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Desenho de diferentes fragmentos da proteína de superfície, spike, do SARS-CoV-2, para desenvolvimento de testes rápidos e de vacina

Processo: 20/04680-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2020
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho
Beneficiário:Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho
Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:17/17303-7 - Estrutura e função de sistemas de secreção bacterianas, AP.TEM
Auxílio(s) vinculado(s):22/05691-0 - Análise da dinâmica molecular das variantes do coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave de rápida disseminação e seus efeitos na interação com a enzima de conversão da angiotensina humana 2, PUB.ART
Assunto(s):COVID-19  SARS-CoV-2  Infecções por Coronavirus  Proteínas da membrana  Glicoproteína da espícula de Coronavirus  Anticorpos  Desenvolvimento de vacinas  Vacinas contra COVID-19  Expressão gênica  Biologia estrutural  Pandemias  Controle de doenças transmissíveis 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:anticorpo | proteína | teste rápido | Vacina | Biologia de macromoléculas e biologia estrutural

Resumo

Nosso grupo de pesquisa em colaboração com o pesquisador Dr. Edison Durigon do ICB USP, estamos desenvolvendo teste rápido para detectar COVID-19. Para isso, nós já conseguimos clonar e expressar 4 fragmentos da proteína de superfície do SARS-CoV-2 e mostramos ser imonogênicos contra o soro de um paciente humano. Para a produção do teste rápido, as proteínas foram produzidas em larga escala para inocular em três animais (rato, coelho e cabra). Iniciamos as inoculações de três proteínas em ratos, cabra e coelho. A previsão é que em 21 dias tenhamos bastante soro para produzir os primeiros testes rápidos. Devido à demanda e à urgência na produção destes fragmentos do spike, estou coordenando um mutirão que envolve também o Prof. Shaker Chuck Farah para produzir os 4 fragmentos de spike em grande quantidade tanto para continuar as inoculações nos animais quanto para fazer outros testes. Também já mandamos sintetizar novos oligos para construção de mais 4 fragmentos da proteína spike do vírus para tentar obter proteínas solúveis para desenvolvimento de vacinas, essa parte do projeto será feita em colaboração com o Prof. Durigon e com a Profa. Ana Marcia também do ICB USP. (AU)

