elucidação de estruturas cristalográficas desafiadores e da função de proteínas pouco estudadas. Em sua trajetória acadêmica, publicou um total de 30 artigos, sendo 6 deles como 1 autor em revista científicas de destaque, como Nucleic Acids Research (Fator de Impacto 19,2) e Nature Communications (FI 17,7). Seu protagonismo nas publicações e independência científica é refletida na sua participação como autor correspondente de 5 publicações. As suas metodologias inovadoras possibilitaram que participasse de diversos projetos de internacionalização com publicações com diferentes grupos de pesquisa, no Brasil (Butantan, FIOCRUZ, UNICAMP e USP), Bélgica (KULeuven), Costa Rica (Instituto Clodomiro Picado), Espanha (University of Zaragoza), Estados Unidos da América (UCLA e Virginia Commonwealth University) e Inglaterra (University of Cambridge). Seus interesses compreendem a aplicação de técnicas teóricas e experimentais, principalmente da biologia estruturais, para relacionar à função de proteínas e estratégias de inibição. Atualmente, está em processo de contratação como pesquisador no CBMEG/UNICAMP. (Fonte: Currículo Lattes)