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Marcelo Falsarella Carazzolle

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Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia (IB)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Marcelo Falsarella Carazzolle possui graduação, mestrado e doutorado em Física pela Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) tendo desenvolvido trabalhos experimentais em difração utilizando radiação síncrotron e simulações computacionais de sólidos utilizando teoria quântica do funcional densidade (DFT), todos aplicados à área de física de superfícies. Desde 2006 é funcionário da Unicamp, contratado para desenvolver pesquisa na área de bioinformática e coordenador do laboratório de bioinformática do LGE (laboratório de genômica e expressão). Foi pesquisador associado da área de bioinformática no Laboratório Nacional de Biociências (LNBIO/CNPEM) de novembro de 2009 a junho de 2012. Possui 69 artigos na área de bioinformática, além de 1 capítulo de livro, 2 patentes internacionais, 7 patentes nacionais (atualmente uma está licenciada), 7 registros de software (atualmente um está licenciado) e diversas apresentações de trabalhos no Brasil e exterior. Foi homenageado no prêmio inventores Unicamp nos anos de 2015 e 2016 na categoria Tecnologia Licenciada. Participa e coordena diversos trabalhos de pesquisa na área de bioinformática, além de orientar alunos de pós-graduação, ministrar cursos de especialização e revisor de artigos científicos. Atua nas áreas de genômica/metagenômica, transcriptômica/metatranscriptômica e biologia de sistemas aplicados a leveduras, bactérias e plantas com ênfase em bioenergia e química verde, além de trabalhar com interações bióticas/abióticas em plantas de importância para o agronegócio brasileiro (cacau/doença vassoura de bruxa, eucalipto, café, soja, entre outras). (Fonte: Currículo Lattes)

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações21
Citações397
Cit./Artigo18,9
Dados do Web of Science

VIDAL, RAMON OLIVEIRA; COSTA MONDEGO, JORGE MAURICIO; POT, DAVID; AMBROSIO, ALINNE BATISTA; ANDRADE, ALAN CARVALHO; PROTASIO PEREIRA, LUIZ FILIPE; COLOMBO, CARLOS AUGUSTO; ESTEVES VIEIRA, LUIZ GONZAGA; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE. A High-Throughput Data Mining of Single Nucleotide Polymorphisms in Coffea Species Expressed Sequence Tags Suggests Differential Homeologous Gene Expression in the Allotetraploid Coffea arabica. Plant Physiology, v. 154, n. 3, p. 1053-1066, . Citações Web of Science: 45. (00/10154-5, 07/51031-2)

FRANCO CAIRO, JOAO PAULO L.; LEONARDO, FLAVIA C.; ALVAREZ, THABATA M.; RIBEIRO, DANIELA A.; BUECHLI, FERNANDA; COSTA-LEONARDO, ANA M.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; COSTA, FERNANDO F.; PAES LEME, ADRIANA F.; PEREIRA, GONCALO A. G.; et al. Functional characterization and target discovery of glycoside hydrolases from the digestome of the lower termite Coptotermes gestroi. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 4, . Citações Web of Science: 22. (10/11469-1, 08/58037-9, 06/59086-8, 08/50114-4)

LEONARDO, F. C.; DA CUNHA, A. F.; DA SILVA, M. J.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA-LEONARDO, A. M.; COSTA, F. F.; PEREIRA, G. A.. Analysis of the workers head transcriptome of the Asian subterranean termite, Coptotermes gestroi. BULLETIN OF ENTOMOLOGICAL RESEARCH, v. 101, n. 4, p. 383-391, . Citações Web of Science: 9. (06/59086-8, 08/50114-4)

MONDEGO, JORGE M. C.; VIDAL, RAMON O.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; TOKUDA, ERIC K.; PARIZZI, LUCAS P.; COSTA, GUSTAVO G. L.; PEREIRA, LUIZ F. P.; ANDRADE, ALAN C.; COLOMBO, CARLOS A.; VIEIRA, LUIZ G. E.; et al. An EST-based analysis identifies new genes and reveals distinctive gene expression features of Coffea arabica and Coffea canephora. BMC PLANT BIOLOGY, v. 11, . Citações Web of Science: 42. (07/51031-2)

ARGUESO, JUAN LUCAS; CARAZZOLLE, MARCELO F.; MIECZKOWSKI, PIOTR A.; DUARTE, FABIANA M.; NETTO, OSMAR V. C.; MISSAWA, SILVIA K.; GALZERANI, FELIPE; COSTA, GUSTAVO G. L.; VIDAL, RAMON O.; NORONHA, MELLINE F.; et al. Genome structure of a Saccharomyces cerevisiae strain widely used in bioethanol production. Genome Research, v. 19, n. 12, p. 2258-2270, . Citações Web of Science: 150. (07/58336-3)