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Publicações científicas (14)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Quantitative structure-activity relationships, molecular docking and molecular dynamics simulations reveal drug repurposing candidates as potent SARS-CoV-2 main protease inhibitors. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, v. 40, n. 21, p. 18-pg., . (19/00195-2, 16/09047-8, 20/04680-0)
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MACHADO, RAFAEL R. G.; GLASER, TALITA; ARAUJO, DANIELLE B.; PETIZ, LYVIA LINTZMAIER; OLIVEIRA, DANIELLE B. L.; DURIGON, GIULIANA S.; LEAL, ALESSANDRA L.; PINHO, JOAO RENATO R.; FERREIRA, LUIS C. S.; ULRICH, HENNING; et al. Inhibition of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Replication by Hypertonic Saline Solution in Lung and Kidney Epithelial Cells. ACS PHARMACOLOGY & TRANSLATIONAL SCIENCE, v. 4, n. 5, p. 1514-1527, . (20/06409-1, 19/00195-2, 18/07366-4, 17/24769-2, 16/20045-7, 20/04680-0)
SILVA, EVERIDIENE K. V. B.; BOMFIM, CAMILA G.; BARBOSA, ANA P.; NODA, PALOMA; NORONHA, IRENE L.; FERNANDES, BIANCA H. V.; MACHADO, RAFAEL R. G.; DURIGON, EDISON L.; CATANOZI, SERGIO; RODRIGUES, LETICIA G.; et al. Immunization with SARS-CoV-2 Nucleocapsid protein triggers a pulmonary immune response in rats. PLoS One, v. 17, n. 5, p. 17-pg., . (19/21739-0, 19/19939-1, 19/00195-2, 18/20403-6, 20/04680-0)
AMORIM, VITOR MARTINS DE FREITAS; SOARES, EDUARDO PEREIRA; FERRARI, ANIELLE SALVIANO DE ALMEIDA; MERIGHI, DAVI GABRIEL SALUSTIANO; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES; DE SOUZA, ANACLETO SILVA. 3-Chymotrypsin-like Protease (3CLpro) of SARS-CoV-2: Validation as a Molecular Target, Proposal of a Novel Catalytic Mechanism, and Inhibitors in Preclinical and Clinical Trials. Viruses-Basel, v. 16, n. 6, p. 22-pg., . (21/10577-0, 22/08730-7, 19/00195-2, 21/00070-5, 23/13894-1, 16/09047-8, 20/04680-0)
VENTURA FERNANDES, BIANCA H.; FEITOSA, NATALIA MARTINS; BARBOSA, ANA PAULA; BOMFIM, CAMILA GASQUE; GARNIQUE, ANALI M. B.; ROSA, IVANA F.; RODRIGUES, MAIRA S.; DORETTO, LUCAS B.; COSTA, DANIEL F.; CAMARGO-DOS-SANTOS, BRUNO; et al. oxicity of spike fragments SARS-CoV-2 S protein for zebrafish: A tool to study its hazardous for human health. Science of The Total Environment, v. 813, . (19/00195-2, 18/07098-0, 20/05761-3, 17/17303-7, 20/04680-0, 14/04294-1, 19/21739-0, 19/19939-1, 19/18356-2, 19/14285-3, 19/12234-2)
DANIELLE BASTOS ARAUJO; RAFAEL RAHAL GUARAGNA MACHADO; DEYVID EMANUEL AMGARTEN; FERNANDA DE MELLO MALTA; GABRIEL GUARANY DE ARAUJO; CAIRO OLIVEIRA MONTEIRO; ERIKA DONIZETTI CANDIDO; CAMILA PEREIRA SOARES; FERNANDO GATTI DE MENEZES; ANA CAROLINA CORNACHIONI PIRES; et al. SARS-CoV-2 isolation from the first reported patients in Brazil and establishment of a coordinated task network. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 115, . (20/06409-1, 18/23680-0, 17/24769-2, 20/04680-0, 16/20045-7, 17/25123-9, 18/21076-9)
DE SOUZA, ANACLETO SILVA; AMORIM, VITOR MARTINS DE FREITAS; GUARDIA, GABRIELA D. A.; DOS SANTOS, FELIPE R. C.; DOS SANTOS, FILIPE F.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; JUVENAL, GUILHERME DE ARAUJO; HUANG, YIHUA; GE, PINGJU; JIANG, YINAN; et al. Molecular Dynamics Analysis of Fast-Spreading Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants and Their Effects on the Interaction with Human Angiotensin-Converting Enzyme 2. ACS OMEGA, v. 7, n. 35, p. 10-pg., . (20/06091-1, 17/18246-7, 17/19541-2, 20/04680-0, 19/00195-2, 16/09047-8, 18/15579-8, 18/07366-4, 20/14158-9)
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DE ALMEIDA, MICHELLE TEIXEIRA; BARBOSA, ANA PAULA; BOMFIM, CAMILA GASQUE; VISNARDI, ALINE BIAZOLA; VINCES, TANIA CHURASACARI; CERONI, ALEXANDRE; DURIGON, EDISON LUIZ; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Obtaining a high titer of polyclonal antibodies from rats to the SARS-CoV-2 nucleocapsid protein and its N- and C-terminal domains for diagnostic test development. JOURNAL OF IMMUNOLOGICAL METHODS, v. 522, p. 9-pg., . (21/10577-0, 19/21739-0, 22/08730-7, 20/14914-8, 19/00195-2, 16/09047-8, 20/04680-0)
DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE FREITAS AMORIM, VITOR MARTINS; GUARDIA, GABRIELA D. A.; DOS SANTOS, FILIPE F.; ULRICH, HENNING; GALANTE, PEDRO A. F.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants of Concern: A Perspective for Emerging More Transmissible and Vaccine-Resistant Strains. Viruses-Basel, v. 14, n. 4, p. 21-pg., . (18/07366-4, 20/06091-1, 19/00195-2, 16/09047-8, 20/14158-9, 20/04680-0, 17/18246-7, 17/19541-2, 18/15579-8)
DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Cooperative and structural relationships of the trimeric Spike with infectivity and antibody escape of the strains Delta (B.1.617.2) and Omicron (BA.2, BA.5, and BQ.1). Journal of Computer-Aided Molecular Design, v. 37, n. 12, p. 22-pg., . (21/10577-0, 19/00195-2, 21/00070-5, 16/09047-8, 20/04680-0)
VISNARDI, ALINE BIAZOLA; RIBEIRO, RODOLFO ALVARENGA; DE SOUZA, ANACLETO SILVA; VINCES, TANIA GERALDINE CHURASACARI; LLONTOP, EDGAR E.; FERRARI, ANIELLE SALVIANO DE ALMEIDA; HENRIQUE, PEDRO ANTONIO FRANCA; VALDIVIESO, DANIELA; SANCHEZ-LIMACHE, DANIEL ENRIQUE; SILVA, GABRIELA ROBERTO; et al. Insertion of a Divergent GAF-like Domain Defines a Novel Family of YcgR Homologues That Bind c-di-GMP in Leptospirales. ACS OMEGA, v. 10, n. 4, p. 19-pg., . (20/04680-0, 19/00195-2, 21/05262-0, 21/00070-5, 21/10577-0, 17/17303-7, 23/10432-7, 17/06394-1, 16/09047-8, 23/18211-0, 22/08730-7)
VINCES, TANIA CHURASACARI; DE SOUZA, ANACLETO SILVA; CARVALHO, CECILIA F.; VISNARDI, ALINE BIAZOLA; TEIXEIRA, RAPHAEL D.; LLONTOP, EDGAR E.; BISMARA, BEATRIZ APARECIDA PASSOS; VICENTE, ELISABETE J.; PEREIRA, JOSE O.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; et al. Monomeric Esterase: Insights into Cooperative Behavior, Hysteresis/Allokairy. BIOCHEMISTRY, v. 63, n. 9, p. 16-pg., . (21/10577-0, 19/12234-2, 22/08730-7, 21/05262-0, 19/00195-2, 17/17303-7, 20/04680-0)