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Cláudio Benício Cardoso da Silva

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Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Técnico em Agropecuária pela Escola Média de Agropecuária Regional da CEPLAC (EMARC-Ur), Biólogo pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (UESB), concluiu o Doutor em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) ? Área de concentração: Genética Vegetal. Durante a graduação desenvolveu atividades de IC com melhoramento clássico e genética de populações naturais de maracujazeiros (duração de 3 anos e meio). No início do Doutorado desenvolveu pesquisa em biologia molecular caracterizando marcadores funcionais (EST-SSR) em cana-de-açúcar. A partir do segundo ano do doutorado, iniciou suas pesquisas utilizando ferramentas biocomputacionais para análise de transcritos em seis variedades comerciais de cana-de-açúcar, através da técnica de RNA-Seq. Ainda durante o Doutorado, adquiriu vasta experiência em análise de sequências, obtidas por técnicas de sequenciamento de nova geração. Com isso, atuando como colaborador em diversos projetos desenvolvidos dentro e fora da instituição. Como pesquisador de Posdoutorado, colaborou como bioinformata na montagem e anotação de fragmentos genômicos de cana-de-açúcar, sequenciados a partir de bibliotecas de BAC na plataforma PACBio. Por um ano, atuou como pesquisador visitante na University of British Columbia, desenvolvendo atividades em genômica comparativa analisando dados em larga escala (genomas completos), e investigando genes diferencialmente expressos sob diferentes condições de estresse. Possui experiência nos seguintes tópicos: Bioinformática, Genômica, Transcriptômica, Expressão Gênica, Genética Vegetal (Clássica e Molecular). Com enfoque principal no estudo da variação estrutural (fenótipo, genótipo: SNPs, InDels, inserção/deleção de grandes fragmentos, duplicação, aneuploidia) e na dinâmica da expressão gênica. (Fonte: Currículo Lattes)

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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações5
Citações67
Cit./Artigo13,4
Dados do Web of Science

MANTELLO, CAMILA CAMPOS; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; DA SILVA, CARLA CRISTINA; DE SOUZA, LIVIA MOURA; SCALOPPI JUNIOR, ERIVALDO JOSE; GONCALVES, PAULO DE SOUZA; VICENTINI, RENATO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. De Novo Assembly and Transcriptome Analysis of the Rubber Tree (Hevea brasiliensis) and SNP Markers Development for Rubber Biosynthesis Pathways. PLoS One, v. 9, n. 7, . Citações Web of Science: 42. (11/50188-0, 12/50491-8, 09/52975-0, 07/50562-4, 12/11109-0, 12/05473-1, 08/55974-1)

ALMEIDA BALSALOBRE, THIAGO WILLIAN; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES; GAZAFFI, RODRIGO; BARRETO, FERNANDA ZATTI; ANONI, CARINA OLIVEIRA; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; COSTA, ESTELA ARAUJO; MANCINI, MELINA CRISTINA; HOFFMANN, HERMANN PAULO; et al. GBS-based single dosage markers for linkage and QTL mapping allow gene mining for yield-related traits in sugarcane. BMC Genomics, v. 18, . Citações Web of Science: 22. (10/50549-0, 12/25236-4, 10/50031-1, 10/50091-4, 08/52197-4, 12/11109-0, 08/57908-6)

BARRETO, M. A.; ROSA, J. R. B. F.; HOLANDA, I. S. A.; CARDOSO-SILVA, C. B.; VILDOSO, C. I. A.; AHNERT, D.; SOUZA, M. M.; CORREA, R. X.; ROYAERT, S.; MARELLI, J.; et al. QTL mapping and identification of corresponding genomic regions for black pod disease resistance to three Phytophthora species in Theobroma cacao L.. EUPHYTICA, v. 214, n. 10, . Citações Web of Science: 1. (12/11109-0)

SFORCA, DANILO AUGUSTO; VAUTRIN, SONIA; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; MANCINI, MELINA CRISTINA; ROMERO-DA CRUZ, MARIA VICTORIA; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA; CONTE, MONICA; BELLEC, ARNAUD; DAHMER, NAIR; FOURMENT, JOELLE; et al. Gene Duplication in the Sugarcane Genome: A Case Study of Allele Interactions and Evolutionary Patterns in Two Genic Regions. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 10, . Citações Web of Science: 0. (15/16399-5, 08/52197-4, 10/50119-6, 14/11482-9)

MANCINI, MELINA C.; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO B.; SFORCA, DANILO A.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. ``Targeted Sequencing by Gene Synteny,{''} a New Strategy for Polyploid Species: Sequencing and Physical Structure of a Complex Sugarcane Region. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, . Citações Web of Science: 2. (17/05014-0, 15/16399-5, 08/52197-4, 10/50119-6, 14/11482-9)

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