COSTA, GUSTAVO G. L.; CABRERA, ODALYS G.; TIBURCIO, RICARDO A.; MEDRANO, FRANCISCO J.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; THOMAZELLA, DANIELA P. T.; SCHUSTER, STEPHEN C.; CARLSON, JOHN E.; GUILTINAN, MARK J.; BAILEY, BRYAN A.; et al. The mitochondrial genome of Moniliophthora roreri, the frosty pod rot pathogen of cacao. FUNGAL BIOLOGY, v. 116, n. 5, p. 551-562, . Citações Web of Science: 9. (09/50119-9)

FORMIGHIERI, EDUARDO F.; TIBURCIO, RICARDO A.; ARMAS, EDUARDO D.; MEDRANO, FRANCISCO J.; SHIMO, HUGO; CARELS, NICOLAS; GOES-NETO, ARISTOTELES; COTOMACCI, CAROLINA; CARAZZOLLE, MARCELO F.; SARDINHA-PINTO, NAIARA; et al. The mitochondrial genome of the phytopathogenic basidiomycete Moniliophthora perniciosa is 109 kb in size and contains a stable integrated plasmid. MYCOLOGICAL RESEARCH, v. 112, n. 10, p. 1136-1152, . Citações Web of Science: 40. (02/09280-1)

TEMER, BEATRIZ; DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA; NEGRI, VICTOR AUGUSTI; GALHARDO, JULIANA PIMENTEL; MELLO MAGALHAES, PEDRO HENRIQUE; JOSE, JULIANA; MARSCHALK, CIDNEI; RIBEIRO CORREA, THAMY LIVIA; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE. Conversion of an inactive xylose isomerase into a functional enzyme by co-expression of GroEL-GroES chaperonins in Saccharomyces cerevisiae. BMC Biotechnology, v. 17, . Citações Web of Science: 3. (12/05827-8)

FRANCO CAIRO, JOAO P. L.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; LEONARDO, FLAVIA C.; MOFATTO, LUCIANA S.; BRENELLI, LIVIA B.; GONCALVES, THIAGO A.; UCHIMA, CRISTIANE A.; DOMINGUES, ROMANIA R.; ALVAREZ, THABATA M.; TRAMONTINA, ROBSON; et al. Expanding the Knowledge on Lignocellulolytic and Redox Enzymes of Worker and Soldier Castes from the Lower Termite Coptotermes gestroi. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 7, . Citações Web of Science: 7. (11/20977-3, 13/03061-0, 10/11469-1, 12/19040-0, 14/10351-8, 08/50114-4, 14/50371-8, 06/59086-8, 15/06971-3, 14/20576-7, 08/58037-9)

LOPEZ MOLANO, EDDY PATRICIA; CABRERA, ODALYS GARCIA; JOSE, JULIANA; DO NASCIMENTO, LEANDRO COSTA; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; PEREIRA LIMA TEIXEIRA, PAULO JOSE; CORREA ALVAREZ, JAVIER; TIBURCIO, RICARDO AUGUSTO; TOKIMATU FILHO, PAULO MASSANARI; ALVARES DE LIMA, GUSTAVO MACHADO; et al. Ceratocystis cacaofunesta genome analysis reveals a large expansion of extracellular phosphatidylinositol-specific phospholipase-C genes (PI-PLC). BMC Genomics, v. 19, . Citações Web of Science: 3. (09/50119-9, 09/18467-7, 13/08293-7)

BEZERRA DE MELLO, FELLIPE DA SILVEIRA; VENEGA CORADINI, ALESSANDRO LUIS; GALVAO TIZEI, PEDRO AUGUSTO; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE; TEIXEIRA, GLEIDSON SILVA. Static microplate fermentation and automated growth analysis approaches identified a highly-aldehyde resistant Saccharomyces cerevisiae strain. BIOMASS & BIOENERGY, v. 120, p. 49-58, . Citações Web of Science: 2. (15/06677-8, 16/02506-7, 14/26719-4)

DA SILVA, DESIREE S.; DANTZGER, MIRIAM; ASSIS, MICHELLE A.; GALLARDO, JESSICA C. M.; TEIXEIRA, GLEIDSON S.; MISSAWA, SILVIA K.; DOMINGUES, ROMENIA R.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; LUNARDI, INES; LEME, ADRIANA F. P.; et al. Lignocellulolytic characterization and comparative secretome analysis of a Trichoderma erinaceum strain isolated from decaying sugarcane straw. FUNGAL BIOLOGY, v. 123, n. 4, p. 330-340, . Citações Web of Science: 0. (16/02792-0)

BARSOTTINI, MARIO R. O.; PIRES, BARBARA A.; VIEIRA, MARIA L.; PEREIRA, JOSE G. C.; COSTA, PAULO C. S.; SANITA, JAQUELINE; CORADINI, ALESSANDRO; MELLO, FELLIPE; MARSCHALK, CIDNEI; SILVA, EDER M.; et al. Synthesis and testing of novel alternative oxidase (AOX) inhibitors with antifungal activity against Moniliophthora perniciosa (Stahel), the causal agent of witches' broom disease of cocoa, and other phytopathogens. Pest Management Science, v. 75, n. 5, p. 1295-1303, . Citações Web of Science: 0. (17/17000-4, 15/09870-3, 16/10498-4, 15/06677-8, 15/07653-5, 14/15339-6)

DE CARVALHO, L. M.; BORELLI, G.; CAMARGO, A. P.; DE ASSIS, M. A.; DE FERRAZ, S. M. F.; FIAMENGHI, M. B.; JOSE, J.; MOFATTO, L. S.; NAGAMATSU, S. T.; PERSINOTI, G. F.; et al. Bioinformatics applied to biotechnology: A review towards bioenergy research. BIOMASS & BIOENERGY, v. 123, p. 195-224, . Citações Web of Science: 0. (16/02792-0, 14/26905-2, 16/05379-6, 13/08293-7, 15/06263-9, 17/13015-7, 17/07008-8)

NAGAMATSU, SHEILA TIEMI; TEIXEIRA, GLEIDSON SILVA; BEZERRA DE MELLO, FELLIPE DA SILVEIRA; GALVAO TIZEI, PEDRO AUGUSTO; GRICHOSWSKI NAKAGAWA, BRUNA TATSUE; DE CARVALHO, LUCAS MIGUEL; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA. Genome Assembly of a Highly Aldehyde-Resistant Saccharomyces cerevisiae SA1-Derived Industrial Strain. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 8, n. 13, . Citações Web of Science: 0. (15/06677-8, 14/26905-2, 16/02506-7, 13/08293-7, 15/06263-9)

BAZZO, BARBARA REGINA; DE CARVALHO, LUCAS MIGUEL; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; GUIMARAES PEREIRA, GONCALO AMARANTE; COLOMBO, CARLOS AUGUSTO. Development of novel EST-SSR markers in the macauba palm (Acrocomia aculeata) using transcriptome sequencing and cross-species transferability in Arecaceae species. BMC PLANT BIOLOGY, v. 18, . Citações Web of Science: 0. (14/07265-2, 13/08293-7)

SALAZAR, MARCELA MENDES; NASCIMENTO, LEANDRO COSTA; OLIVEIRA CAMARGO, EDUARDO LEAL; GONCALVES, DANIELI CRISTINA; NETO, JORGE LEPIKSON; MARQUES, WESLEY LEORICY; PEREIRA LIMA TEIXEIRA, PAULO JOSE; MIECZKOWSKI, PIOTR; COSTA MONDEGO, JORGE MAURICIO; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; et al. Xylem transcription profiles indicate potential metabolic responses for economically relevant characteristics of Eucalyptus species. BMC Genomics, v. 14, . Citações Web of Science: 18. (07/54877-0)

AMBROSIO, ALINNE BATISTA; DO NASCIMENTO, LEANDRO COSTA; OLIVEIRA, BRUNO V.; TEIXEIRA, PAULO JOSE P. L.; TIBURCIO, RICARDO A.; TOLEDO THOMAZELLA, DANIELA P.; LEME, ADRIANA F. P.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; VIDAL, RAMON O.; MIECZKOWSKI, PIOTR; et al. Global analyses of Ceratocystis cacaofunesta mitochondria: from genome to proteome. BMC Genomics, v. 14, . Citações Web of Science: 7. (09/50119-9)

CARVALHO-NETTO, OSMAR V.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; MOFATTO, LUCIANA S.; TEIXEIRA, PAULO J. P. L.; NORONHA, MELLINE F.; CALDERON, LUIGE A. L.; MIECZKOWSKI, PIOTR A.; ARGUESO, JUAN LUCAS; PEREIRA, GONCALO A. G.. Saccharomyces cerevisiae transcriptional reprograming due to bacterial contamination during industrial scale bioethanol production. Microbial Cell Factories, v. 14, . Citações Web of Science: 22. (08/51500-5)

FRANCO, SULAMITA DE FREITAS; BARONI, RENATA MORO; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; PEREIRA LIMA TEIXEIRA, PAULO JOSE; REIS, OSVALDO; GUIMARDES PEREIRA, GONCALO AMARANTE; COSTA MONDEGO, JORGE MAURICIO. Genomic analyses and expression evaluation of thaumatin-like gene family in the cacao fungal pathogen Moniliophthora perniciosa. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 466, n. 4, p. 629-636, . Citações Web of Science: 7. (09/50119-9, 09/50810-3, 10/52636-8)

OLIVEIRA CAMARGO, EDUARDO LEAL; NASCIMENTO, LEANDRO COSTA; SOLER, MARCAL; SALAZAR, MARCELA MENDES; LEPIKSON-NETO, JORGE; MARQUES, WESLEY LEORICY; ALVES, ANA; PEREIRA LIMA TEIXEIRA, PAULO JOSE; MIECZKOWSKI, PIOTR; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; et al. Contrasting nitrogen fertilization treatments impact xylem gene expression and secondary cell wall lignification in Eucalyptus. BMC PLANT BIOLOGY, v. 14, . Citações Web of Science: 11. (08/53520-3, 13/08293-7)

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